ammecr1 (ammecr1)


Basic Information

Item Value
gene id ammecr1
gene name ammecr1
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053127.1
NCBI id CM020924.1
chromosome length 37730433
location 26574929 ~ 26612717 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU229028
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>TU229030
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Function

symbol description
ammecr1 Human ortholog(s) of this gene implicated in midface hypoplasia, hearing impairment, elliptocytosis, and nephrocalcinosis. Orthologous to several human genes including AMMECR1 (AMMECR nuclear protein 1).

NR:

description
PREDICTED: AMME syndrome candidate gene 1 protein

GO: NA

KEGG:

id description
K24611 AMMECR1, AMMECR1L; AMME syndrome candidate gene 1 protein

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gabrb4 LOC107386622,LOC101472660,LOC103367791,LOC103394735,LOC103133907,LOC106949245,LOC107571379,LOC106523114,LOC107713123 coding downstream 40888 26297439 ~ 26534041 (-)
LOC120544066 NA coding downstream 298969 26270988 ~ 26275960 (-)
mpp1 mpp1 coding downstream 323060 26240349 ~ 26251869 (-)
pcolcea LOC103363028 coding downstream 354209 26214114 ~ 26220720 (-)
LOC120544213 LOC104942368,LOC103363032,LOC106949254,LOC108233826,LOC103475896 coding downstream 411222 26161865 ~ 26163707 (-)
si:dkey-175m17.7 LOC103363373,LOC104926337,LOC104958000,LOC102781095,LOC101468104,LOC102297217 coding upstream 90238 26702955 ~ 26721404 (-)
slc8a4a LOC103363370 coding upstream 122725 26735442 ~ 26759988 (-)
tm7sf2 tm7sf2,LOC102779860 coding upstream 174691 26787408 ~ 26801749 (-)
vps51 vps51 coding upstream 189540 26802257 ~ 26807914 (-)
frmd8 frmd8,LOC102779292 coding upstream 199488 26812205 ~ 26823192 (-)
G168907 NA non-coding downstream 42430 26529707 ~ 26532499 (-)
G168876 NA non-coding downstream 291747 26282854 ~ 26283182 (-)
G168856 tmem88,LOC104942396,LOC103394747,LOC105024597 non-coding downstream 371125 26201627 ~ 26203804 (-)
G168800 NA non-coding downstream 598472 25972341 ~ 25976457 (-)
G168774 NA non-coding downstream 659550 25880884 ~ 25915379 (-)
G168963 NA non-coding upstream 64546 26677263 ~ 26681142 (-)
G168966 NA non-coding upstream 74662 26687379 ~ 26688825 (-)
LOC120543914 NA non-coding upstream 440329 27053046 ~ 27056568 (-)
G169118 NA non-coding upstream 636098 27248815 ~ 27288981 (-)
G169119 abr non-coding upstream 660846 27273563 ~ 27284502 (-)
vamp2 vamp2,mpp1,LOC103367795,LOC104941032,LOC107742350,LOC107720682,LOC107082578,LOC107386619 other downstream 338735 26224819 ~ 26236194 (-)
pcdh1a LOC103357738,LOC108233889,LOC101479736,LOC102299879 other downstream 851711 25623735 ~ 25723218 (-)
LOC120544362 msi2,LOC103475888 other downstream 1670076 24655803 ~ 24904853 (-)
LOC120543987 NA other downstream 2078347 24490560 ~ 24496582 (-)
radx LOC103366308,LOC106923634,LOC103133962,LOC106955728 other downstream 2169052 24395776 ~ 24405877 (-)
G168964 NA other upstream 68797 26681514 ~ 26684956 (-)
gng3 gng3,LOC107559409 other upstream 76162 26688879 ~ 26693041 (-)
flrt1a flrt1,LOC104926332,LOC103360355 other upstream 257833 26870550 ~ 26941207 (-)
emc6 emc6 other upstream 903173 27515890 ~ 27519001 (-)
pigw pigw,LOC107090330,LOC102785725,LOC102220786 other upstream 1055964 27668681 ~ 27701551 (-)

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