LOC120558399 (bfar)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120558399
gene name bfar
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053112.1
NCBI id CM020909.1
chromosome length 48724115
location 13870863 ~ 13882237 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

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Function

symbol description
bfar Enables caspase binding activity; protein-macromolecule adaptor activity; and ubiquitin protein ligase activity. Involved in negative regulation of IRE1-mediated unfolded protein response; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; and protein ubiquitination. Acts upstream of or within negative regulation of apoptotic process. Located in endoplasmic reticulum and membrane.

NR:

description
PREDICTED: bifunctional apoptosis regulator

GO:

id name namespace
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K15684 BFAR; bifunctional apoptosis regulator

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039799381.1 True 3265 mRNA 0.43 9 13871014 13882237
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XM_039799404.1 False 3167 mRNA 0.43 8 13871013 13882237

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120558373 LOC104926850,LOC103373325,LOC102192825,LOC101480165,LOC100695253,LOC102795131 coding upstream 190650 13674528 ~ 13680213 (+)
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LOC120558420 LOC103367025 other upstream 334614 13521955 ~ 13536249 (+)
LOC120568539 LOC102799075,LOC104938193,LOC103359245,LOC101486854,LOC102208768 other upstream 598689 13183961 ~ 13272174 (+)
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ccdc85al LOC108236309,LOC102779450,LOC100689955,LOC101467130,LOC103358060,LOC104952295 other downstream 2197723 16079960 ~ 16105356 (+)

Expression


Co-expression Network