RNA id: TCONS_00073172


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073172
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_037168
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 27282322 ~ 27282436 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

attattagcTAGcactctgcaactctcacatggttgccgaCTGAAGCTTAGGAGagctgcgcccagtcagtacctggatgggagacaacatgggaaagctaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183781

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075126 lncRNA upstream 57188 27182702 ~ 27225134 (+) True XLOC_037167
TCONS_00075125 lncRNA upstream 99133 26896788 ~ 27183189 (+) False XLOC_037167
TCONS_00075124 lncRNA upstream 206908 26896788 ~ 27075414 (+) False XLOC_037167
TCONS_00074904 lncRNA upstream 206930 26896816 ~ 27075392 (+) False XLOC_037167
TCONS_00075123 lncRNA upstream 248398 26896788 ~ 27033924 (+) False XLOC_037167
TCONS_00074906 lncRNA downstream 18228 27300664 ~ 27301565 (+) True XLOC_037169
TCONS_00074907 lncRNA downstream 32515 27314951 ~ 27323715 (+) True XLOC_037170
TCONS_00075127 lncRNA downstream 66194 27348630 ~ 27349337 (+) False XLOC_037173
TCONS_00075128 lncRNA downstream 128895 27411331 ~ 27416223 (+) False XLOC_037177
TCONS_00075129 lncRNA downstream 129179 27411615 ~ 27416223 (+) True XLOC_037177
TCONS_00073167 mRNA upstream 988721 26199674 ~ 26293601 (+) True XLOC_037163
TCONS_00073161 mRNA upstream 1155017 26103814 ~ 26127305 (+) False XLOC_037161
TCONS_00073159 mRNA upstream 1185696 26086135 ~ 26096626 (+) False XLOC_037160
TCONS_00073157 mRNA upstream 1368338 25853052 ~ 25913984 (+) True XLOC_037157
TCONS_00073156 mRNA upstream 1370355 25840720 ~ 25911967 (+) False XLOC_037157
TCONS_00073173 mRNA downstream 47204 27329640 ~ 27337185 (+) True XLOC_037171
TCONS_00073174 mRNA downstream 57069 27339505 ~ 27344683 (+) True XLOC_037172
TCONS_00073175 mRNA downstream 66373 27348809 ~ 27349361 (+) True XLOC_037173
TCONS_00073176 mRNA downstream 69862 27352298 ~ 27355281 (+) False XLOC_037174
TCONS_00073177 mRNA downstream 71978 27354414 ~ 27355281 (+) False XLOC_037174
TCONS_00073169 other upstream 585017 26694869 ~ 26697305 (+) True XLOC_037166
TCONS_00073166 other upstream 777870 26199659 ~ 26504452 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073165 other upstream 870944 26199624 ~ 26411378 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073164 other upstream 988733 26199624 ~ 26293589 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073158 other upstream 1425593 25856613 ~ 25856729 (+) True XLOC_037158
TCONS_00073183 other downstream 437831 27720267 ~ 27733587 (+) False XLOC_037178
TCONS_00073189 other downstream 500068 27782504 ~ 27787376 (+) True XLOC_037180
TCONS_00073190 other downstream 535489 27817925 ~ 27822574 (+) True XLOC_037182
TCONS_00073191 other downstream 552009 27834445 ~ 27844628 (+) True XLOC_037183
TCONS_00073192 other downstream 554626 27837062 ~ 27838013 (+) False XLOC_037184