RNA id: TU466070


Basic Information

Item Value
RNA id TU466070
length 19919
lncRNA type inter_gene
GC content 0.36
exon number 2
gene id G405578
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000299
NCBI id null
chromosome length 6567443
location 3893020 ~ 3912958 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

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CI01000299_03478949_03486009.mRNA mRNA upstream 407011 3476088 ~ 3486009 (+) False CI01000299_03478949_03486009
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CI01000299_04259743_04263032.mRNA mRNA downstream 345963 4258921 ~ 4263493 (+) True CI01000299_04259743_04263032
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Expression Profile


Homologous

species RNA id representative length rna type GC content exon number chromosome id location
zebrafish (Danio rerio) TCONS_00039494 True 2176 lncRNA 0.39 2 NC_007132.7 42971929 ~ 42985641 (+)
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) TU151092 True 223 lncRNA 0.26 1 CI01000026 9787856 ~ 9788078 (+)
eurasian perch (Perca fluviatilis) TU151092 True 4423 lncRNA 0.40 2 NC_053122.1 4429027 ~ 4480919 (-)
tiger barb (Puntius tetrazona) TU151092 True 358 lncRNA 0.48 1 NC_056712.1 25751779 ~ 25752136 (+)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) TU151092 True 333 lncRNA 0.34 1 NC_035909.1 17617664 ~ 17617996 (+)