RNA id: TCONS_00073158


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073158
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_037158
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 25856613 ~ 25856729 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TATCACAGCCACATCACCCTGCACCCCAAGacaggttactcactgaagctaagcagggctgagctcggtcagtacctgaattggtgaccacatgggaaaactaggttgctacTGGat

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175326

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073149 lncRNA upstream 30401 25775816 ~ 25826212 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075115 lncRNA upstream 106666 25567599 ~ 25749947 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075116 lncRNA upstream 126290 25567600 ~ 25730323 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075114 lncRNA upstream 146430 25567575 ~ 25710183 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073147 lncRNA upstream 214459 25567575 ~ 25642154 (+) False XLOC_037156
TCONS_00075117 lncRNA downstream 172002 26028731 ~ 26032058 (+) False XLOC_037159
TCONS_00074900 lncRNA downstream 172176 26028905 ~ 26032109 (+) False XLOC_037159
TCONS_00075118 lncRNA downstream 172821 26029550 ~ 26032058 (+) True XLOC_037159
TCONS_00073160 lncRNA downstream 229507 26086236 ~ 26096186 (+) True XLOC_037160
TCONS_00073162 lncRNA downstream 264152 26120881 ~ 26121858 (+) False XLOC_037161
TCONS_00073151 mRNA upstream 18864 25775833 ~ 25837749 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073150 mRNA upstream 20138 25775816 ~ 25836475 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073155 mRNA upstream 20166 25832329 ~ 25836447 (+) True XLOC_037156
TCONS_00073148 mRNA upstream 20404 25568839 ~ 25836209 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073154 mRNA upstream 20404 25777270 ~ 25836209 (+) False XLOC_037156
TCONS_00073159 mRNA downstream 229406 26086135 ~ 26096626 (+) False XLOC_037160
TCONS_00073161 mRNA downstream 247085 26103814 ~ 26127305 (+) False XLOC_037161
TCONS_00073167 mRNA downstream 342945 26199674 ~ 26293601 (+) True XLOC_037163
TCONS_00073173 mRNA downstream 1472911 27329640 ~ 27337185 (+) True XLOC_037171
TCONS_00073174 mRNA downstream 1482776 27339505 ~ 27344683 (+) True XLOC_037172
TCONS_00073146 other upstream 518886 25330971 ~ 25337727 (+) True XLOC_037155
TCONS_00073141 other upstream 776308 25079209 ~ 25080305 (+) True XLOC_037153
TCONS_00073140 other upstream 782414 25073539 ~ 25074199 (+) True XLOC_037152
TCONS_00073139 other upstream 788883 25066661 ~ 25067730 (+) True XLOC_037151
TCONS_00073135 other upstream 1429373 24423792 ~ 24427240 (+) True XLOC_037148
TCONS_00073164 other downstream 342895 26199624 ~ 26293589 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073165 other downstream 342895 26199624 ~ 26411378 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073166 other downstream 342930 26199659 ~ 26504452 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073169 other downstream 838140 26694869 ~ 26697305 (+) True XLOC_037166
TCONS_00073172 other downstream 1425593 27282322 ~ 27282436 (+) True XLOC_037168