G329101


Basic Information

Item Value
gene id G329101
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000112
NCBI id null
chromosome length 5247617
location 2863085 ~ 2868729 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU374068
TAATTAACTCAATGGAACACATCCTATATAAGATAATTCAGATATTTATACAAGATAAACATAATATTACAACTAATATTTGCGCAAAAACACGCACAGAAGAACTTGAACTAAGTAATGTAGTCAGAATGTAGCTCCCGTTGTGGATGCGTTCTTCCAGTAACAACACACCGAAACACAACTGAGCCCAAAGAATTCACAGCGTTTTATTGCAATAGATATTAATGTTTTGCGTTGCTGTTTGAGAGCTCGCGCTGAAGCTAAAGATGGTCATTAGTACAATACAGCTCTACGGGTTATTTACCTCAACGAAGCGCATCCTATATGAGATTAATCATATATTTATACTACATAAATTTAATATTACGACTTATATCTGCACACAATGACACAAATGCACAAGTGAAGCTTGAACTAAATTATGTGCTTGTCAGAATGTTTAACTCCTGTAGACCTGCACTTCCCACAACAACACGCTGAAAAAACAAAAACACATTGAATTCACAACCAGGGTATGGTGTACATTTTAGGACATCCTCAGACCTAAGTCATACAACGAAAAGGCGTCATACCTCAGACTAAAAGGCTCCAGTCATCGGACAAAACAGCATCGTGCCTAAGGCTGAAAGGCTTCAGCCCGCCTCAATGTGACGTCACATGCACGCAATTTTCTAACTGTTAAAAGCTACACTAAGTTGTACAAAACATTTCCCACTGAGATTATTTTGTAAATTTGTATTATTTCGCAAGTTTTATTTCCATGTATAAAAAGTTAGCTAAATAACACATTGCAACTAGCTTGCACTGCAAACTATTGTGAACACATACGAAAATTAACCATGGTTAAAAGTGTGTTAATTATGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCGTATTGATACTATTTGTATAACAATAAACCATGGTTAATTTGTGGTTACCATTAACTACAATACCATGTTTTTTGTTTTATTTGTAGTAAAACCATGGTTAATTTTCATAAGGGAGGTAAAAAATCTTTTGAGCTATTTGACTGCGTTGTTATAAGCACAGCTGCTTTATGTATAGAGGTTACCAAGGAAACGGCTTTATTTCTGCTGTTCCAGAGCCACCTACTGTCAGAGAGTCGATTAGGCAAGGCAAGGCAATTTTATTTATATAGGCTAACACATTTCATACACAATGGTAATTCAAAGTGCTTTACATAAAAAGGAAACAAATACATAAGAATAAAAATGGAATGCATAAAAAACAAAAATAACAATAAAAACAGAATATCACTATCATTTTACATTTTCATTCAGCCCGTTGCTGATTTTCTGCAGACCAATGTGAAAACCAGTGTAATATTTAATTAAAGCTGTAAGAATTAAATACCAGGTAGCTTATAGCTTACCTTCGGCTACCCCGTATATACATAATATTTCTCTCAGTTGTTAGTTTTCTTAAATTTAAACCGCAGCGCTGTGCAGGGTTTCCCTCATACATCATACTGGATTACTGTGGGGACAGTTTATTATGTAACCCTCATAATTGTATCATTTAGTGTTGTTAAATATTGTTTATTACTGTTTGTCATGTCTTTGTTATTGTTGCATAATAAGTGATATAAAAGACCAAACTCACCCTTATTGGTGATGTTGACTCTACAGGCTACAGACAAGCAGATGAATGTGACGTGAAAAGTGCCACGCTAAGCTTTCCCAGTGAAATACTGGCATTAAGTTGGCTTAATGGTGGATATTCACAAATTTAGGGACCGTCTCTAAAGTCACACACAACATTGGTATGCATGTTTCAAACTTCAACAGCATTTGAAGAGAATGACTTAGAGTCATAAAACCAACTGTAAAGTGTAGGTATTTAATAATATTAAACTGTCAAATCATATGTAAATATTGCTTTGTATTTCACTTACTGTATGCTCATATATACAATATGAAGCAAAAAAACAAAATGAATTATCCGCACACTAATGTAACTGCTCCTTAAAATATTTATTGTATAAATTGCAACGTTTTAACCAACTGGTCTTCGTCAGGCACAAACTTAGTGAACAAAGTTGTAAATTTACGGTTACTGAACTAAGCATTTCACTTAGAAAATACTTAACATGGTTTATTGTGATGATAAAAGACCAAATTCAGTATATACTATGTACAGTTAAGCAGAAGAGCCCAGAATATTAACGCAAAAACATTTTTCTTCCATACTATAAAGAAAACACTTAGCATGCAGTGTAGACTTTTGCATCAACAATCTGCTTGTTGAATATATATTATTGTGTGTATTGTAAATCAGTAAGGTACGAGATGTATGTTTTCAGGTTAAGTGTTGTTGGGGAATCCTGGAGTATGACGTATGACGGCAACCCCAATATTACAGCACAGCCTAGGGGTCTCATTTATAAAGCGTGCCCCATTTTGTGCGTACGCCAGTTCCCATGCAAAGGTTGTGATCTATAAAAAACAAACTTGATGGGAGAATGTGCGCACCTTTAAGCAAACTTTGAGCCGTGCGTACGCACATTCTGGAGACAAAGGGAATTGGCGTCACAGATGGTGAGCTAAGGGACTGACGGCAGATGAAGAAAAACCACTTTAAATCCCCATTATGAGTCATAATCATAAATACAGTGCATGTTCACAATAACAGTTTAAATAAAAGAATGATTTAAACTTGCATGGAAACTCACGTTTTCATTTTGATATACACATATACATTAATATTACACTTTCACTAATGGCGATAAGCACTGAAATTACATTACGCAGTCATTACGGAGAAGTTAATCAAACGTGATATGAATTTGGATAGTAGATGTGCAACTTTCGATCACTTTTCCTGTGACACGCTGTTTTAATGACAGCGAGGAGCGCTAGGAGCACAATATTCCTCATTAAACTAAACTGCAGATGTTATGACAAAATATTTTAGCAAAAACGACGATCAGTGATGCACACTTAACTTGGATATTAGTGACAGATTGAATAGGTCCAATGATAATAGCTTACTGTACAACCGCAGCTGCACGGTGGTGTTGATGTCGTGTGAAGGATCTTCAAACAATTACCACTGTATTTGAAGGATATAATTTGAGGAAAACGGTAAGATTTGCACGTTTCCTTTTTAAAATACTTTGTCAGTGACGCGCTGAGATAGACAACTGTATTTACACTGAAATAAATAAGTAGGCCTATCTGTTTCCACTAAAAATAGCCTATAGACTTCCTAAAAAATATGTTCACCTTATCAGCAAAACTGCATAAATTTGATTTGAATTGTTAAAAAACAATTAAAATACTATTTGGCCAGTGGAAATTAATGAAGCAACTCTATTCTAAAACCTTTATCTGAAGTATTTTATACAATTTTATGGATATTTTGATATATTTATTCTAAAATATAAAGAGGATATTGGATGATTTTTATCAATGTAGTATATTGCACAAATGGCATTTATATCTAGTATTTTCCAATGTCTCGTACCTTTGACGGTGTTAACCATGGTGTCACGTGGATGGGAACATGTATGGAAATGATATGCAGATGAGGTTATGAATAGTAAAACTAGGCGTCATAAGCTCCATATATGGTGATTTCAAGGAGGAGACAGGGTGGAGATGCACGTACGCACAATCTTCCGCTGACTGGGATTAATAAAGGGATTTGTGCGCAGGTTCTGGCGTACGCATGGTTTTATAAATCTGAATTTTTTTGTGCGTACGCAGAATCTAGCTTTTGCACGTACATACACTTTTAGGATGAAATCTATGCACAGTTTTATAAATGAGACCCCAGGGCTTTTTGCATATTACGACTAAAGTATGAATGAATTCTATGAATGTATCTGAAGGGAACTGACTGACTTGAGAAAAGTTTTGATGGCATTTTCTTTTCATCTCCCCTCCATGTAACGTAGTGTTTATAAGCAGCGCTGCTTTGTTTACTGAGGTTACTGTGGAAACAGCTCTATTTCTGATGTTTCATAAGCACCACCTACTGACAGAGAGTGGATTTAAATTTTCACTCAGCCTAGCTGCGGTTTTTGTTTGTGAAACCCAGACCACATTTTTATGCACTGTTGTACTGTACTTACCAGGATATTCGACAAAACGGGCATTTTGGCATAATTTTGTGTGTTTTTGTCCGTTCATTCACGAAAGAGAACTCAATGCGGCCAGTGTTAGTAGGTAGCACAATTCAACAATTCATAATGCGATGTTTGATATGTGATAGAATATTGCTTTAAGTGTGTAAAATTAATATAAATTATATATAAAAATATTTTAAAACTGAAAATTATATAACCAATATATATGTGTCGCATTCTTTCTGGGAAAATAAATCATCACTAAAATTTCTGAAAGTGACCAAAAAACAAATTATGCCAATATTTAAATACCAAAAACTCTTTGCTCGATAATATACAAAGTTCAGTCATGAAACTCTAACCGAGTGCTGATTGGTTCTTTCTATGCCGCGGCACCAGCCAATAAGAAGTAATTCCAAATCCACGCATCCATATATATCGTACCCTAGCCTGCGATCGACAAGTCAGGGGCAGTGAGTGAATTTCTCTTCTATCTTTTGTTGTTTGACAGAGAGCAGCAGGTTTACTCTTAGGCTGCTGTCCCTTTAAAGGGTTAGTTCACCGAAAAATGAAAATACTGTCATTTATTACTCACGCTCATGCCGTTCCACACCCATAAGACCTTCGTTAATCTTCGGAACGCAAATTGAGATATTTTTGTTGAAATCCGATGGCTCTGTGAGGCCTACATAGCCAGCAATGACATTTCCTCTCTCAAGATTCATAAAGGTACTAAAAACATATTTAAATCAGTTCATTGGTTCAATATTAATATTATAAAGTGACGAGAATATTTTTGGTGTGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU374068 True 4912 lncRNA 0.35 2 2863085 2868729

