RNA id: TCONS_00062205


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00062205
length 219
RNA type mRNA
GC content 0.50
exon number 2
gene id XLOC_031742
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 369991 ~ 375101 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

atgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctgcaggtaCGAGTGGCAGGGAAAGATCGAGGAGGACAATGAAGTTCTGCTGAAtaacgaatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtagctCCAATCATCCCTATGAAGTGGCCGAGGTCATCAGTTTGCCCATTGATCAGGGAAATCCTCCGTATCTGAAGTGGATTGGTGACGTCGTGCCGGAGTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190663

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064768 lncRNA downstream 70659 445633 ~ 453037 (+) False XLOC_031744
TCONS_00064767 lncRNA downstream 70659 445633 ~ 453037 (+) True XLOC_031744
TCONS_00062212 lncRNA downstream 219326 594300 ~ 597161 (+) True XLOC_031747
TCONS_00064769 lncRNA downstream 584283 959257 ~ 960829 (+) True XLOC_031750
TCONS_00064770 lncRNA downstream 688964 1063938 ~ 1065154 (+) False XLOC_031751
TCONS_00062204 mRNA upstream 27775 296130 ~ 342216 (+) True XLOC_031741
TCONS_00062203 mRNA upstream 97437 269204 ~ 272554 (+) True XLOC_031740
TCONS_00062202 mRNA upstream 101173 264927 ~ 268818 (+) True XLOC_031739
TCONS_00062201 mRNA upstream 164700 202367 ~ 205291 (+) True XLOC_031738
TCONS_00062200 mRNA upstream 184694 181142 ~ 185297 (+) True XLOC_031737
TCONS_00062207 mRNA downstream 17841 392815 ~ 409768 (+) True XLOC_031743
TCONS_00062208 mRNA downstream 100290 475264 ~ 504283 (+) True XLOC_031745
TCONS_00062209 mRNA downstream 140207 515181 ~ 533548 (+) False XLOC_031746
TCONS_00062210 mRNA downstream 144005 518979 ~ 543693 (+) True XLOC_031746
TCONS_00062211 mRNA downstream 209658 584632 ~ 598165 (+) False XLOC_031747
TCONS_00062191 other upstream 265269 103361 ~ 104722 (+) False XLOC_031731
TCONS_00062246 other downstream 2790634 3165608 ~ 3165722 (+) True XLOC_031773
TCONS_00062248 other downstream 2843389 3218363 ~ 3249470 (+) True XLOC_031772
TCONS_00062273 other downstream 3452803 3827777 ~ 3838228 (+) False XLOC_031788
TCONS_00062276 other downstream 3459468 3834442 ~ 3850242 (+) True XLOC_031788
TCONS_00062297 other downstream 5309207 5684181 ~ 5684295 (+) True XLOC_031803

Expression Profile

//