XLOC_018932 (dixdc1b)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_018932
gene name dixdc1b
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 25068215 ~ 25119942 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00037609
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>TCONS_00037608
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>TCONS_00037610
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>TCONS_00037611
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Function

symbol description
dixdc1b Predicted to be involved in canonical Wnt signaling pathway. Predicted to act upstream of or within Wnt signaling pathway. Predicted to be active in cytosol. Orthologous to human DIXDC1 (DIX domain containing 1).

GO:

id name namespace
GO:0060070 canonical Wnt signaling pathway biological_process
GO:0016055 Wnt signaling pathway biological_process
GO:0005829 cytosol cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-041008-148 Predicted to be involved in canonical Wnt signaling pathway. Predicted to act upstream of or within Wnt signaling pathway. Predicted to be active in cytosol. Orthologous to human DIXDC1 (DIX domain containing 1).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000056267

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00037609 False 6161 mRNA 0.39 19 25068215 25119942
TCONS_00037608 False 5059 mRNA 0.42 20 25068215 25119942
TCONS_00037610 False 2198 mRNA 0.50 17 25071805 25117818
TCONS_00037611 True 606 mRNA 0.48 3 25092300 25103628

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_018931 zgc:171740 coding upstream 5625 25054420 ~ 25062590 (+)
XLOC_018930 jam3b coding upstream 21224 24984970 ~ 25046991 (+)
XLOC_018929 NA coding upstream 199303 24865149 ~ 24868912 (+)
XLOC_018928 BX510932.1 coding upstream 318436 24749662 ~ 24749779 (+)
XLOC_018927 BX510932.2 coding upstream 399878 24668221 ~ 24668337 (+)
XLOC_018933 ddx10 coding downstream 604 25120546 ~ 25171784 (+)
XLOC_018934 si:dkey-183i3.9 coding downstream 61061 25181003 ~ 25183430 (+)
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XLOC_018937 sycn.3 coding downstream 96455 25216397 ~ 25219305 (+)
XLOC_018926 CR759955.1 non-coding upstream 520615 24547524 ~ 24547600 (+)
XLOC_018924 NA non-coding upstream 566532 24456028 ~ 24501683 (+)
XLOC_018945 BX510938.2 non-coding downstream 226143 25346085 ~ 25346388 (+)
XLOC_018946 BX510938.5 non-coding downstream 226839 25346781 ~ 25347003 (+)
XLOC_018949 BX510938.4 non-coding downstream 245937 25365879 ~ 25366134 (+)
XLOC_018951 BX510938.3 non-coding downstream 257013 25376955 ~ 25377279 (+)
XLOC_018952 NA non-coding downstream 314747 25434689 ~ 25436244 (+)

Expression


Co-expression Network