G151318


Basic Information

Item Value
gene id G151318
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 3214900 ~ 3261498 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU205034
agttgagatcagaggatgttgagtgaatcagaCTGgcttatgtcaaagtttagtcaggatactgttttaaaaccatttaaacatgattattaattaaatttaataaaacacccaaaatgtaataaaagtaatcattaatttgacGTGCAAAGATCAGccatgcatccaagttatttttggccattttggttcaaagaaactcatgtttctgatataaaaaactttgaaaatgggtcaaatttgacccgaagacataACAAAGGGTGAtttaaaagtagctgttttTCTCCTTCCGACCAGAAATGTGATCTTCTCTTTTGGGCGTGCATCTCTACCTACAGCCCTGCAAAaggttggctggttggtttgtgtacagtaaccatagcaacgcacagagctgaccgtaagccgtaaacaggcaagaagCCGTAAACTGTcccaaactgcagtaaaaacacTAATTGCGACGCAGAttctgaatgcgctgtatacatgtcgaAAGAATTCttctaaaacccgaataataccgACATACCCCACATGTCTTAACCCTCCTGCTGTCCTCGGGTCAAGTCTGAccccttttcaaagttttctatATGAGAAATTtaggtttctttcaacaaaattgccccaaaataacatggatgGtacaattcaaatgtttaaaaagcgTCAAAACTGTCAAAAGCCATTGAAAGTAGAGTGCatatcgggccgcatttttctgtctgagcacgacccgcgtccgacagagcagtaaccgagccCGACCGAACCCgacagttaaaataaaaaaaaataaaaaatacagcctagggtctttttgtgaatgtacccaagtcaaactttggtttaaaagcataattaggacagaagcgccacttttaagatttaccgtattttcgtttttcggtcaaatggccttttgaatgggagtgctaggggcacctttatgctagcctcaaaatagctatttttaaaaccctaagaaggctcgacacaacatgagactttgctccaagtatcaccaggagctctacaccttaacgaaagcattgacaacattgtttgtgtacccagagttcatgctggagttcatgtgtagagcccccggtgatgtcaacagatgaggcatcagcgcacacggggcaacaagcgcatgttaacacaggcgcacacCTTACATAATAAgcagttttaaatttaaaatgttcaatgccttatcgcgctgatgtgaccgagcccgacccgaaccccgacatcatttctaaatatctgtccgaaccggGCCGGGTATCCATTCTCTAGTTGAAAGCAGAAAAAAGCGTCAAACAAGGTGATAACAATGTTTGAAACGGCGTCAAAAACGTGAAAAATCTTGAAAAACACACGGAAGAATGTGTCGAAAAACTtgaaaaagtgttgattttcagttttgacccgggaggacaacatgagggttaatcagaaaatgctaaattttgagaaaaaaaaggccttattctgaATAGCCAAACGGAATATGCAGTTtgcatgacctgtatcaaatccagaatattgtcatattcggaataatagtggaatattagtgtgcatgtaaacgtactcatTAAGAAACAAAGATGCATCAGCCATGTTGGAAAATGTGCACAAATGGTATTGTAATGTAGGCCCGTGTATGTTCAGTGTGTTGAAtatatgaaaaacaaaatgcatgTCTGACACTGTACatggaaaatgaaagaaaaactgaaaaaacaaacaaagcagaCCTTAAGGTGGTGAACACTGTGAACAACTTTTCAACAGGCAAACTGTAATGTATGTTTAAAACCAGCaggtagggatgtaacgatacacCTCACGCATGATTTGATTCACGGTTTGTAAGATTTTCTCAGGATTTCTCATACcgaatgagctgcagacaaacgagtgaaaaatattccttttatttctataaactgcgcaaaacaacagatgtggcctcttatcaaaagtgacactggaattgtatttcatttttttgttattagattttctaaaacaaatcccacatcaaaaataactcgataaatagaaataaatctcttcaaataaataaagtaagaaCACATAGTGACATCTGAAGTCTAACAAGTGAAATCTAAAGTAGATTAGGCCCTAGGAGGACGTTTTAAAAATCGCATCaggattcattttgttttatttctgccGGTTGTAATCTTCCCACATTTATATCAATTTTTAACGGAttccaacctgatctcacagaattcgtGAAATTAACATGAAAATCTGTGGTAgttgtcactgcccgatgtgagtcgagtgcagatgtgagtcgcgcatgctcagatttcaACGGTTTACTGCATAACATGTCATAcggaaatttgtgaaatccataaaataataaacgtttctctttacatacaataacagaagatggaaatcatttcaaaaacgttgtagctatctatgattgtttgattgctaacgttagctcaaaacaccaTTCAAGTGATGGCCTTTGTTGTGtatgattgctaacttgtagccagcagcagcagtcatttcaaaaacgttttagctctctatgattgtttgattgctaacgttagctcatcgACTGTGCGTTAGCTCAAAAAGCAGTTAGCATCTtggaggctacttgtcgcaaagtgacgcatgcacaactcacatctgcactcgtcgaAAAGTGACGCATGTGCGACTCAAATTTgcgctcgactcacatcgggcagtgacaacaGTTTCATGGAATCGCAAAACATtcccgtgatgggcccacggaagaattccatTAAATAAACACGGCCCCTTTAAGTTAatgaaaaggtcgtgggtgggcttaggAAATTTTCCCACATTgtgtgccaccaccacgtaatgcgctgttaacagttcgtgatcatttcacggcCAGGCTGACGGATTcacgatgcatcgttacatccctacgaGCAGGATTCTGTTATGAATGGGCATTACTCACATTATCCGCTCCAGGGCCATCCTTTAGTTCAGTGGAAATTGTAAAAGAGTTCCAGCTTGTGTTGTGTAGTGGAGAACACATCAAACTCATACTGGAAACTGGACCAAGACACCAACATGTTTGGTGAATCAGCCGGTGTGCTTGGGATCTGTTTAAGGGCTGAATTTGAGTGGAATTAAGAGTTAGATTTAAGATGAACTTGCACAGGGACACTATGCAATGTGCTAATATTAAtgccacatttttatttttggtgtcCCCAATTACTAAGTTTACACTGTGCTCCAGACAAGAAGAGAAGACAAAGGAACAAGGGTTGCAATAAGCCAAACGTTGTCTCCATTGATCGTAGTGAAATGTGCAATTATATATTTTAGGCTGTAAAGTGAATACACTAGTGTGTTTGGTCAGGAGACAAAGTGCATAAAGAACCATTCTGAAATAGGAGGGTGTAGGCTAGAAATGCTCTTTCActcaggctacatctacactactacgttttggtttaaaaacgaaTATTTTTTGCTAAGTTTACGCCTCGTgtttagcctgacaagccagacccacatccagatgttgggtctgggaactcgccattggcagggctcaatccgaggggcgggataaacggttgtcttttaaATTCCATCTTCACGctataggatagcgctacaaccaattagcgtctagatttctaggctagtaaGTCGGTCTTATCGGTTAGGCAGCTTACGGACCTCGTCGTCGCTCCAAGATAATGAATCAATTGCTATTACTTCTCACCGTTCTgtctccaaagtattttctgtgttttcaaATTCTACATCCATGATTATCAACCAcagagtaacgtcagacaatctgcttcctgtttacaccgacacacacatgcccagtgtgtgtgaatggtcatgTGCAGGGCTTTAAATGGACTTCtttgatcaccagccaacatggctagtagatttttaaagttaccagccaattAGACTTTTCCCTAGCCTCacgtttgttttagttttttccctAACTAACTTTACTTTAATCTCAGCTCCTCTTGTTTGTTTCCTTCCGTTCGTCTTCTCTGTTTCAGTGTAGCTCGTAATCGATACCTCACGCTCTGAACGTAGCCAACGGTTGTACGACACGTCACGACATACTGCTCATGGAAAATGTACGATCagggggagcgtgcctatgcgtgcctattttttttctaaattaggccctatgttcctacatttctaagatttttttttttttcactgaaaattaggctctatgttcccacagttaccacatttctaagattttttttttccaaaattaggccctatgttcgcACATTTATCAGATTTGagccccctttctcccaatttggtaaccaattacacccaacatattatccagtagcaatggactacagatggactgtaaccctaacatagggccttattttaagaaaaatcttagaaacgtgggaacatagggctgtgggaccattgggctgaccCCGGATCAGTACTACAAGCAGCGTTGTCGGATAAAGATTATGTTTCCAAGccaaacgcacacaaaaacgCCCAAAATCTTTTGGCGGAAAACCGACCAATCTGGCGACATTTCTGCAGCCGGCCGATTCAAACAGATACAGAGTTATTTGCTTCATTCATCACCGGCCAAATCGGCTAGTGACTTTACAATGTTACCCGACAAatcaatttaaagccctggtcatgtgatatgtgatgtcagacgtgttaatacggacagagattagttctgctactggagctgaaactcttgtgtggacggagatcgttttttttgtctcaaaaatgccgcttaaaaatgaaaacgtagCAGCGTAGATGTAGCCTTAACTCTTTTCTATTTATgcagatgtacagtatattgtgtAATGTTACGTGTGAAGGAAAAGTGCCAGTCTTTATTTAAGAATGatgtgatttctttt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>TU205035
AAGCTGTGGTGCGCGgtgcttcctccagctctgctcctcagttccctcctcctctttaacccttgtgttgtcttcccgtcgactaTGCACCATTGGCCAAAATTTACATTTGGGTTcgtctagatttctaggctagtaaGTCGGTCTTATCGGTTAGGCAGCTTACGGACCTCGTCGTCGCTCCAAGATAATGAATCAATTGCTATTACTTCTCACCGTTCTgtctccaaagtattttctgtgttttcaaATTCTACATCCATGATTATCAACCAcagagtaacgtcagacaatctgcttcctgtttacaccgacacacacatgcccagtgtgtgtgaatggtcatgTGCAGGGCTTTAAATGGACTTCtttgatcaccagccaacatggctagtagatttttaaagttaccagccaattAGACTTTTCCCTAGCCTCacgtttgttttagttttttccctAACTAACTTTACTTTAATCTCAGCTCCTCTTGTTTGTTTCCTTCCGTTCGTCTTCTCTGTTTCAGTGTAGCTCGTAATCGATACCTCACGCTCTGAACGTAGCCAACGGTTGTACGACACGTCACGACATACTGCTCATGGAAAATGTACGATCagggggagcgtgcctatgcgtgcctattttttttctaaattaggccctatgttcctacatttctaagatttttttttttttcactgaaaattaggctctatgttcccacagttaccacatttctaagattttttttttccaaaattaggccctatgttcgcACATTTATCAGATTTGagccccctttctcccaatttggtaaccaattacacccaacatattatccagtagcaatggactacagatggactgtaaccctaacatagggccttattttaagaaaaatcttagaaacgtgggaacatagggctgtgggaccattgggctgaccCCGGATCAGTACTACAAGCAGCGTTGTCGGATAAAGATTATGTTTCCAAGccaaacgcacacaaaaacgCCCAAAATCTTTTGGCGGAAAACCGACCAATCTGGCGACATTTCTGCAGCCGGCCGATTCAAACAGATACAGAGTTATTTGCTTCATTCATCACCGGCCAAATCGGCTAGTGACTTTACAATGTTACCCGACAAatcaatttaaagccctggtcatgtgatatgtgatgtcagacgtgttaatacggacagagattagttctgctactggagctgaaactcttgtgtggacggagatcgttttttttgtctcaaaaatgccgcttaaaaatgaaaacgtagCAGCGTAGATGTAGCCTTAACTCTTTTCTATTTATgcagatgtacagtatattgtgtAATGTTACGTGTGAAGGAAAAGTGCCAGTCTTTATTTAAGAATGatgtgatttctttttctttttctttacacTTAAATGTATAATATGCAATCCAATAGTGCCCAGTTTTATAAAACAGGGGACTCTTAGTGTCAGTGATACAGTAGTAGAGTGTGTTGAGACAATATTTTAGTGCGTGAGGTCGTGTTTGTTTCTTGTGTAGTATAGAAAAAAAGATCTCGATAGTTTTTGGACACTATGCAGGATCAGACCTAGTACCCCTATAGGGCACTAATCTGTCTTAGGCTGCCACCTTGTGGACGACATGTCTCATTACACCAACTGTACTGATGCGCAAAGAAAGGAGGGTGTACATTTTGCCTGGGGATCTTTCCATTTCATACATTATTATTCGGATGCATAATTCTTGTGTTGACGAACCCATTCAGATCAATTTCACACGAGTTGTCCAGTCTGAGCTCTTTAGACTAATATCCCAATGTTGgatctgtgtttttttgggggggggggggttctgtgTGATGTGAGAAAATTGCACtttattttgtgtcaaatattttaatttttttttacttattgctca

