RNA id: TCONS_00070324



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00070324
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_035868
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 38430563 ~ 38430679 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATTATcagtcatatcaccctgcagcccaagacggGTTATTTACTGAAGcaaagcagggctgagcctggtaaGTACCTGCATGAGAGACTACATGTGAAaattaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175536

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072246 lncRNA upstream 646522 37782032 ~ 37784041 (+) True XLOC_035865
TCONS_00072245 lncRNA upstream 1057765 37370464 ~ 37372798 (+) False XLOC_035855
TCONS_00070307 lncRNA upstream 1057765 37370860 ~ 37372798 (+) True XLOC_035855
TCONS_00070305 lncRNA upstream 1297641 37130618 ~ 37132922 (+) True XLOC_035852
TCONS_00070302 lncRNA upstream 1435287 36992272 ~ 36995276 (+) True XLOC_035851
TCONS_00072247 lncRNA downstream 189069 38619748 ~ 38620264 (+) True XLOC_035870
TCONS_00070327 lncRNA downstream 561149 38991828 ~ 38992697 (+) False XLOC_035872
TCONS_00070328 lncRNA downstream 561149 38991828 ~ 39002148 (+) True XLOC_035872
TCONS_00071958 lncRNA downstream 626209 39056888 ~ 39058948 (+) False XLOC_035873
TCONS_00071959 lncRNA downstream 626742 39057421 ~ 39058948 (+) True XLOC_035873
TCONS_00070322 mRNA upstream 10916 38415374 ~ 38419647 (+) False XLOC_035867
TCONS_00070323 mRNA upstream 12525 38417461 ~ 38418038 (+) True XLOC_035867
TCONS_00070321 mRNA upstream 480369 37919144 ~ 37950194 (+) True XLOC_035866
TCONS_00070320 mRNA upstream 481785 37905666 ~ 37948778 (+) False XLOC_035866
TCONS_00070318 mRNA upstream 658413 37755099 ~ 37772150 (+) False XLOC_035864
TCONS_00070325 mRNA downstream 134263 38564942 ~ 38573105 (+) True XLOC_035869
TCONS_00070331 mRNA downstream 1081253 39511932 ~ 39578792 (+) False XLOC_035876
TCONS_00070332 mRNA downstream 1139936 39570615 ~ 39575515 (+) True XLOC_035876
TCONS_00070333 mRNA downstream 1176787 39607466 ~ 39647216 (+) False XLOC_035877
TCONS_00070335 mRNA downstream 1188408 39619087 ~ 39643788 (+) False XLOC_035877
TCONS_00070313 other upstream 809893 37620554 ~ 37620670 (+) True XLOC_035861
TCONS_00070311 other upstream 914809 37514822 ~ 37515754 (+) True XLOC_035859
TCONS_00070308 other upstream 1047332 37383101 ~ 37383231 (+) True XLOC_035856
TCONS_00070304 other upstream 1304323 37126124 ~ 37126240 (+) True XLOC_035853
TCONS_00070286 other upstream 1900515 36529691 ~ 36530048 (+) True XLOC_035846
TCONS_00070326 other downstream 491638 38922317 ~ 38922926 (+) True XLOC_035871
TCONS_00070347 other downstream 1372103 39802782 ~ 39816165 (+) True XLOC_035884
TCONS_00070348 other downstream 1375635 39806314 ~ 39806430 (+) True XLOC_035885
TCONS_00070362 other downstream 2502043 40932722 ~ 40932838 (+) True XLOC_035897
TCONS_00070370 other downstream 2904391 41335070 ~ 41335184 (+) True XLOC_035902