XLOC_037164


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037164
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 26571229 ~ 26574876 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00074902
gttatgtattttaatgaaaatttgATCATATTAACCACAGTAGCAAATTTGTTaaaaagtcagaactgtgagACATGAACTTGCTATACTTTTTCCCTTAAAATGGTAAGTTCTGATGTATtcatatgtaaatacaaacatgTATTCATTATTTGATCACATCTTCTATTATTTGAAGAAACCCAGCCACTCGTGGCTTTGTTCACATTGGCCTGACAATGGAAAATCGGTAGTTCCTTGCACCATCTGGTGGATGGTGCGTAAagcacaatttttttgtttgttttttaacgaAAAGGCGGCCTTAGCTGTTGCAGCACTGCACATGACAAATTGCAGCACTGCGCACGTTCTCAGTGGCCTTATCTGTATCATACCTGTCCACAATTTCGTTTTTTTCCAGGGAGTTTTCCGAATTTAATACCCATCTCCCACCATTTCCTGTTTTGTtgtgtctcccggaaaactcctgtaatttcaccccTCCTCAAAGTCCACAGCATTTTGGTGCAGTTTGTGAAATCCCCGGGTTGCGAACTTTGGTATAGGATCGGATCGCAGCAGCCACCTAAAACGCACCAAAGTACAGTTAGCGACAGTACACAGTACTGCaattctgtttttaaaaaatttaattgttagTTTTCTTGCAATATTtctcttttattcattttaattggaTTTTATAAGCCACCAGAAAAGTTACATCATTCTGACTTTTAATTAAAACTGTATGCTTTGTCttttaatattttcaaatttATTATACAGTCTGTTTTTGACTGTAAATAGTTACGGGGGCACGaaggttcagtggttagcactgactgTCATAATAACCTGCGATAGTACTccataagatcgctggatttcactctcaataaccatggactacaaatccgccatttctggactacattttcatacatgccctccggtcacactcacacatgcttcctcattacTCGCAcaacctgaggattgtcagagactgattgcacacactattaaAGCAGTACACTCACTCACTCCcattgcagagtcttgttatctgtaaaGTATCGCTACAACGCATTTCttattgttttcttgtgttttgaccttagcctttTTAGCCCGTTTgtcttagtctgccgcctgccttttgacctctcgcctgtttactgattacgattctggactgtctctatatacctgtttgcacctgtgttgacctttGCTTACCTGACCACTGAttaacctgcacgtggatccaaacttctgttgtcagtgtcactcagtTTTAacttctgtctggagtttgcatgtttcctccgggtgctccaatttcccccacagtccaaagatatgcagtataagtgaattagatgaactaaattggcctaaattggaattaaataaactaaactggctgtagtttatgagtgtgtgtgtatgtgagagtgtatgggtgtttctcagtgctgggttgcagctggaagggcatctgctgtgtaaaacatatgctggaattgttggtggttcattcgctgtggtgacctctgataagtAAGGgacaatatatgtgtgtatgtatatacgtTTGTTTGTTATACAAAGGCAAAGTTGCATGTGTAAAAGATGCAGTGAAAGTTTGCTGAAGTGGGAATTTGTGTAAATAAGTAGGGGCATGTATAAATATGTGCCAAATAGAGACCAAAGAATGTTCATGGGGATTAATTGTATGTCTCGCACATGGGGAAAATAGTGTGGATGTTTGTGGAATCTTTGCATATTTTATGCAAACAAATTGCTAATCACATTCCAATATACTTGAGTTCTCTAACTCTTTCCTTTGACTTAAAATAATTTGGACTCTTGGGCTCAAAAGCAATTTTAAAATGAGAACAGGGATGTGGCTGGAGTttgatatttgttaacatttatataaCGCTGGTTAATGACACCATTGTTGTGTTAGGACCACATACGCACTAGTATTGATATGTGGAGATGTGGCCAATAAACCTTTGAACCTCATTAGTCAATGAGAGACAAAGAAAATCAATTCAACTCTCTCACAGCATCAACTTTTCTGTCATCAGGCAAATGTTTTTAGCTGATGTGAACAGTGCATTGAGACCTCGTCCTGCAATCAGGTGCAATGTTGTGGCTCTACGGGCTTGACTGGATTAAATTTTGTAATTCTGCTTCCCCTGAATGGGCAAATGGTGTGTTAAATGGCGTCTAACACATTAGCTTAACAGCACATGCGGCCTCTCTTTCCATTACTCCCTTCATCTCACTCCCTCAGGAAGCTGCTCCGACCAAAGCAGAAAATGCAGTGTTTCTTCAACAAACTTTGACATGGACAGAGAGCAGATATCCACCTGAATAGCCTTGATGAAGAACACACATTCATGCACGCACACATTCAATTcaactgaaaaagaaaaataagcacTTCAAAGACGCTTGAGGAATTTACATATGGCCAGGAAACGTGGCTATGCTCGCCCTCACGCACTGAAACCCACTCTCTGAGCCGTTTTTATGCTCTTCTGGGCCTGTATTGGAAGTAAACATCCGGTTAATCATGCGTTAAATAAAGCTCACCATGTCCAATGACTAAAAGTGTGTAAAATCTCACTTAGTGAATCTCTTCATTATGGAGATTTGATTAGCATCGGCTGTGCGCTAACCGTGAGCCGCAGGTGTAGTGTGTTTACAGATAATAGCTCTTTTTCAAGATCTAGTGAGCTGTCTTTGCTGAATCCTGTCTACATAGGGAGCCTGATGTCTTGTTTTCTTGCATCCAAACTGGAAATTGGTTAACAGCTCTACACACACGACAGTGCGGTATAGAGATGATGTGTTTTGTAGGCCATCGTAGAAGCTAGCATTGATTtgcttggaaaaaatatatataaataaaatcaacatataggctcattctaaaaacttaGCCCTATTTACATtcctggagattgtgaattatgtatccagaagtaggtatggctgcattttgtctttaaaacgaacactaagttgtttcttttcacacttaCCAACTGACCGCTTACCACTGTATGAACAGCTTTCCCACTGTTGCCAGTTTGTCCAGAAGCACAACATGTacatcagtggacttgagacacagagagaagttgaccataACTATGGGTTTGAGTccagcgaagaacggttccagaaagcagataagacaaaaacagaaaacaaaaatttaaataaacaagtaaataacacggtgagaatgcggtaaaatctgaaaacgtggtaaaaatcaggtaagggctttactttttctggattgctttttaaaactgtcagttaggtttagagaagtgggtgggcgggtcattctgtgattttaaaaacactattggtt