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU205034 True 5527 lncRNA 0.40 2 3255949 3261498
TU205035 False 1938 lncRNA 0.41 2 3214900 3261498

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ubn2b NA coding upstream 228047 2957932 ~ 2986853 (+)
rpsa rpsa coding upstream 261390 2947411 ~ 2953510 (+)
LOC120574090 LOC101479176,LOC102292774,LOC102776828 coding upstream 273281 2931036 ~ 2941619 (+)
LOC120574089 LOC103376082 coding upstream 286703 2873955 ~ 2928197 (+)
txn2 LOC104942977 coding upstream 353831 2843580 ~ 2861069 (+)
smarca4a smarca4 coding downstream 22110 3283608 ~ 3321386 (+)
kri1 kri1,LOC105353547 coding downstream 107316 3368814 ~ 3384569 (+)
LOC120575509 NA coding downstream 119789 3381287 ~ 3381386 (+)
LOC120575510 NA coding downstream 121016 3382514 ~ 3382613 (+)
spc24 NA coding downstream 123941 3385439 ~ 3395693 (+)
G151321 NA non-coding upstream 7435 3206499 ~ 3207465 (+)
G151312 NA non-coding upstream 69295 3145254 ~ 3145605 (+)
G151292 LOC103364965 non-coding upstream 73195 3122742 ~ 3141705 (+)
G151247 NA non-coding upstream 199378 3005618 ~ 3015522 (+)
G151244 NA non-coding upstream 216641 2998057 ~ 2998259 (+)
G151330 NA non-coding downstream 60697 3322195 ~ 3322400 (+)
G151336 NA non-coding downstream 152703 3414201 ~ 3414537 (+)
G151411 NA non-coding downstream 168860 3430358 ~ 3430648 (+)
G151414 NA non-coding downstream 172597 3434095 ~ 3434380 (+)
G151430 NA non-coding downstream 273422 3534920 ~ 3537915 (+)
G151315 NA other upstream 66923 3146504 ~ 3147977 (+)
junbb LOC103364966,LOC107087652,LOC104932219,LOC100707881,LOC105929935 other upstream 110308 3083898 ~ 3104592 (+)
G151240 NA other upstream 211536 3001899 ~ 3003364 (+)
G151122 LOC103375031,LOC102776069 other upstream 412679 2799469 ~ 2802221 (+)
LOC120574078 LOC103371863,LOC106930631,LOC103154952,LOC106957020,LOC105929964 other upstream 523338 2645826 ~ 2691562 (+)
ldlra ldlr other downstream 69506 3331004 ~ 3357195 (+)
G151471 NA other downstream 397499 3658997 ~ 3663282 (+)
G151695 wbp11,LOC102783903 other downstream 1056675 4318173 ~ 4319498 (+)
LOC120574173 NA other downstream 1076583 4338081 ~ 4346405 (+)
pde6hb LOC104937730 other downstream 1138532 4400030 ~ 4469278 (+)

Expression


Co-expression Network