RNA id: TCONS_00073134



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073134
length 621
RNA type processed_transcript
GC content 0.39
exon number 6
gene id XLOC_037147
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 24384134 ~ 24387531 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


atttgaaattcacctgtcgtctttcatccagcgaattcatcctcgcacaacactgagatgaaggcgaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaccgttaagctacagtaattgatgttgaaaaactgatgcaaccaatcactcctcacttgattattcaagcccagattgtgatggacctggaatgcgacaccagttactcttaagacaagaaccgaataaagcacagatgtggaggtatttgcagccaaactaactggagggaaggaacctttagtgtgggtgaacatactacctggatgtccaacaaaggctgcacaagagctcatttgatagcacacattctgtcctgtctacatctctgatgacctggaagtgcttcgacatcagatcgtcagaagtgctgctgccctttttcactgtccctttccacatcatttggccttcatcatttcctgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaataatttttgatgcattaattgttgactggttttaatgatcaattgtttattagtgttctgttgctttgttatattgaattattgctactgtttagcatggtttacacaataaacctttattgtgaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000131903

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073131 lncRNA upstream 171250 24209641 ~ 24212884 (+) False XLOC_037146
TCONS_00073133 lncRNA upstream 171250 24209665 ~ 24212884 (+) False XLOC_037146
TCONS_00073129 lncRNA upstream 186275 24193039 ~ 24197859 (+) True XLOC_037145
TCONS_00073122 lncRNA upstream 261019 24121106 ~ 24123115 (+) True XLOC_037142
TCONS_00073116 lncRNA upstream 295446 24066237 ~ 24088688 (+) False XLOC_037141
TCONS_00075112 lncRNA downstream 691632 25079163 ~ 25080132 (+) False XLOC_037153
TCONS_00075113 lncRNA downstream 1178209 25565740 ~ 25599002 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073147 lncRNA downstream 1180044 25567575 ~ 25642154 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075114 lncRNA downstream 1180044 25567575 ~ 25710183 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075115 lncRNA downstream 1180068 25567599 ~ 25749947 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073132 mRNA upstream 171250 24209665 ~ 24212884 (+) True XLOC_037146
TCONS_00073130 mRNA upstream 171858 24208533 ~ 24212276 (+) False XLOC_037146
TCONS_00073128 mRNA upstream 182975 24192370 ~ 24201159 (+) False XLOC_037145
TCONS_00073126 mRNA upstream 191989 24159280 ~ 24192145 (+) False XLOC_037144
TCONS_00073125 mRNA upstream 191989 24159280 ~ 24192145 (+) False XLOC_037144
TCONS_00073136 mRNA downstream 321122 24708653 ~ 24710074 (+) True XLOC_037149
TCONS_00073137 mRNA downstream 533146 24920677 ~ 24951124 (+) False XLOC_037150
TCONS_00073138 mRNA downstream 548965 24936496 ~ 24951662 (+) True XLOC_037150
TCONS_00073142 mRNA downstream 708969 25096500 ~ 25167102 (+) False XLOC_037154
TCONS_00073144 mRNA downstream 709105 25096636 ~ 25171412 (+) False XLOC_037154
TCONS_00073118 other upstream 281843 24090907 ~ 24102291 (+) False XLOC_037141
TCONS_00073100 other upstream 497397 23885643 ~ 23886737 (+) True XLOC_037136
TCONS_00073090 other upstream 683678 23696924 ~ 23700456 (+) True XLOC_037131
TCONS_00073088 other upstream 828157 23547645 ~ 23555977 (+) True XLOC_037129
TCONS_00073080 other upstream 1016925 23364242 ~ 23367209 (+) False XLOC_037128
TCONS_00073135 other downstream 36261 24423792 ~ 24427240 (+) True XLOC_037148
TCONS_00073139 other downstream 679130 25066661 ~ 25067730 (+) True XLOC_037151
TCONS_00073140 other downstream 686008 25073539 ~ 25074199 (+) True XLOC_037152
TCONS_00073141 other downstream 691678 25079209 ~ 25080305 (+) True XLOC_037153
TCONS_00073146 other downstream 943440 25330971 ~ 25337727 (+) True XLOC_037155

Expression Profile


//