XLOC_004033 (tmem259)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_004033
gene name tmem259
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 14071689 ~ 14102158 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00007694
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>TCONS_00007695
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Function

symbol description
tmem259 Predicted to be involved in positive regulation of ERAD pathway and response to endoplasmic reticulum stress. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in endoplasmic reticulum. Orthologous to human TMEM259 (transmembrane protein 259).

GO:

id name namespace
GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress biological_process
GO:1904294 positive regulation of ERAD pathway biological_process
GO:0005783 endoplasmic reticulum cellular_component
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0003674 molecular_function molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-080225-14 Predicted to be involved in positive regulation of ERAD pathway and response to endoplasmic reticulum stress. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in endoplasmic reticulum. Orthologous to human TMEM259 (transmembrane protein 259).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000060442

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00007694 False 6270 mRNA 0.41 12 14071689 14102158
TCONS_00007695 True 5237 mRNA 0.42 11 14072782 14102131

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_004032 CR555295.1 coding downstream 270887 13798453 ~ 13800802 (-)
XLOC_004031 sid1 coding downstream 453277 13616015 ~ 13618412 (-)
XLOC_004030 si:ch211-1a19.2 coding downstream 460557 13605623 ~ 13611132 (-)
XLOC_004029 BX530062.1 coding downstream 588902 13482671 ~ 13482787 (-)
XLOC_004028 mast3b coding downstream 730206 13280248 ~ 13341483 (-)
XLOC_004034 NA coding upstream 45505 14147663 ~ 14148426 (-)
XLOC_004035 NA coding upstream 206739 14308897 ~ 14311237 (-)
XLOC_004036 NA coding upstream 328764 14430922 ~ 14432200 (-)
XLOC_004037 adora1a coding upstream 564908 14667066 ~ 14669026 (-)
XLOC_004038 CR550307.1 coding upstream 591323 14693481 ~ 14695864 (-)
XLOC_004019 CR450764.8 misc downstream 1379998 12691395 ~ 12691691 (-)
XLOC_004015 CR450764.4 misc downstream 1449922 12621518 ~ 12621767 (-)
XLOC_004013 CABZ01022569.1 misc downstream 1480393 12590999 ~ 12591296 (-)
XLOC_004008 BX000700.19 misc downstream 1558427 12512966 ~ 12513262 (-)
XLOC_004006 BX000700.27 misc downstream 1571427 12499966 ~ 12500262 (-)
XLOC_004063 CR854846.1 misc upstream 2025224 16127382 ~ 16127678 (-)
XLOC_004024 CR450764.5 non-coding downstream 1315414 12756143 ~ 12756275 (-)
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XLOC_004039 NA non-coding upstream 652747 14754905 ~ 14759088 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000051_07836858_07853522 TMEM259 coding CI01000051 null 7836825 ~ 7854111 (-)
bowfin (Amia calva) AMCG00006142 tmem259 coding CM030142.1 CM030142.1 16707608 ~ 16722360 (+)