CI01000299_04398464_04403711


Basic Information

Item Value
gene id CI01000299_04398464_04403711
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000299
NCBI id null
chromosome length 6567443
location 4393404 ~ 4403711 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>CI01000299_04398464_04403711.mRNA
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>TU468042
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000299_04398464_04403711.mRNA False 2602 mRNA 0.39 5 4396474 4403711
TU468042 True 3605 lncRNA 0.34 1 4393404 4397008

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000299_04370401_04385955 RADIL coding downstream 8454 4370401 ~ 4388020 (-)
CI01000299_04242809_04251680 ARGLU1 coding downstream 144609 4242197 ~ 4251865 (-)
CI01000299_04227918_04239792 EFNB2B coding downstream 156682 4227520 ~ 4239792 (-)
CI01000299_04186183_04196219 MX1, MXB, MXA coding downstream 198590 4184967 ~ 4197884 (-)
CI01000299_04171373_04175441 NA coding downstream 221033 4171149 ~ 4175441 (-)
CI01000299_04456420_04468754 NA coding upstream 52518 4456229 ~ 4469450 (-)
CI01000299_04587880_04594059 ATP1A1A.4, ATP1A1A.5, ATP1A1A.3, ATP1A1 coding upstream 184083 4587794 ~ 4594120 (-)
CI01000299_04603421_04609353 ATP1A1A.4, ATP1A1A.2, ATP1A1A.3, ATP1A1 coding upstream 199680 4603391 ~ 4609353 (-)
CI01000299_04645836_04651938 ATP1A1A.4, ATP1A1B, ATP1A1, ATP1A1A.1 coding upstream 241928 4645639 ~ 4651938 (-)
CI01000299_04658984_04668843 ATP1A1A.4, ATP1A1 coding upstream 255184 4658895 ~ 4669022 (-)
G407397 NA non-coding downstream 34236 4362007 ~ 4362238 (-)
G407387 NA non-coding downstream 46710 4349523 ~ 4349764 (-)
G407352 NA non-coding downstream 115097 4281164 ~ 4281377 (-)
G407348 NA non-coding downstream 124302 4271912 ~ 4272172 (-)
G407344 NA non-coding downstream 129032 4267219 ~ 4267442 (-)
G407359 NA non-coding upstream 6792 4410503 ~ 4413402 (-)
G407406 NA non-coding upstream 51735 4455446 ~ 4455680 (-)
G407408 NA non-coding upstream 63107 4466818 ~ 4467020 (-)
G407409 NA non-coding upstream 66301 4470012 ~ 4470215 (-)
G405053 NA other downstream 2378424 2017687 ~ 2018050 (-)
G404976 NA other downstream 2515486 1855639 ~ 1880988 (-)
G404784 NA other downstream 2736474 1659655 ~ 1660000 (-)
G404372 NA other downstream 3320583 1070607 ~ 1075891 (-)
G407413 NA other upstream 72283 4475994 ~ 4550721 (-)
CI01000299_04913779_04927715 NA other upstream 522257 4913373 ~ 4927715 (-)
CI01000299_05428160_05443433 APP, APPA other upstream 1037626 5427661 ~ 5443433 (-)
G407805 NA other upstream 1424125 5835889 ~ 5835989 (-)

Expression


Co-expression Network