RNA id: TCONS_00073090



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073090
length 765
RNA type processed_transcript
GC content 0.46
exon number 4
gene id XLOC_037131
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 23696924 ~ 23700456 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CACATCACCTTCTATAACATCTTGCAGTGACAGTGGATACTTTGCTACCATTTTCTTCGCAACCTCTGTGGAGGATTGTTTACCAGGAGAAGAAGAGGCATGCATCATTTCAGCAACTACAATTCGGATCATTTCTCTGCGTAACTTTGAGCTTGGCCTTTTCCCTCTCTCCAAACTCTGCATTAAGGCTTCTGGGAGCTTCTCCCATGGAATCTGGAAGCTGTCGACCCAATCTGCAGTAGCAATCATGTGTCTGGGTGATGGTGAGGGTGAGGGTGAGGAAGACAGTGAGACTGAGGAGCACGCTGAGGACACTTGAGAGGTCAATGTTGACTGACTATGGAATTCAGTTGTCTCTGTGGATTGTTTCCATGCAGCCAACAGTTTTCTAGCTTGAACTGGTCTCAGTACTGTGAGCAGATCAGCTTCcttaatatactgtaaatcttCAGTGGCTCCCACACCTAAAGATTGTAATGTCTCCAATACAATATTTAGATTTGAGGTTGGTAGGTCTGGTAACACATTAGTAATGGCACTGCTTATGTTGCTTGGCTCTACGTCATCCATTCTGAATTTTACTCCTTCCACGTCTTGTGCTCCTTCTGCTTGGATGCGGTCAATTGCTGAGTTATAGTTTTGAATTGTCCGGGCTGGTCCACACAGATTTGGATCACCCTCGTTAGCAGGGAGTTAGCAGGTGCCAAAGGTTTGCACTAAGCATCACAAGTTGAAGAGCGGGCGCGCTAAATCGGCGGCTGAAAT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000147979

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073086 lncRNA upstream 170672 23511983 ~ 23526252 (+) False XLOC_037129
TCONS_00075108 lncRNA upstream 277394 23416749 ~ 23419530 (+) True XLOC_037127
TCONS_00073083 lncRNA upstream 329715 23364611 ~ 23367209 (+) False XLOC_037128
TCONS_00073082 lncRNA upstream 329920 23364611 ~ 23367004 (+) False XLOC_037128
TCONS_00073098 lncRNA downstream 108198 23808654 ~ 23809422 (+) True XLOC_037134
TCONS_00075109 lncRNA downstream 183900 23884356 ~ 23887281 (+) False XLOC_037136
TCONS_00075110 lncRNA downstream 184293 23884749 ~ 23887281 (+) False XLOC_037136
TCONS_00075111 lncRNA downstream 184625 23885081 ~ 23887281 (+) False XLOC_037136
TCONS_00073102 lncRNA downstream 195337 23895793 ~ 23904416 (+) True XLOC_037137
TCONS_00073085 mRNA upstream 71692 23511913 ~ 23625232 (+) False XLOC_037129
TCONS_00073087 mRNA upstream 71692 23522656 ~ 23625232 (+) False XLOC_037129
TCONS_00073079 mRNA upstream 383582 23255410 ~ 23313342 (+) False XLOC_037125
TCONS_00073078 mRNA upstream 383582 23255410 ~ 23313342 (+) True XLOC_037125
TCONS_00073077 mRNA upstream 462860 23232901 ~ 23234064 (+) True XLOC_037124
TCONS_00073091 mRNA downstream 13950 23714406 ~ 23717712 (+) True XLOC_037130
TCONS_00073092 mRNA downstream 47677 23748133 ~ 23755001 (+) False XLOC_037132
TCONS_00073093 mRNA downstream 47886 23748342 ~ 23755337 (+) True XLOC_037132
TCONS_00073094 mRNA downstream 65131 23765587 ~ 23779497 (+) False XLOC_037133
TCONS_00073095 mRNA downstream 70210 23770666 ~ 23779525 (+) False XLOC_037133
TCONS_00073088 other upstream 140947 23547645 ~ 23555977 (+) True XLOC_037129
TCONS_00073080 other upstream 329715 23364242 ~ 23367209 (+) False XLOC_037128
TCONS_00073073 other upstream 650539 23046267 ~ 23046385 (+) True XLOC_037119
TCONS_00073071 other upstream 689946 23006451 ~ 23006978 (+) True XLOC_037117
TCONS_00073057 other upstream 1034196 22658229 ~ 22662728 (+) True XLOC_037111
TCONS_00073100 other downstream 185187 23885643 ~ 23886737 (+) True XLOC_037136
TCONS_00073118 other downstream 390451 24090907 ~ 24102291 (+) False XLOC_037141
TCONS_00073134 other downstream 683678 24384134 ~ 24387531 (+) True XLOC_037147
TCONS_00073135 other downstream 723336 24423792 ~ 24427240 (+) True XLOC_037148
TCONS_00073139 other downstream 1366205 25066661 ~ 25067730 (+) True XLOC_037151

Expression Profile


//