XLOC_014258 (CU896644.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014258
gene name CU896644.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 42219165 ~ 42220434 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00028334
tctgtctgtctgcctgtctgtctgtctatctatcttcctgtccgtccgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctatctatctatccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcctccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcctccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatccatccatccatccatcctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccaaccatccatccatccatccatccatctatctgtctgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccatccgtccatccatccatctatcatctatctgtgtgtctgtctgtctgtttgtctgtcttgtctgtctgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcctccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcctccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatccatccatccatccatccaactgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000103818

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00028334 True 1270 mRNA 0.38 1 42219165 42220434

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014256 kcnq4 coding upstream 344 42142381 ~ 42218821 (+)
XLOC_014257 CU896644.3 coding upstream 30061 42188990 ~ 42189104 (+)
XLOC_014255 NA coding upstream 78511 42127923 ~ 42140654 (+)
XLOC_014254 nfyc coding upstream 99466 42071033 ~ 42119699 (+)
XLOC_014253 si:ch211-13c6.2 coding upstream 150176 42047427 ~ 42068989 (+)
XLOC_014259 jtb coding downstream 6966 42227400 ~ 42236185 (+)
XLOC_014260 anp32e coding downstream 107989 42328423 ~ 42341815 (+)
XLOC_014261 BX571688.1 coding downstream 116883 42337317 ~ 42337431 (+)
XLOC_014262 pogza coding downstream 212191 42432625 ~ 42456001 (+)
XLOC_014263 si:dkey-166k12.1 coding downstream 248624 42469058 ~ 42485064 (+)
XLOC_014252 NA non-coding upstream 377964 41837751 ~ 41841201 (+)
XLOC_014244 NA non-coding upstream 980637 41233808 ~ 41238528 (+)
XLOC_014243 NA non-coding upstream 1027646 41187812 ~ 41191519 (+)
XLOC_014264 BX950855.1 non-coding downstream 285540 42505974 ~ 42516134 (+)
XLOC_014265 NA non-coding downstream 298143 42518577 ~ 42547204 (+)
XLOC_014266 NA non-coding downstream 340522 42560956 ~ 42603289 (+)
XLOC_014267 NA non-coding downstream 344924 42565358 ~ 42573127 (+)

Expression


Co-expression Network