G106134


Basic Information

Item Value
gene id G106134
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030133.1
NCBI id CM030133.1
chromosome length 32682731
location 19957005 ~ 19995987 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU132775
AGATCTACTGATAAAGGATACCTGGTTGCGAAGGTGATCGCCATTGACGCTGATTCGGTGCAGAACTCCCGGATTACATATCAGTTCCTACAAACTACTGACGCTAGTTTGTTCAGTCTGGACCAGTACAATGGGGAAATCCGGACAATGAGGATGTTTAGTCCAAGAGATTCACGCAAACAACGACTGATTGTTCTCGCAAAGGACAACGGAGATCCCGCTCTGTCTTCTACTGTTACCATCAAGTTATCAACATTGGATCCCGCTTCCAAAGCTTTGTCAGGACCGACTGAGGTGTCTTTGGAATATGATATATTTTCTGATTTGAATCTGTACTTGGTTATCGGTTTGGGATCAGTGTCGTTTCTCTTCTTGATCACTATATTAGTTATTATCGTGCTGAAGTGTCAGAAACCGCATCAAAAGCAACCGGCTCCGTCCTGTAGGAACAGTTTCGTCAGCCAGAGGAACTCTATGAAACAAACTCTATAGTTTGTTTCTGGCAGAGTCTCggaaaggaaacatttttgtCAGACAACCTGCACCAAACGGGTCTGGATACATCGTGTCCAGCATACCGAGGAGTACAGGGATGACAGAGACAAGTACTTCAGCCAATTCAACACTGCAGGAGTCCACTAGTGGTTTCCCATGAGGCTTTCCTGGTGGAATTTCGTCAGGATGAATCCATCAGACACAGAGAAAAACCTCCCGAAACACCAGACCTCAGGATAGCGATGACGTGACCTGATTCCTCTCAGCCCCGATCACCTTCCCTGCGTTCTCCTGACTGACACGACCGACATACCATCCAGCATGACTCTGCATGGCTATAGAAACAGAATGacagaatttaaaaagaagaaaagaagggaACAAAAAGAACATTTCTGCCATTTCTCAAAAAACCCcaataaaagcaggaaaaaatgagagagacagacaataacaaaaaggaaatgacCTCCACGCTGTCTTTGAAGGATATCAGCTTTTCAAAATCCCAGACAATCTCTTCTACTGAGgaatttggaaaaacaaaggGACACAAAATAATGCCTTTTACTATAGTCTGGTAGGCCCTTCCTTGATGGGTACTGTCTTAAGGGCAAGTGTAGCATGTATTATTGAGAAGCCATTTTATAGCTCAATTAAgggaactttattttatttatgattccACTGAATACTTCTAATCAACTACAgagttattttcaaaatgcttgAAGTCATGAGGCATTTAagaaatagtattattattattgctacttAAGACCTGCTTTAGTTAGTTTCATTTCCATCTAATCTCAGAAGAAACAAACCTACAATGTTTAAGGAGCAGATGGCTGGCTTTCATAAGTCAAAAGCAAGCCAgcatctgaatacattttccttaaatAGCTCATGACTGAAAGATTTATGAATTAGACCCGATTTCAGTAAGACTGCTTATTTGACATCTTGTGTTATATTTAGTAATGAGGATAAGATTTGCTCACGATTTCTTTAAAGCTGTCAAGACATTTATGTGCAACgctgcaaacaaaaaatatggtTGGTTGATTATGGTGGCTAACTTTTATTACTAAATACAATACCTCAAGCTGAATTACGCTAAACCTTTCCAAGGCAATTGTCCTCTTTAGTTTCTTAcactgtgattaaaaaaaaagatgaattgTGTCAGTTTTTAGAAAATTAGCCACTTGAATGGACCTTTTTACCTACCATCCAAGTAGACTTTATCCTCTCTAAAACATAAAGTTGTTTAGAAAAAAGACTGTTTTGAATTCAGATTACATATTGTGAGTCGTAGATTACAGTATTTGTTGTGTTGAATTAATTTGTGTGATTCAGTAGACTACATTaatagaataaacaaaacaacataaatatagTGTTGGAATTGTGCAATTAAACACTCGCCaggttttaatgtttacatttattttatatgatgtatgattggggaaaaaaaatgagatgttgattttatacattttaatgctgcTTTGTGTGTGATCTAATATCCAAGTGCTTTCTGTAAAGTATTATATCAGTGGTGCAATACATAGTCATTAAGCtttttacatactgtatattacataAACGTATCACAATAATAGTGGTGTATACCACAGCTTTACATGTTACCAAAATAGTAGAGATTGTAGTAGTTGTAGAGTAGAGTTAGTGAGCTATTCTCAAGTGGGCCCataacatatatttgtattatttaagcCTGAAGGAGATGTCCCCCCAGTACAGAAGTTGAATTCATTGCTAAATAATATTCTATGCAGAACTGTTATATAGGAAGAATACTAGATTTCCCTGTCAAACGtgttgtgaaaaaataagagggaactataaaactataaaaactgctttttattttaggaaacgCAGAGGTATAAACCAATGAGATATGCATGTGTTCCACTGTCAGGATCTGAATAGATACTGgccagtttatttttctttggtgacctttgacctcaTCAGTGGGAGGCACTGCACAATGTAGACGATGTTATGCTTTGTCAGTTAGTTAATCTGTGTGACTGCAGGTTTGACTGAAAGCCTTAATATGTCAGCTGTAATAGGTGCTCTTGAATTCAGGATTCATCTATCAGGCCTTTGGAGGGATAAAAGggaacattttctcttttattttcatattgttgGAGTCTGTTTGGGTTTGTTTATCGAGAAAGATGAACACATACTGTATCAGAACTGTGATACATCATTGTGTGACTGATTTGTCTCGTTATTGTTATTCTATGACTCCAGAGTCATGCATGCAGtgaaatatcatttaaaatctgaTGAATTTTCTTAAAGGggttctttaatttaaatgacttGATAACAGAATGTTACATGTGGGTTTAATAGTTACATAACCAGCCCCCAAACTATGTTTTTAACTCAGAACAATTTTAGATACCTTCAACTGATTGGCACCTTTAAATGGCCTACATAATCAGTGTTGTGGGGAATATATTGCTTACATGATTTGCTTGCTAGTAGTGGTCTGTTTTCACTGTCttgctttattacatttaacAGACATATACAACCCCCCTCTTCCCATAGGCGTAAAATGATTCACCCTGATGTAATTTGCTAGGTCCCAGAGTTTTTATGTACTTTGAAAAATACACAGTTTGATGTTAGATCAAGTGTTAtgaatttcttaattttttgaatgcttttaattgaaaacatgtttttttgggtGCTCTCTTTCTTTTATACAAAATTCTGTTGCCAAGTTAAGGCTTTAGCACTCATTTTTGAATAGTGTGTGTGCTACAGTACAATATCATAACCCGAGGTTCATTTGAGATTGTGTCTTATTCAGTGCACTGTTAAAACATAGCTTTGAGACATTCCAGACACTGCAAATAGCATCTGGGCCTTCTGTTCCTTCTGTTAGTATGAGAACAAATGTATGTGTTGGAAATGTATTGTTCTATATGTGGTGTGTTTTTCaaacaacattttcagattttaagtTAGTGGCTGATCTAACTAGTTTTAACTCATAGCTTATTTAAAATCATCATCCACCAAAACatagtattatatttattaataaacaaacaacaacaataaaataaacatttgaggGTTCTTCTATAAAGTCTTTAACatagattatacatttttggtcTTTCAACTTTGGACATAACAGATATCTCTATATAGCTAATGAGTTAAAACTCTGTGGTCAGGATATCTTTTGTATGTAGTATAATAAGCAGAATTGTGTAGTAACATAAAGTATTAAGTGCTGTTATTACAAACAATGTGTGCAGATTGACAGTTCAGAAACATTTCCAGCAGTTTTCTGTACTggcatgattttgtttttcctcacaaGAATTTTAAGCAAAATTAcctatgttttttctttattctattTTACTTTGACCTGTCTAATTACTGCATTTAGCtttctataaaacaaattatttatttaatgaattatgtAAGACTTTTTTATTACCCAAAAGTATATTTTACACCACATCTTTACCCAAAAGATACTGCTTTTCGGGTAAACCTATGGTGAATTGTGTGCCATGGAGCAAAAGAAACCTTTGCTGTTAACGTTGTGTTGTCTCAGTGATGAAATATAGGTATTGGGTGATTGCCTGTTATATGCTGCTACTCACTTTGCATggcatcattttattttggttctgCAGGAGGCTGTCACTCATCTCCTCAGACTATTCAAAGTTGTATGCTAGTGGAACAAAGAACAAGAGTGTGGGCATGAATTGCTTTCTGGTCATGTGTGCTGATGTTTTGCTTGTAAATACTAAAGTGTCAATAAATGCTTTGAAAGTA
>TU132777