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00074902 True 3388 lncRNA 0.39 2 26571229 26574876

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037163 si:dkey-111i23.1 coding upstream 66777 26199624 ~ 26504452 (+)
XLOC_037162 NA coding upstream 379805 26185088 ~ 26191424 (+)
XLOC_037161 efnb2a coding upstream 443924 26103814 ~ 26127305 (+)
XLOC_037160 arglu1a coding upstream 474603 26086135 ~ 26096626 (+)
XLOC_037159 NA coding upstream 539120 26028731 ~ 26032109 (+)
XLOC_037165 NA coding downstream 29187 26604063 ~ 26795421 (+)
XLOC_037166 NA coding downstream 119947 26694823 ~ 26697305 (+)
XLOC_037167 FP101883.1 coding downstream 321909 26896785 ~ 27225134 (+)
XLOC_037168 BX928746.1 coding downstream 707446 27282322 ~ 27282436 (+)
XLOC_037169 NA coding downstream 725788 27300664 ~ 27301565 (+)
XLOC_037158 CR925716.1 non-coding upstream 714500 25856613 ~ 25856729 (+)
XLOC_037156 NA non-coding upstream 733480 25565740 ~ 25837749 (+)
XLOC_037153 NA non-coding upstream 1490924 25079163 ~ 25080305 (+)

Expression


Co-expression Network