RNA id: TCONS_00073167


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073167
length 574
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 5
gene id XLOC_037163
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 26199624 ~ 26504452 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CCATACAACATTTGAAGCAGTTTCTCGGTCAACGGTATAAAATTCACTCGTGAACTACTACAAAGCTCGATTTATTGCAAAACTGCAAACACGTCATGTCGTTTTCCAGTCATGAAGAACTTTGAAGATCTGTGTTCTTCGCGCGGGAGGCCTGTGGACACaagaaaaaatcaTCAGGAAATGGAACACAGATTTGGAACATCATGAGGGTCTTGTTGTTACATGACAACAGATGGAAAAATAAAGGATCCGAAAAAGTATCTCTCCCTCATGGTTCCTCAAGTATACGACCTCCCAGCACAACTGAAGAACTTTTCAGCTTGCAGGAGGAGGATGGAGAGCCTGGTAATCTGACTTCTCTTCTGTTCCTGCTCAGgattAACTGCGATGGATTAATTACCATCATGAAGGACTTTTCgccacattttgcgacaggatattcCATACATATACTTTTTGACACTATTGTCTACACCTTTACGAGACACCAGAGGGccacagaagttttttttttcaattcagcaTGTTGTATtaaattctattaaaaacaacactcttccaccagtccttactt

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070912-351 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000139510

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074901 lncRNA upstream 8250 26185088 ~ 26191424 (+) True XLOC_037162
TCONS_00073163 lncRNA upstream 75648 26121363 ~ 26124026 (+) True XLOC_037161
TCONS_00073162 lncRNA upstream 77816 26120881 ~ 26121858 (+) False XLOC_037161
TCONS_00073160 lncRNA upstream 103488 26086236 ~ 26096186 (+) True XLOC_037160
TCONS_00074900 lncRNA upstream 167565 26028905 ~ 26032109 (+) False XLOC_037159
TCONS_00074902 lncRNA downstream 277628 26571229 ~ 26574876 (+) True XLOC_037164
TCONS_00074903 lncRNA downstream 310462 26604063 ~ 26626970 (+) False XLOC_037165
TCONS_00073168 lncRNA downstream 310462 26604063 ~ 26795421 (+) False XLOC_037165
TCONS_00075119 lncRNA downstream 310724 26604325 ~ 26671302 (+) False XLOC_037165
TCONS_00075120 lncRNA downstream 310762 26604363 ~ 26627392 (+) True XLOC_037165
TCONS_00073161 mRNA upstream 72369 26103814 ~ 26127305 (+) False XLOC_037161
TCONS_00073159 mRNA upstream 103048 26086135 ~ 26096626 (+) False XLOC_037160
TCONS_00073157 mRNA upstream 285690 25853052 ~ 25913984 (+) True XLOC_037157
TCONS_00073156 mRNA upstream 287707 25840720 ~ 25911967 (+) False XLOC_037157
TCONS_00073155 mRNA upstream 363227 25832329 ~ 25836447 (+) True XLOC_037156
TCONS_00073173 mRNA downstream 1036039 27329640 ~ 27337185 (+) True XLOC_037171
TCONS_00073174 mRNA downstream 1045904 27339505 ~ 27344683 (+) True XLOC_037172
TCONS_00073175 mRNA downstream 1055208 27348809 ~ 27349361 (+) True XLOC_037173
TCONS_00073176 mRNA downstream 1058697 27352298 ~ 27355281 (+) False XLOC_037174
TCONS_00073177 mRNA downstream 1060813 27354414 ~ 27355281 (+) False XLOC_037174
TCONS_00073158 other upstream 342945 25856613 ~ 25856729 (+) True XLOC_037158
TCONS_00073146 other upstream 861947 25330971 ~ 25337727 (+) True XLOC_037155
TCONS_00073141 other upstream 1119369 25079209 ~ 25080305 (+) True XLOC_037153
TCONS_00073140 other upstream 1125475 25073539 ~ 25074199 (+) True XLOC_037152
TCONS_00073139 other upstream 1131944 25066661 ~ 25067730 (+) True XLOC_037151
TCONS_00073169 other downstream 401268 26694869 ~ 26697305 (+) True XLOC_037166
TCONS_00073172 other downstream 988721 27282322 ~ 27282436 (+) True XLOC_037168
TCONS_00073183 other downstream 1426666 27720267 ~ 27733587 (+) False XLOC_037178
TCONS_00073189 other downstream 1488903 27782504 ~ 27787376 (+) True XLOC_037180
TCONS_00073190 other downstream 1524324 27817925 ~ 27822574 (+) True XLOC_037182

Expression Profile

//