RNA id: TCONS_00073135



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073135
length 642
RNA type processed_transcript
GC content 0.40
exon number 6
gene id XLOC_037148
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 24423792 ~ 24427240 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tcgacatgcaggcaacggctctcctaatttgaaattcacctgtcgtctttcatccagcgaattcatcctcgcacaacactgagatgaaggcgaagtcaccatgaaaagttaaacctttaccgttaagctacagtaattgatgttgaaaaactgatgctaccaatcactcctcacttgattattcaagcccaaattgtgatggacctggaatgcgacaccagttactcttaagacaagaaccgaataaagcacagatgtggagggatttgcagccaaactaactggagggaaggaacctttagtgtgggtgaacatactacctggatgtccaacaaaggctgcacaagagctcatttgatagcacatattctgtcctgtctacatctctgatgacctggaagtgcttcgacatcagatcatcatcatgctgctgccctttttcactgtccctttccacatcaattggccttcatcatttcctgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaataatttttgatgcattaattgttgactggttttaatgatcaattgtttattagtgttctgttgctctgttatattgaattactgctactgttttagcatggtttacacaataaacctttatt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000134445

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073131 lncRNA upstream 210908 24209641 ~ 24212884 (+) False XLOC_037146
TCONS_00073133 lncRNA upstream 210908 24209665 ~ 24212884 (+) False XLOC_037146
TCONS_00073129 lncRNA upstream 225933 24193039 ~ 24197859 (+) True XLOC_037145
TCONS_00073122 lncRNA upstream 300677 24121106 ~ 24123115 (+) True XLOC_037142
TCONS_00073116 lncRNA upstream 335104 24066237 ~ 24088688 (+) False XLOC_037141
TCONS_00075112 lncRNA downstream 651923 25079163 ~ 25080132 (+) False XLOC_037153
TCONS_00075113 lncRNA downstream 1138500 25565740 ~ 25599002 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073147 lncRNA downstream 1140335 25567575 ~ 25642154 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075114 lncRNA downstream 1140335 25567575 ~ 25710183 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075115 lncRNA downstream 1140359 25567599 ~ 25749947 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073132 mRNA upstream 210908 24209665 ~ 24212884 (+) True XLOC_037146
TCONS_00073130 mRNA upstream 211516 24208533 ~ 24212276 (+) False XLOC_037146
TCONS_00073128 mRNA upstream 222633 24192370 ~ 24201159 (+) False XLOC_037145
TCONS_00073125 mRNA upstream 231647 24159280 ~ 24192145 (+) False XLOC_037144
TCONS_00073136 mRNA downstream 281413 24708653 ~ 24710074 (+) True XLOC_037149
TCONS_00073137 mRNA downstream 493437 24920677 ~ 24951124 (+) False XLOC_037150
TCONS_00073138 mRNA downstream 509256 24936496 ~ 24951662 (+) True XLOC_037150
TCONS_00073142 mRNA downstream 669260 25096500 ~ 25167102 (+) False XLOC_037154
TCONS_00073144 mRNA downstream 669396 25096636 ~ 25171412 (+) False XLOC_037154
TCONS_00073134 other upstream 36261 24384134 ~ 24387531 (+) True XLOC_037147
TCONS_00073118 other upstream 321501 24090907 ~ 24102291 (+) False XLOC_037141
TCONS_00073100 other upstream 537055 23885643 ~ 23886737 (+) True XLOC_037136
TCONS_00073090 other upstream 723336 23696924 ~ 23700456 (+) True XLOC_037131
TCONS_00073088 other upstream 867815 23547645 ~ 23555977 (+) True XLOC_037129
TCONS_00073139 other downstream 639421 25066661 ~ 25067730 (+) True XLOC_037151
TCONS_00073140 other downstream 646299 25073539 ~ 25074199 (+) True XLOC_037152
TCONS_00073141 other downstream 651969 25079209 ~ 25080305 (+) True XLOC_037153
TCONS_00073146 other downstream 903731 25330971 ~ 25337727 (+) True XLOC_037155
TCONS_00073158 other downstream 1429373 25856613 ~ 25856729 (+) True XLOC_037158

Expression Profile


//