RNA id: TCONS_00062300



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062300
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_031807
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 6215794 ~ 6215910 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


agccacagccatatcaccctgcagcccaagaccggttactgaCTGAAGCTAAGCATTGCTGAGCCAgctcagtacctggatgggagaccacatggaaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182943

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064803 lncRNA upstream 129662 6085236 ~ 6086132 (+) True XLOC_031805
TCONS_00064802 lncRNA upstream 233936 5938465 ~ 5981858 (+) False XLOC_031804
TCONS_00064801 lncRNA upstream 234435 5938465 ~ 5981359 (+) False XLOC_031804
TCONS_00062298 lncRNA upstream 253839 5938477 ~ 5961955 (+) True XLOC_031804
TCONS_00064600 lncRNA upstream 816350 5198269 ~ 5399444 (+) True XLOC_031802
TCONS_00062303 lncRNA downstream 54965 6270875 ~ 6273517 (+) False XLOC_031808
TCONS_00062304 lncRNA downstream 55883 6271793 ~ 6273517 (+) False XLOC_031808
TCONS_00064804 lncRNA downstream 503006 6718916 ~ 6741408 (+) True XLOC_031811
TCONS_00062311 lncRNA downstream 570728 6786638 ~ 6787082 (+) False XLOC_031812
TCONS_00064805 lncRNA downstream 570728 6786638 ~ 6788943 (+) False XLOC_031812
TCONS_00062295 mRNA upstream 1231551 4872883 ~ 4984243 (+) False XLOC_031801
TCONS_00062294 mRNA upstream 1231551 4872883 ~ 4984243 (+) False XLOC_031801
TCONS_00062296 mRNA upstream 1338618 4872888 ~ 4877176 (+) True XLOC_031801
TCONS_00062293 mRNA upstream 1672789 4539953 ~ 4543005 (+) True XLOC_031800
TCONS_00062292 mRNA upstream 1679456 4528631 ~ 4536338 (+) True XLOC_031799
TCONS_00062301 mRNA downstream 54776 6270686 ~ 6273519 (+) False XLOC_031808
TCONS_00062302 mRNA downstream 54822 6270732 ~ 6273516 (+) False XLOC_031808
TCONS_00062306 mRNA downstream 275103 6491013 ~ 6541519 (+) True XLOC_031809
TCONS_00062307 mRNA downstream 446569 6662479 ~ 6666426 (+) True XLOC_031810
TCONS_00062308 mRNA downstream 563204 6779114 ~ 6795988 (+) False XLOC_031812
TCONS_00062297 other upstream 531499 5684181 ~ 5684295 (+) True XLOC_031803
TCONS_00062276 other upstream 2365552 3834442 ~ 3850242 (+) True XLOC_031788
TCONS_00062273 other upstream 2377566 3827777 ~ 3838228 (+) False XLOC_031788
TCONS_00062248 other upstream 2966324 3218363 ~ 3249470 (+) True XLOC_031772
TCONS_00062246 other upstream 3050072 3165608 ~ 3165722 (+) True XLOC_031773
TCONS_00062305 other downstream 55957 6271867 ~ 6273477 (+) True XLOC_031808
TCONS_00062321 other downstream 616136 6832046 ~ 6832621 (+) True XLOC_031815
TCONS_00062324 other downstream 664017 6879927 ~ 6880049 (+) True XLOC_031817
TCONS_00062341 other downstream 1237445 7453355 ~ 7453831 (+) True XLOC_031828
TCONS_00062343 other downstream 1250363 7466273 ~ 7472497 (+) False XLOC_031829

Expression Profile


//