RNA id: TCONS_00073048


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073048
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_037108
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 22576945 ~ 22577059 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

accggcagctagctctctgcatctttcacatggttgcccactgacgctaagcagggctgtgcccggtcagtacctagatggctgaccacatgggaaagctagggtGCTGccagga

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184825

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073038 lncRNA upstream 216203 22359962 ~ 22360742 (+) True XLOC_037106
TCONS_00075101 lncRNA upstream 263328 22312733 ~ 22313617 (+) False XLOC_037104
TCONS_00075102 lncRNA upstream 263328 22312895 ~ 22313617 (+) False XLOC_037104
TCONS_00075103 lncRNA upstream 263328 22312929 ~ 22313617 (+) True XLOC_037104
TCONS_00073027 lncRNA upstream 583054 21993188 ~ 21993891 (+) True XLOC_037097
TCONS_00074896 lncRNA downstream 65327 22642386 ~ 22642685 (+) True XLOC_037110
TCONS_00073062 lncRNA downstream 118574 22695633 ~ 22697854 (+) True XLOC_037112
TCONS_00075104 lncRNA downstream 411882 22988941 ~ 22998060 (+) True XLOC_037116
TCONS_00073069 lncRNA downstream 426817 23003876 ~ 23004450 (+) False XLOC_037117
TCONS_00075105 lncRNA downstream 426817 23003876 ~ 23006978 (+) False XLOC_037117
TCONS_00073046 mRNA upstream 101503 22466218 ~ 22475442 (+) False XLOC_037107
TCONS_00073039 mRNA upstream 210650 22364997 ~ 22366295 (+) False XLOC_037105
TCONS_00073040 mRNA upstream 210703 22365055 ~ 22366242 (+) True XLOC_037105
TCONS_00073036 mRNA upstream 210766 22351443 ~ 22366179 (+) False XLOC_037105
TCONS_00073037 mRNA upstream 216203 22359919 ~ 22360742 (+) False XLOC_037106
TCONS_00073049 mRNA downstream 54613 22631672 ~ 22649297 (+) False XLOC_037109
TCONS_00073050 mRNA downstream 54728 22631787 ~ 22649021 (+) False XLOC_037109
TCONS_00073051 mRNA downstream 54794 22631853 ~ 22637089 (+) False XLOC_037109
TCONS_00073052 mRNA downstream 55067 22632126 ~ 22636747 (+) False XLOC_037109
TCONS_00073053 mRNA downstream 57014 22634073 ~ 22647466 (+) True XLOC_037109
TCONS_00073045 other upstream 129367 22391566 ~ 22447578 (+) False XLOC_037107
TCONS_00073026 other upstream 583030 21993128 ~ 21993915 (+) False XLOC_037097
TCONS_00073021 other upstream 585733 21990058 ~ 21991212 (+) False XLOC_037096
TCONS_00073020 other upstream 590949 21984109 ~ 21985996 (+) True XLOC_037095
TCONS_00073007 other upstream 864799 21571433 ~ 21712146 (+) False XLOC_037087
TCONS_00073057 other downstream 81170 22658229 ~ 22662728 (+) True XLOC_037111
TCONS_00073071 other downstream 429392 23006451 ~ 23006978 (+) True XLOC_037117
TCONS_00073073 other downstream 469208 23046267 ~ 23046385 (+) True XLOC_037119
TCONS_00073080 other downstream 787183 23364242 ~ 23367209 (+) False XLOC_037128
TCONS_00073088 other downstream 970586 23547645 ~ 23555977 (+) True XLOC_037129