RNA id: TCONS_00071377


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00071377
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_036539
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 30999914 ~ 31000028 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCcaacagctagctctctgcaactcgcacatggttgcccactgaagccaagcagggctgagccAGGTCAGTtcatggatgggagaccacattcgaaagctaggttgctgttagtG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185297

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072480 lncRNA downstream 78642 30919949 ~ 30921272 (-) True XLOC_036536
TCONS_00071365 lncRNA downstream 715466 30252398 ~ 30284448 (-) True XLOC_036528
TCONS_00072479 lncRNA downstream 1144897 29853229 ~ 29855017 (-) True XLOC_036526
TCONS_00072065 lncRNA downstream 1305964 29691710 ~ 29693950 (-) True XLOC_036521
TCONS_00071345 lncRNA downstream 1363991 29581495 ~ 29635923 (-) True XLOC_036517
TCONS_00071382 lncRNA upstream 58647 31058675 ~ 31059896 (-) False XLOC_036541
TCONS_00071383 lncRNA upstream 68518 31068546 ~ 31069632 (-) True XLOC_036541
TCONS_00071385 lncRNA upstream 99942 31099970 ~ 31100590 (-) True XLOC_036542
TCONS_00071387 lncRNA upstream 368277 31368305 ~ 31369145 (-) True XLOC_036543
TCONS_00071389 lncRNA upstream 376431 31376459 ~ 31379685 (-) False XLOC_036544
TCONS_00071376 mRNA downstream 20420 30949968 ~ 30979494 (-) True XLOC_036538
TCONS_00071373 mRNA downstream 55423 30929704 ~ 30944491 (-) False XLOC_036537
TCONS_00071374 mRNA downstream 55435 30929714 ~ 30944479 (-) False XLOC_036537
TCONS_00071375 mRNA downstream 55449 30937526 ~ 30944465 (-) True XLOC_036537
TCONS_00071372 mRNA downstream 208648 30787613 ~ 30791266 (-) True XLOC_036535
TCONS_00071378 mRNA upstream 30585 31030613 ~ 31053872 (-) False XLOC_036540
TCONS_00071380 mRNA upstream 57087 31057115 ~ 31075015 (-) False XLOC_036541
TCONS_00071381 mRNA upstream 57406 31057434 ~ 31062811 (-) False XLOC_036541
TCONS_00071384 mRNA upstream 99236 31099264 ~ 31107537 (-) False XLOC_036542
TCONS_00071386 mRNA upstream 367639 31367667 ~ 31369161 (-) False XLOC_036543
TCONS_00071362 other downstream 832210 30167630 ~ 30167704 (-) True XLOC_036531
TCONS_00071361 other downstream 832389 30167435 ~ 30167525 (-) True XLOC_036530
TCONS_00071360 other downstream 837281 30162492 ~ 30162633 (-) True XLOC_036529
TCONS_00071349 other downstream 1301632 29688511 ~ 29698282 (-) True XLOC_036520
TCONS_00071333 other downstream 2704118 28294476 ~ 28295796 (-) True XLOC_036506
TCONS_00071379 other upstream 40138 31040166 ~ 31041878 (-) True XLOC_036540
TCONS_00071393 other upstream 395796 31395824 ~ 31403948 (-) True XLOC_036545
TCONS_00071398 other upstream 692231 31692259 ~ 31701030 (-) True XLOC_036549
TCONS_00071428 other upstream 1787822 32787850 ~ 32794476 (-) True XLOC_036564
TCONS_00071434 other upstream 1931615 32931643 ~ 32931759 (-) True XLOC_036569