RNA id: TCONS_00073073



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073073
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_037119
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 23046267 ~ 23046385 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCTGTCAGCCTGCTCCCTGCAACTCTCACATTGtcgtccactgaagctaagcagggctgcgcctggtcagtacctgaatgggatgAAGACCTCATGGGAAAGCTggattgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120452

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075105 lncRNA upstream 39289 23003876 ~ 23006978 (+) False XLOC_037117
TCONS_00073070 lncRNA upstream 39601 23003936 ~ 23006666 (+) False XLOC_037117
TCONS_00073069 lncRNA upstream 41817 23003876 ~ 23004450 (+) False XLOC_037117
TCONS_00075104 lncRNA upstream 48207 22988941 ~ 22998060 (+) True XLOC_037116
TCONS_00073062 lncRNA upstream 348413 22695633 ~ 22697854 (+) True XLOC_037112
TCONS_00074897 lncRNA downstream 79771 23126156 ~ 23128231 (+) False XLOC_037122
TCONS_00074898 lncRNA downstream 80158 23126543 ~ 23127995 (+) True XLOC_037122
TCONS_00074899 lncRNA downstream 275449 23321834 ~ 23333979 (+) True XLOC_037126
TCONS_00075106 lncRNA downstream 317463 23363848 ~ 23419530 (+) False XLOC_037127
TCONS_00075107 lncRNA downstream 317469 23363854 ~ 23456345 (+) False XLOC_037127
TCONS_00073072 mRNA upstream 22979 23009608 ~ 23023288 (+) True XLOC_037118
TCONS_00073068 mRNA upstream 38326 23003208 ~ 23007941 (+) False XLOC_037117
TCONS_00073067 mRNA upstream 106757 22929675 ~ 22939510 (+) True XLOC_037115
TCONS_00073065 mRNA upstream 244095 22781019 ~ 22802172 (+) False XLOC_037114
TCONS_00073066 mRNA upstream 244095 22782027 ~ 22802172 (+) True XLOC_037114
TCONS_00073074 mRNA downstream 3115 23049500 ~ 23056240 (+) True XLOC_037120
TCONS_00073075 mRNA downstream 77867 23124252 ~ 23162384 (+) True XLOC_037121
TCONS_00073076 mRNA downstream 178376 23224761 ~ 23231203 (+) True XLOC_037123
TCONS_00073077 mRNA downstream 186516 23232901 ~ 23234064 (+) True XLOC_037124
TCONS_00073079 mRNA downstream 209025 23255410 ~ 23313342 (+) False XLOC_037125
TCONS_00073071 other upstream 39289 23006451 ~ 23006978 (+) True XLOC_037117
TCONS_00073057 other upstream 383539 22658229 ~ 22662728 (+) True XLOC_037111
TCONS_00073048 other upstream 469208 22576945 ~ 22577059 (+) True XLOC_037108
TCONS_00073045 other upstream 598689 22391566 ~ 22447578 (+) False XLOC_037107
TCONS_00073026 other upstream 1052352 21993128 ~ 21993915 (+) False XLOC_037097
TCONS_00073080 other downstream 317857 23364242 ~ 23367209 (+) False XLOC_037128
TCONS_00073088 other downstream 501260 23547645 ~ 23555977 (+) True XLOC_037129
TCONS_00073090 other downstream 650539 23696924 ~ 23700456 (+) True XLOC_037131
TCONS_00073100 other downstream 839258 23885643 ~ 23886737 (+) True XLOC_037136
TCONS_00073118 other downstream 1044522 24090907 ~ 24102291 (+) False XLOC_037141