XLOC_030783 (FO834903.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_030783
gene name FO834903.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 4640459 ~ 4643289 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00059918
CATAAATACTTCATCTATCTGGAATGTCCCATTTTAGTTTTCATCAAACGAACTTTCACCAACAAGTGCTTACTACATGGAggcttatttaaaaacataacttCCCCCTTATAGTTTTCTTATTTGAAATAATATCAATAtcttgtataaaaataaatcacaattggTTTATCAATGTGCTGATATTAGTGAATCAGTTATTTAATAATGAAAGGGCATTATTTACATACAGACTTTATTGCAAAATACTTATTACAATACAGGAATTTATGGTGCTTACTGATGCAGGGAATGGATAGTATCACAATTAATGAGACACAAAGTTAGTGTTCCTGATGTCAAGTATGTCCCTAAGTAACCAAAATAGTATAAAACGATATGTGTCAAAAGCAAACAGTTAAACATTAAACTGCTGGTTACTTTAAAACTAACCTTCGTCTGGGAGATCACAAGGACATAATGATATTTTATCTGTTATCTGGTTGCAGGTGTCAGATTTATAGAATGATGAGGGAGCaaccatttttatttaattaaaagctTAGTGAGAAGTGAAGTGTCAAAAAATCAGCGACGCAATTTAAATTCCACTGAATTTCTCACTGTAACATATTTTGGCCCCTTTGGTGTGATCATGGTATTCCAGTGACACTCCCAGTCACGTGATATTGGCAACATAAATAGTGGATCAGAATCAATCTGAGAGTCAGACTGTGTGATAACACATTTatatttcatgcagactttaatcaGCACCACTGCAGTGATGTCAAGCGAGTGGACCAAGGTGATGCCTGTCTCTTCAGAGGTCAAAGACATGTGCAATAAGGTGAAGCAACAAATAGAGCTGGGAGCTGGAGTCTCTTTTACAACCTACCATCCTCAGAATTATATTACCAAAACGGATCAAAACCCTGCAACAAACACATTTGTGGTGAaggtgtgcgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatttatggagTTTGTACTTACATATTGTTCtaagccagtgtttctcaactggagggaacattttcagtgggtcgcggagtgtgtggtcaaaaaaacaacaaatgtttaatttttaacttatttggcttatataagacttttattttaaaatgcatgagCGACAActgtaccgtttgacatgtgacatttcatttaattatagcaacaaatatgtcgaagcgcaagtacgatcctgaatatgtaaagtatggatttacatatattgacgacaaaaaaggcttaaaacctaaGTGTCATATGTAGTAATGTGCTCTCACAAAAGcacttttagaaaccaaacatttgtcgtttttactttgtaatatttttataatttgatacattttgttaaaagacaataataaaatagtgtttatttctaagtcttggtgaatttcttatgatgtatctgtcactacttgggtatgttaacaaataaatgcaaatgaattataattccttaaattatattatagttcctaaaaaattTGGGTCGCATGTTGATGACCatttaaaaatgtgggtcccaagCCCAAACCAGTTGAAACCCTTTTTATGCTTTCAACATCATCCAACTCTAACCCCTTTGCTGATTTGATTTGTGTGGGTTTTGTCTGCTGGTTTATTGCATCAAATCTATCATGATATCATCTGGGTACTTCACGGCTACTATTTCACCAATACTAagatttcaaatttaatgtatgCTTGGCTCACTTAATGTTTTCCACATGCTACATGTTCGGGAAATATGTGATTTCATATGCAGTCAGATTCatgaataaaatagtaaaatgctTATATTGTCATTGATCCTACTTGATTTACTTATATTCTAATCACCAGAAATATTTCTCAGGAAAAGTTTTCAAAAGTGAACTTGTTTAGTGTTTGTCAGTGTTAAATGTGTGTATTTCTCTTCCTGTCAGGTGGACACTGGAAATTACCAGTGTGTTCATGCAAAGATACTTGAAACCGGGCAAGGATTTACTGTGCCAGAAGTCAAATACCCCCTACCCATCAGTGAGCCTCTGGTACCCTTTTGAACACTTCTGAACCACATACAATCATACTCTGTCTTATAACAGAAATGAAAATCAGAAAGGCTGTTAAAATCTTTTTCATTCCTTAATATCAAAGTCAATATTGACAAATGTAATGATTCGTAAGGAGTTTTATCAtgcatatattcatttataatcGATTAAATCGTTTTATAGtataattgtttataataatCATTGATCATAAATGCTTTATATAACCGTTCATTGATctgtcattttaaacaaatatttcattGTTATACTGTATGATTGTGTTCTTTCAATGGATATTGCTTTGCCTTTGCAAGACTTGTTGTGTGGGACAGTACTTTTttgtctattctattctactgGGTTTGGTCTAATACCAATTGTTGGATTCATGATGATCATGCAAAATCAGcattaaaaactaaatgaataaactCTTCTCAATTACCATCTCTTTGTTTCATGCTTTTTACTTTTCCCTGGCATCCTGT
>TCONS_00059917
CATAAATACTTCATCTATCTGGAATGTCCCATTTTAGTTTTCATCAAACGAACTTTCACCAACAAGTGCTTACTACATGGAggcttatttaaaaacataacttCCCCCTTATAGTTTTCTTATTTGAAATAATATCAATAtcttgtataaaaataaatcacaattggTTTATCAATGTGCTGATATTAGTGAATCAGTTATTTAATAATGAAAGGGCATTATTTACATACAGACTTTATTGCAAAATACTTATTACAATACAGGAATTTATGGTGCTTACTGATGCAGGGAATGGATAGTATCACAATTAATGAGACACAAAGTTAGTGTTCCTGATGTCAAGTATGTCCCTAAGTAACCAAAATAGTATAAAACGATATGTGTCAAAAGCAAACAGTTAAACATTAAACTGCTGGTTACTTTAAAACTAACCTTCGTCTGGGAGATCACAAGGACATAATGATATTTTATCTGTTATCTGGTTGCAGGTGTCAGATTTATAGAATGATGAGGGAGCaaccatttttatttaattaaaagctTAGTGAGAAGTGAAGTGTCAAAAAATCAGCGACGCAATTTAAATTCCACTGAATTTCTCACTGTAACATATTTTGGCCCCTTTGGTGTGATCATGGTATTCCAGTGACACTCCCAGTCACGTGATATTGGCAACATAAATAGTGGATCAGAATCAATCTGAGAGTCAGACTGTGTGATAACACATTTatatttcatgcagactttaatcaGCACCACTGCAGTGATGTCAAGCGAGTGGACCAAGGTGATGCCTGTCTCTTCAGAGGTCAAAGACATGTGCAATAAGGTGAAGCAACAAATAGAGCTGGGAGCTGGAGTCTCTTTTACAACCTACCATCCTCAGAATTATATTACCAAAACGGATCAAAACCCTGCAACAAACACATTTGTGGTGAagGTGGACACTGGAAATTACCAGTGTGTTCATGCAAAGATACTTGAAACCGGGCAAGGATTTACTGTGCCAGAAGTCAAATACCCCCTACCCATCAGTGAGCCTCTGGTACCCTTTTGAACACTTCTGAACCACATACAATCATACTCTGTCTTATAACAGAAATGAAAATCAGAAAGGCTGTTAAAATCTTTTTCATTCCTTAATATCAAAGTCAATATTGACAAATGTAATGATTCGTAAGGAGTTTTATCAtgcatatattcatttataatcGATTAAATCGTTTTATAGtataattgtttataataatCATTGATCATAAATGCTTTATATAACCGTTCATTGATctgtcattttaaacaaatatttcattGTTATACTGTATGATTGTGTTCTTTCAATGGATATTGCTTTGCCTTTGCAAGACTTGTTGTGTGGGACAGTACTTTTttgtctattctattctactgGGTTTGGTCTAATACCAATTGTTGGATTCATGATGATCATGCAAAATCAGcattaaaaactaaatgaataaactCTTCTCAATTACCATCTCTTTGTTTCATGCTTTTTACTTTTCCCTGGCATCCTGT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117459

