AMCG00002965 (eif4ebp2,LOC107564345,LOC107668794,LOC107716353)


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00002965
gene name eif4ebp2,LOC107564345,LOC107668794,LOC107716353
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030139.1
NCBI id CM030139.1
chromosome length 23121578
location 8037577 ~ 8044413 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00002965
GACGGCTGGGAGGACAGACGGAGAGACGAGAGAGCTTTGCAAAGGGAGataaagagaaggaaaagacCCGGGTTTCCACCGTCCCTCACCTTTACTACTTTAACAGTTGATATATAACCGTTTCGGGTGAAATGTCGTCCAGTCGTCAGCACAGTGAAAGCCGGGCCATTCCGACCAGGACGGTGCTGATCAACGACACAACGCAGCTACCTCACAATTACTGCACCACCCCTGGGGGCACTTTATTCTCCACTACTCCAGGAGGTACCAGAATCATCTATGACCGTAAGTTCCTGTTGGATCGGCGCAATTCCCCCATTGCCCAGACTCCTCCAGCCCACCTTCCTGACATCCCTGGAGTGACCAGTCCAAATACcgcaattgaaaataaaaagaatgagGCAAATAATGTGAATAACCATGAGGGCAAGCCAGGTGTGGGAGATGATGCTCAGTTTGAGATGGATATCTAACATGAAGAATCAAAGTGAAGAACTTGACATCATCTGGTACCTGTGTGCCAGTGGCTTGGCTTGAACCATGCTGTGAGCCCTCACAGCCATCTCATTAAAGTCTCTCTTAGCCTGCTGAGtgcaaaatgtatgttatgAGATAAATCTATAATTATTTCAGTCCAACTCAGAAAACACATAGATTAATGTGGGTTGTTCCATCTGATTTGATTTCAGAATCACTTATAGAATATAATCTTAAACATGGATTTCCAAATTTCACAATTGATATGTAGGGTAAGAtctgtatataaaacacaacaatgagggaaaacaacaactaaataaatgagtacaaattcatgcaaattaaagtaaagtaaataaagcaataaattGAGTTATTTTTCCAGGTGATAAAATGTCAAACTTAATTTTTCTTGACATTGCCTTAGCCACACTTTTCTGGAACATCCCTGATTGGTCCACTCCTAATGTGTGTGCTGCTTTCTGTGGAACAAAAGTCAGACTGTGGATTCAGCCCAGGGAAATTACTCAATTCAAAGCCAATTGATTCTGCTTTTCATTGGTTGTGCCTGAAGCCCATTGCTTTAATGGTGGGTTGAATCCCAGTGTTCTGTGGGCTCTAgttgttgtaaatgtttttcctgGAAATTTCCAGgctgcctgttttgttttgttttctgttatcaGCTAttgttccattattattatttttaacttgaaaacaacatttcagaCTCTTATTTAGTTTCTGAATGATGATTTGCCTAGCACATTAAATAAAGGGAAATCTGTTGCAGTAGGCTGCTTTTATTTGTAAGAGAGGCAGAATACTGCATTGTCATTCCAAGACCAGAATATATTTAGATCACAAAACATAACTTagacatgcattttgtttgtttgaaatgttctgtgtgGTACTGTTGTCTAGGTAATGATACTGGTCAAAGCTGGTTTAAAAATTCAACAGCCAACTGGTTCTGCTAACAGTACTGCTTAGATAATGGTTGAACAAAGAAATAACTGGATtctaattaatgttttgttctgGTTTTTCTTGTTACAGgccaaaaaaaagtttttgaaagCGAgaatcatttatgttttttttttttttttttaataaaaatatggaccttattattttgttttaattgcatttcaaaagcttTGTGTTAGAATTAAAACTACAAATGCAAGCTAATTGGGAAATTAtgataatgtaattttacaggAAATCACATATTAGTATTtgacaccatttatttttatttcaaaaaagcATTTAAGGTTTTTCTAAGGATGAATTATGCATCTTGGTGCAAGTTATAAAATAACTGATCTTACTATTGAAATGCAAGGAAAATTTGGGATggctgctttttgtttgtttattttgttttgggttttaaatGTGGACTTAGTTTGTTGAAGAAATTTGCCAGATGTtgagaaatgtgaaatacaaaattgatTTCATGAATCTACAACAATTAAGCATGGTAATGAGAAAGCTATTCCCAAGATGCACTTTTTTTCTGATTGAAttctgcacacatacacaaacaaaatctgtgaCCAGTATAAACCATTAATGGCTTAATTGTCTCTGTAGGTAAACTATATGTTTATTATAGAGGGCCTTTAACTGGGGGGAAACAGGTGGGATTAAAAGCAACAGGAGCTATATTATTTTGTCCTGTATAAGTTACCAAAATAGCGGGTGATTCTTGAGAATTAGAAGATTTGCAACATAAAGGATTTTTTCCTCAAacaatggaaaattaaaaccaGGTAGTCCCTTGACAATAGTTCCTAAAACAACCAGGAACTCAAGTTCTTCATTTgtaagtgtttatttctgaatcAGATCAAAAAGTTTGAAAACTTGAAATGTCTATGCATTTGTTTCAGCTGTGTAATTCTTTGTTCTGACAAACATTATTGAAAGACATGCGTGTTTATCTTACTGTCGAGtcacaaaaccaaaaaggtaaaacatttataaataactaaacaaaacatgactTACAATGAAACTAccagaacaggaaaaaaatgtatgaagtgACAAATCCAAATATTTgccaaactaaaataaaaagtgagatTTACTTTTAAGCAGAAGTTTGAGAGCAAGAATCTCAATCTTAAAGTCATTTAAGTGTTTCCAAAACATCTCAGAGAGGTGATTATTGAAACCTCACATTTGATTTTCACTTATTTGGatatagttttaatatattaaacagaaTTGTGCGCCCATGCCTTATGTCAGTTAACTCAACTAAAAGGTAATTCCTGATCGGAAAATTGGGACACTTTTCAGGCTGAACAAAAATAGATTCTAGCCTACAATTCCagaatttagtttagttttttgtttttattgttttatttattttgccagtaaaatacatattcagcatTTATCGCAGGatgatattaatacatttattaatattcagaaaatacattaggCTTTTGTCGAATTATACCACTGTTAGAATCTGTTCATGATACCTGTACAGAGGTGGTTTTCCGTTTTAACAGTGAtcagatcatttttattttactttattactcAAATGGATGCTAAATTCAACAAGTTGTTAAAGCAGCCCCTTTGTGGTACATATACAGTACTTCAATTCTGAAGTTATTTATTGAATGTCCTGTCTTGGTTTCTTCCCCCATAACTAAATGACATACTTCATGAATTTGTAAAGCAGTGTTTGCATTTGTCATAAGCACACTTCAGATATAAAAGGAAACCAGCTGTTGGCCTATTTGGCCTTAACTTTTTTACATTATGGAGCAAACGGAAgttgttttaaaactgaaagctccatatgatttttttttttttttcaaaacctttGTAATAATACAGTGTATTTTCAAGGAAATGCCAATGCCAGTGGACACTGTTACAACAAGATCAATAAAAGTCCTTGTGATAAGGATGTCATAACAATTGTGATGATcttatgttttttccccattgcATTTAATCGATGTTACCACGTCACCTTAAAGGTGTTTTTCAGtaactttattttgcatttagcACTATAAGTATATTTACTGTTATCAGCACAGTTCTGTCTAATGACCAGTTTTCAgacattgcatttttatatgactgtttaataaattaagttagttta
>TU175890
GTCTGGAGGAGCGTGCACTAGCTGCTCTTTTACTGCGatataaaattaatgttaaagcAATGCTTATTTAATCAAAGTCGTAAAGCATGCAAGCTATCATTCTGCAAAGTGCAGGAGAGTGGGATAATGCAGCGCCCCTGGGATGGAAATGGGCTCAGTATGCCCGCAGAAAACAGCTCTTCAACAACAATAAGGCAATGCAACCTAAGCAGGGTCAAACATTTTAAGATCCAGCAACAAAAACTAAAGCAGCtgaccTCCACACGTGCTGTTTGGCGGTGACGTCACTTCCCGTTGCCCGTGTGTTGTGCTTCCTGGCGGAGGGAGGGGACCGTGCTGACGGCTGGGAGGACAGACGGAGAGACGAGAGAGCTTTGCAAAGGGAGataaagagaaggaaaagacCCGGGTTTCCACCGTCCCTCACCTTTACTACTTTAACAGTTGATATATAACCGTTTCGGGTGAAATGTCGTCCAGTCGTCAGCACAGTGAAAGCCGGGCCATTCCGACCAGGACGGTGCTGATCAACGACACAACGCAGCTACCTCACAATTACTGCACCACCCCTGGGGGCACTTTATTCTCCACTACTCCAGGAGGTACCAGAATCATCTATGACCGTAAGTTCCTGTTGGATCGGCGCAATTCCCCCATTGCCCAGACTCCTCCAGCCCACCTTCCTGACATCCCTGGAGTGACCAGTCCAAATACcgcaattgaaaataaaaagaatgagGCAAATAATGTGAATAACCATGAGGGCAAGCCAGGTGTGGGAGATGATGCTCAGTTTGAGATGGATATCTAACATGAAGAATCAAAGTGAAGAACTTGACATCATCTGGTACCTGTGTGCCAGTGGCTTGGCTTGAACCATGCTGTGAGCCCTCACAGCCATCTCATTAAAGTCTCTCTTAGCCTGCTGAGtgcaaaatgtatgttatgAGATAAATCTATAATTATTTCAGTCCAACTCAGAAAACACATAGATTAATGTGGGTTGTTCCATCTGATTTGATTTCAGAATCACTTATAGAATATAATCTTAAACATGGATTTCCAAATTTCACAATTGATATGTAGGGTAAGAtctgtatataaaacacaacaatgagggaaaacaacaactaaataaatgagtacaaattcatgcaaattaaagtaaagtaaataaagcaataaattGAGTTATTTTTCCAGGTGATAAAATGTCAAACTTAATTTTTCTTGACATTGCCTTAGCCACACTTTTCTGGAACATCCCTGATTGGTCCACTCCTAATGTGTGTGCTGCTTTCTGTGGAACAAAAGTCAGACTGTGGATTCAGCCCAGGGAAATTACTCAATTCAAAGCCAATTGATTCTGCTTTTCATTGGTTGTGCCTGAAGCCCATTGCTTTAATGGTGGGTTGAATCCCAGTGTTCTGTGGGCTCTAgttgttgtaaatgtttttcctgGAAATTTCCAGgctgcctgttttgttttgttttctgttatcaGCTAttgttccattattattatttttaacttgaaaacaacatttcagaCTCTTATTTAGTTTCTGAATGATGATTTGCCTAGCACATTAAATAAAGGGAAATCTGTTGCAGTAGGCTGCTTTTATTTGTAAGAGAGGCAGAATACTGCATTGTCATTCCAAGACCAGAATATATTTAGATCACAAAACATAACTTagacatgcattttgtttgtttgaaatgttctgtgtgGTACTGTTGTCTAGGTAATGATACTGGTCAAAGCTGGTTTAAAAATTCAACAGCCAACTGGTTCTGCTAACAGTACTGCTTAGATAATGGTTGAACAAAGAAATAACTGGATtctaattaatgttttgttctgGTTTTTCTTGTTACAGgccaaaaaaaagtttttgaaagCGAgaatcatttatgttttttttttttttttttaataaaaatatggaccttattattttgttttaattgcatttcaaaagcttTGTGTTAGAATTAAAACTACAAATGCAAGCTAATTGGGAAATTAtgataatgtaattttacaggAAATCACATATTAGTATTtgacaccatttatttttatttcaaaaaagcATTTAAGGTTTTTCTAAGGATGAATTATGCATCTTGGTGCAAGTTATAAAATAACTGATCTTACTATTGAAATGCAAGGAAAATTTGGGATggctgctttttgtttgtttattttgttttgggttttaaatGTGGACTTAGTTTGTTGAAGAAATTTGCCAGATGTtgagaaatgtgaaatacaaaattgatTTCATGAATCTACAACAATTAAGCATGGTAATGAGAAAGCTATTCCCAAGATGCACTTTTTTTCTGATTGAAttctgcacacatacacaaacaaaatctgtgaCCAGTATAAACCATTAATGGCTTAATTGTCTCTGTAGGTAAACTATATGTTTATTATAGAGGGCCTTTAACTGGGGGGAAACAGGTGGGATTAAAAGCAACAGGAGCTATATTATTTTGTCCTGTATAAGTTACCAAAATAGCGGGTGATTCTTGAGAATTAGAAGATTTGCAACATAAAGGATTTTTTCCTCAAacaatggaaaattaaaaccaGGTAGTCCCTTGACAATAGTTCCTAAAACAACCAGGAACTCAAGTTCTTCATTTgtaagtgtttatttctgaatcAGATCAAAAAGTTTGAAAACTTGAAATGTCTATGCATTTGTTTCAGCTGTGTAATTCTTTGTTCTGACAAACATTATTGAAAGACATGCGTGTTTATCTTACTGTCGAGtcacaaaaccaaaaaggtaaaacatttataaataactaaacaaaacatgactTACAATGAAACTAccagaacaggaaaaaaatgtatgaagtgACAAATCCAAATATTTgccaaactaaaataaaaagtgagatTTACTTTTAAGCAGAAGTTTGAGAGCAAGAATCTCAATCTTAAAGTCATTTAAGTGTTTCCAAAACATCTCAGAGAGGTGATTATTGAAACCTCACATTTGATTTTCACTTATTTGGatatagttttaatatattaaacagaaTTGTGCGCCCATGCCTTATGTCAGTTAACTCAACTAAAAGGTAATTCCTGATCGGAAAATTGGGACACTTTTCAGGCTGAACAAAAATAGATTCTAGCCTACAATTCCagaatttagtttagttttttgtttttattgttttatttattttgccagtaaaatacatattcagcatTTATCGCAGGatgatattaatacatttattaatattcagaaaatacattaggCTTTTGTCGAATTATACCACTGTTAGAATCTGTTCATGATACCTGTACAGAGGTGGTTTTCCGTTTTAACAGTGAtcagatcatttttattttactttattactcAAATGGATGCTAAATTCAACAAGTTGTTAAAGCAGCCCCTTTGTGGTACATATACAGTACTTCAATTCTGAAGTTATTTATTGAATGTCCTGTCTTGGTTTCTTCCCCCATAACTAAATGACATACTTCATGAATTTGTAAAGCAGTGTTTGCATTTGTCATAAGCACACTTCAGATATAAAAGGAAACCAGCTGTTGGCCTATTTGGCCTTAACTTTTTTACATTATGGAGCAAACGGAAgttgttttaaaactgaaagctccatatgatttttttttttttttcaaaacctttGTAATAATACAGTGTATTTTCAAGGAAATGCCAATGCCAGTGGACACTGTTACAACAAGATCAATAAAAGTCCTTGTGATAAGGATGTCATAACAA

