RNA id: TCONS_00070370


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00070370
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_035902
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 41335070 ~ 41335184 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTAGCAGCTGGCTCTCAGCAACTCTCGCATGGTCGCCtgctaaagctaagcagggctgcccccggtcagtacctggatggaagaccacatgggaaagttaggttactgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185355

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00071960 lncRNA upstream 368282 40966528 ~ 40966788 (+) True XLOC_035898
TCONS_00072252 lncRNA upstream 744279 40578303 ~ 40590791 (+) True XLOC_035894
TCONS_00072251 lncRNA upstream 796858 40534996 ~ 40538212 (+) True XLOC_035893
TCONS_00070358 lncRNA upstream 808672 40502765 ~ 40526398 (+) True XLOC_035892
TCONS_00072249 lncRNA upstream 1491100 39830606 ~ 39843970 (+) False XLOC_035886
TCONS_00072253 lncRNA downstream 118434 41453618 ~ 41455928 (+) False XLOC_035904
TCONS_00070373 lncRNA downstream 170406 41505590 ~ 41519281 (+) True XLOC_035905
TCONS_00072254 lncRNA downstream 235748 41570932 ~ 41574534 (+) False XLOC_035907
TCONS_00070375 lncRNA downstream 235846 41571030 ~ 41574534 (+) True XLOC_035907
TCONS_00071961 lncRNA downstream 459609 41794793 ~ 41805558 (+) True XLOC_035911
TCONS_00070367 mRNA upstream 78541 41229233 ~ 41256529 (+) False XLOC_035900
TCONS_00070368 mRNA upstream 79212 41238064 ~ 41255858 (+) True XLOC_035900
TCONS_00070363 mRNA upstream 161701 41035230 ~ 41173369 (+) False XLOC_035899
TCONS_00070364 mRNA upstream 161701 41037541 ~ 41173369 (+) False XLOC_035899
TCONS_00070365 mRNA upstream 162130 41038141 ~ 41172940 (+) False XLOC_035899
TCONS_00070371 mRNA downstream 78735 41413919 ~ 41440689 (+) True XLOC_035903
TCONS_00070372 mRNA downstream 118507 41453691 ~ 41462732 (+) True XLOC_035904
TCONS_00070374 mRNA downstream 198084 41533268 ~ 41610205 (+) True XLOC_035906
TCONS_00070376 mRNA downstream 312355 41647539 ~ 41650919 (+) False XLOC_035908
TCONS_00070377 mRNA downstream 312376 41647560 ~ 41650691 (+) False XLOC_035908
TCONS_00070362 other upstream 402232 40932722 ~ 40932838 (+) True XLOC_035897
TCONS_00070347 other upstream 1518905 39802782 ~ 39816165 (+) True XLOC_035884
TCONS_00070348 other upstream 1528640 39806314 ~ 39806430 (+) True XLOC_035885
TCONS_00070326 other upstream 2412144 38922317 ~ 38922926 (+) True XLOC_035871
TCONS_00070324 other upstream 2904391 38430563 ~ 38430679 (+) True XLOC_035868
TCONS_00070379 other downstream 375175 41710359 ~ 41714766 (+) True XLOC_035909
TCONS_00070381 other downstream 652166 41987350 ~ 41988113 (+) True XLOC_035912
TCONS_00070385 other downstream 1296448 42631632 ~ 42636013 (+) True XLOC_035914
TCONS_00070387 other downstream 1381820 42717004 ~ 42723824 (+) False XLOC_035915
TCONS_00070392 other downstream 1429050 42764234 ~ 42907824 (+) False XLOC_035916