XLOC_034657



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_034657
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 20234414 ~ 20239135 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


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Function


GO:

id name namespace
GO:0034587 piRNA metabolic process biological_process
GO:0035770 ribonucleoprotein granule cellular_component
GO:0005634 nucleus cellular_component
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GO:0034584 piRNA binding molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117632

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00068674 False 4436 lncRNA 0.37 3 20234414 20239119
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TCONS_00067464 True 4562 lncRNA 0.37 2 20234414 20239135

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_034655 acap1 coding downstream 76034 20058857 ~ 20158380 (-)
XLOC_034656 BX322601.1 coding downstream 100551 20132336 ~ 20133863 (-)
XLOC_034654 NA coding downstream 183619 20045387 ~ 20050795 (-)
XLOC_034653 trip6 coding downstream 212964 19978434 ~ 20021450 (-)
XLOC_034651 snx15 coding downstream 268008 19953756 ~ 19966406 (-)
XLOC_034658 si:ch73-335l21.4 coding upstream 780 20239915 ~ 20241413 (-)
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XLOC_034661 cnpy4 coding upstream 220536 20459671 ~ 20464468 (-)
XLOC_034662 NA coding upstream 263145 20502280 ~ 20574689 (-)
XLOC_034652 CR339062.2 non-coding downstream 278222 19956078 ~ 19956192 (-)
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XLOC_034665 NA non-coding upstream 390360 20629495 ~ 20667696 (-)
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XLOC_034673 BX005336.3 non-coding upstream 1584228 21823363 ~ 21823527 (-)

Expression



Co-expression Network