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000112_02774549_02777028 SOCS3, SOCS3A coding upstream 84454 2773456 ~ 2778631 (+)
CI01000112_02740099_02758394 CYTH1, CYTH1A, CYH1 coding upstream 104691 2740099 ~ 2758394 (+)
CI01000112_02659891_02661832 NA coding upstream 201070 2659891 ~ 2662015 (+)
CI01000112_02585528_02607525 USP36 coding upstream 255417 2584929 ~ 2607668 (+)
CI01000112_02565726_02573879 TIMP2B coding upstream 288979 2565508 ~ 2574106 (+)
CI01000112_02992698_02995752 NA coding downstream 121092 2989821 ~ 2996663 (+)
CI01000112_03085161_03094204 HID1 coding downstream 216432 3085161 ~ 3094406 (+)
CI01000112_03100235_03105799 USH1G, USH1GA coding downstream 230719 3099448 ~ 3106273 (+)
CI01000112_03112349_03117520 NA coding downstream 243620 3112349 ~ 3117587 (+)
CI01000112_03192658_03204707 MHC1ZBA coding downstream 322932 3191661 ~ 3205032 (+)
G329153 NA non-coding upstream 74228 2788427 ~ 2788857 (+)
G329151 NA non-coding upstream 77816 2785040 ~ 2785269 (+)
G329145 NA non-coding upstream 90344 2772501 ~ 2772741 (+)
G329097 NA non-coding upstream 209724 2650374 ~ 2653361 (+)
G329098 NA non-coding upstream 320788 2541667 ~ 2542297 (+)
G329184 NA non-coding downstream 32457 2901186 ~ 2901402 (+)
G329190 NA non-coding downstream 49220 2917949 ~ 2918168 (+)
G329192 NA non-coding downstream 58695 2927424 ~ 2930886 (+)
G329197 NA non-coding downstream 77613 2946342 ~ 2949164 (+)
G329195 NA non-coding downstream 158288 3027017 ~ 3048993 (+)
G329125 NA other upstream 244934 2617704 ~ 2618151 (+)
G328456 NA other upstream 1629967 1232022 ~ 1233118 (+)
G329194 NA other downstream 51525 2920254 ~ 2931889 (+)
CI01000112_05076817_05101845 NA other downstream 2215991 5076817 ~ 5101845 (+)

Expression


Co-expression Network