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00059918 False 2573 lncRNA 0.34 2 4640459 4643289
TCONS_00059917 True 1539 lncRNA 0.34 3 4640459 4643289

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_030782 NA coding downstream 18396 4621430 ~ 4622063 (-)
XLOC_030781 cst14b.1 coding downstream 107943 4523633 ~ 4532516 (-)
XLOC_030780 zgc:153704 coding downstream 146957 4482437 ~ 4493502 (-)
XLOC_030779 apooa coding downstream 221904 4382378 ~ 4418555 (-)
XLOC_030778 srrt coding downstream 343000 4253929 ~ 4297459 (-)
XLOC_030784 NA coding upstream 26982 4670271 ~ 4673865 (-)
XLOC_030785 CU915770.1 coding upstream 42386 4685675 ~ 4697367 (-)
XLOC_030786 CU915770.2 coding upstream 71443 4714732 ~ 4734142 (-)
XLOC_030787 NA coding upstream 221581 4864870 ~ 4907610 (-)
XLOC_030788 zbtb43 coding upstream 277803 4921092 ~ 4931266 (-)
XLOC_030772 CU655870.1 non-coding downstream 703863 3935917 ~ 3936596 (-)
XLOC_030767 FO704648.2 non-coding downstream 970221 3660658 ~ 3670238 (-)
XLOC_030764 NA non-coding downstream 1085650 3553600 ~ 3554809 (-)
XLOC_030763 NA non-coding downstream 1138624 3473865 ~ 3501835 (-)
XLOC_030789 BX511196.1 non-coding upstream 299309 4942598 ~ 4942712 (-)

Expression


Co-expression Network