Function

symbol description
eif4ebp2 Predicted to enable eukaryotic initiation factor 4E binding activity. Predicted to be involved in negative regulation of translational initiation. Predicted to act upstream of or within negative regulation of translation and translational initiation. Predicted to be active in cytoplasm. Is expressed in brain and head. Orthologous to human EIF4EBP2 (eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2).

NR:

description
eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 2

GO:

id name namespace
GO:0045947 negative regulation of translational initiation biological_process
GO:0008190 eukaryotic initiation factor 4E binding molecular_function
GO:0003743 translation initiation factor activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00002965 False 3649 mRNA 0.34 3 8038675 8044413
TU175890 True 3794 TUCP 0.36 5 8037577 8044220

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00002966 spock2,LOC108443083 coding upstream 39552 7955216 ~ 7998025 (+)
AMCG00002961 NA coding upstream 91053 7938432 ~ 7946524 (+)
AMCG00002954 NA coding upstream 174156 7847978 ~ 7863421 (+)
AMCG00002953 ndufb8,LOC102781364,LOC106577308 coding upstream 191707 7843544 ~ 7845870 (+)
AMCG00002959 NA coding upstream 207859 7828091 ~ 7829718 (+)
AMCG00002974 NA coding downstream 26571 8070984 ~ 8081794 (+)
AMCG00002973 LOC107595167 coding downstream 92327 8136740 ~ 8172504 (+)
AMCG00002976 NA coding downstream 161978 8206391 ~ 8213095 (+)
AMCG00002977 rps24,LOC102780737 coding downstream 185234 8229647 ~ 8234400 (+)
AMCG00002983 zmiz1,LOC103381918 coding downstream 432279 8476692 ~ 8487793 (+)
G139850 NA non-coding upstream 16176 8020020 ~ 8021401 (+)
G139838 NA non-coding upstream 32127 8003904 ~ 8005450 (+)
G139837 NA non-coding upstream 33932 8003315 ~ 8003645 (+)
G139836 NA non-coding upstream 34520 8002802 ~ 8003057 (+)
G139832 NA non-coding upstream 38318 7998213 ~ 7999259 (+)
G139880 NA non-coding downstream 136892 8181305 ~ 8181534 (+)
G139906 NA non-coding downstream 235243 8279656 ~ 8280129 (+)
G139915 NA non-coding downstream 453601 8498014 ~ 8499226 (+)
G139916 NA non-coding downstream 454971 8499384 ~ 8507103 (+)
G139917 NA non-coding downstream 463464 8507877 ~ 8508483 (+)
G139784 NA other upstream 110745 7923182 ~ 7926832 (+)
AMCG00002960 NA other upstream 116669 7909252 ~ 7920908 (+)
G139720 LOC103376252,LOC104927182,LOC102078543,LOC101474510 other upstream 658090 7376687 ~ 7379487 (+)
AMCG00002939 ube2d1,ube2d1b,LOC105891213,LOC106607701,LOC103397267,LOC103397347,LOC105010549,LOC107717106,LOC107553913,LOC107733527 other upstream 964039 7066855 ~ 7073538 (+)
G139492 NA other upstream 1884457 6147748 ~ 6153120 (+)
AMCG00002982 NA other downstream 448592 8493005 ~ 8496965 (+)
AMCG00002996 NA other downstream 1192327 9236740 ~ 9244099 (+)
AMCG00002998 NA other downstream 1255898 9300311 ~ 9316633 (+)
G140030 NA other downstream 1281075 9325488 ~ 9330464 (+)
G140189 NA other downstream 1733837 9778250 ~ 9780452 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location