GGAAGATTCTTTGGAATATGATATATTTTCTGATTTGAATCTGTACTTGGTTATCGGATTGGGATCAGTCTCGTTTCTCTTCTTGATCACTATATTAGTTATTATCGTGCTGAAGTGTCAGAAACTACATCAAAAGCAACCGGCTCCGTCCTGTAGGAACAGTTTCGTGAGCCAGAGGAACTCTATGAACTCTCAGATAGCGGATTCCACCTTGATTTCCAGCGATGCCTACTGGTACAGTTTGTTTCTGGCAGAGTCTCGGAAAGGAAACATTCTTGTCAGACAACCGGTACCGGATGGGTCAGGATACATCGTGTCCAGCATACCGAGGAGTACAGGGATGACAGAGACAAGTACTTCAGCCAATTCAACACTGCAGGAGTCCACTAGTGGTTTCCCATGAGGCTTTCCTGGTGGAATTTCGTCAGGATGAATCCATCAGACACAGAGAAAAACCTCCCGAAACACCAGACCTCAGGATAGCGATGACGTGACCTGATTCCTCTCAGCCCCGATCACCTTCCCTGCGTTCTCCTGACTGACACGACCGACATACCATCCAGCATGACTCTGCATGGCTATAGAAACAGAATGacagaatttaaaaagaagaaaagaagggaACAAAAAGAACATTTCTGCCATTTCTCAAAAAACCCcaataaaagcaggaaaaaatgagagagacagacaataacaaaaaggaaatgacCTCCACGCTGTCTTTGAAGGATATCAGCTTTTCAAAATCCCAGACAATCTCTTCTACTGAGgaatttggaaaaacaaaggGACACAAAATAATGCCTTTTACTATAGTCTGGTAGGCCCTTCCTTGATGGGTACTGTCTTAAGGGCAAGTGTAGCATGTATTATTGAGAAGCCATTTTATAGCTCAATTAAgggaactttattttatttatgattccACTGAATACTTCTAATCAACTACAgagttattttcaaaatgcttgAAGTCATGAGGCATTTAagaaatagtattattattattgctacttAAGACCTGCTTTAGTTAGTTTCATTTCCATCTAATCTCAGAAGAAACAAACCTACAATGTTTAAGGAGCAGATGGCTGGCTTTCATAAGTCAAAAGCAAGCCAgcatctgaatacattttccttaaatAGCTCATGACTGAAAGATTTATGAATTAGACCCGATTTCAGTAAGACTGCTTATTTGACATCTTGTGTTATATTTAGTAATGAGGATAAGATTTGCTCACGATTTCTTTAAAGCTGTCAAGACATTTATGTGCAACgctgcaaacaaaaaatatggtTGGTTGATTATGGTGGCTAACTTTTATTACTAAATACAATACCTCAAGCTGAATTACGCTAAACCTTTCCAAGGCAATTGTCCTCTTTAGTTTCTTAcactgtgattaaaaaaaaagatgaattgTGTCAGTTTTTAGAAAATTAGCCACTTGAATGGACCTTTTTACCTACCATCCAAGTAGACTTTATCCTCTCTAAAACATAAAGTTGTTTAGAAAAAAGACTGTTTTGAATTCAGATTACATATTGTGAGTCGTAGATTACAGTATTTGTTGTGTTGAATTAATTTGTGTGATTCAGTAGACTACATTaatagaataaacaaaacaacataaatatagTGTTGGAATTGTGCAATTAAACACTCGCCaggttttaatgtttacatttattttatatgatgtatgattggggaaaaaaaatgagatgttgattttatacattttaatgctgcTTTGTGTGTGATCTAATATCCAAGTGCTTTCTGTAAAGTATTATATCAGTGGTGCAATACATAGTCATTAAGCtttttacatactgtatattacataAACGTATCACAATAATAGTGGTGTATACCACAGCTTTACATGTTACCAAAATAGTAGAGATTGTAGTAGTTGTAGAGTAGAGTTAGTGAGCTATTCTCAAGTGGGCCCataacatatatttgtattatttaagcCTGAAGGAGATGTCCCCCCAGTACAGAAGTTGAATTCATTGCTAAATAATATTCTATGCAGAACTGTTATATAGGAAGAATACTAGATTTCCCTGTCAAACGtgttgtgaaaaaataagagggaactataaaactataaaaactgctttttattttaggaaacgCAGAGGTATAAACCAATGAGATATGCATGTGTTCCACTGTCAGGATCTGAATAGATACTGgccagtttatttttctttggtgacctttgacctcaTCAGTGGGAGGCACTGCACAATGTAGACGATGTTATGCTTTGTCAGTTAGTTAATCTGTGTGACTGCAGGTTTGACTGAAAGCCTTAATATGTCAGCTGTAATAGGTGCTCTTGAATTCAGGATTCATCTATCAGGCCTTTGGAGGGATAAAAGggaacattttctcttttattttcatattgttgGAGTCTGTTTGGGTTTGTTTATCGAGAAAGATGAACACATACTGTATCAGAACTGTGATACATCATTGTGTGACTGATTTGTCTCGTTATTGTTATTCTATGACTCCAGAGTCATGCATGCAGtgaaatatcatttaaaatctgaTGAATTTTCTTAAAGGggttctttaatttaaatgacttGATAACAGAATGTTACATGTGGGTTTAATAGTTACATAACCAGCCCCCAAACTATGTTTTTAACTCAGAACAATTTTAGATACCTTCAACTGATTGGCACCTTTAAATGGCCTACATAATCAGTGTTGTGGGGAATATATTGCTTACATGATTTGCTTGCTAGTAGTGGTCTGTTTTCACTGTCttgctttattacatttaacAGACATATACAACCCCCCTCTTCCCATAGGCGTAAAATGATTCACCCTGATGTAATTTGCTAGGTCCCAGAGTTTTTATGTACTTTGAAAAATACACAGTTTGATGTTAGATCAAGTGTTAtgaatttcttaattttttgaatgcttttaattgaaaacatgtttttttgggtGCTCTCTTTCTTTTATACAAAATTCTGTTGCCAAGTTAAGGCTTTAGCACTCATTTTTGAATAGTGTGTGTGCTACAGTACAATATCATAACCCGAGGTTCATTTGAGATTGTGTCTTATTCAGTGCACTGTTAAAACATAGCTTTGAGACATTCCAGACACTGCAAATAGCATCTGGGCCTTCTGTTCCTTCTGTTAGTATGAGAACAAATGTATGTGTTGGAAATGTATTGTTCTATATGTGGTGTGTTTTTCaaacaacattttcagattttaagtTAGTGGCTGATCTAACTAGTTTTAACTCATAGCTTATTTAAAATCATCATCCACCAAAACatagtattatatttattaataaacaaacaacaacaataaaataaacatttgaggGTTCTTCTATAAAGTCTTTAACatagattatacatttttggtcTTTCAACTTTGGACATAACAGATATCTCTATATAGCTAATGAGTTAAAACTCTGTGGTCAGGATATCTTTTGTATGTAGTATAATAAGCAGAATTGTGTAGTAACATAAAGTATTAAGTGCTGTTATTACAAACAATGTGTGCAGATTGACAGTTCAGAAACATTTCCAGCAGTTTTCTGTACTggcatgattttgtttttcctcacaaGAATTTTAAGCAAAATTAcctatgttttttctttattctattTTACTTTGACCTGTCTAATTACTGCATTTAGCtttctataaaacaaattatttatttaatgaattatgtAAGACTTTTTTATTACCCAAAAGTATATTTTACACCACATCTTTACCCAAAAGATACTGCTTTTCGGGTAAACCTATGGTGAATTGTGTGCCATGGAGCAAAAGAAACCTTTGCTGTTAACGTTGTGTTGTCTCAGTGATGAAATATAGGTATTGGGTGATTGCCTGTTATATGCTGCTACTCACTTTGCATggcatcattttattttggttctgCAGGAGGCTGTCACTCATCTCCTCAGACTATTCAAAGTTGTATGCTAGTGGAACAAAGAACAAGAGTGTGGGCATGAATTGCTTTCTGGTCATGTGTGCTGATGTTTTGCTTGTAAATACTAAAGTGTCAATAAATGCTTTGAAAGTA

Function

GO:

id name namespace
GO:0015672 monovalent inorganic cation transport biological_process
GO:0030001 metal ion transport biological_process
GO:0006811 ion transport biological_process
GO:0006814 sodium ion transport biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU132775 True 4365 lncRNA 0.36 3 19957005 19995987
TU132777 False 4113 lncRNA 0.35 2 19987204 19995987

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00011361 NA coding upstream 1918 19954620 ~ 19955087 (+)
AMCG00011359 NA coding upstream 37816 19914612 ~ 19919189 (+)
AMCG00011360 hars,LOC106611772 coding upstream 47412 19902161 ~ 19909593 (+)
AMCG00011358 LOC106603042,LOC107757604 coding upstream 58747 19889328 ~ 19898258 (+)
AMCG00011353 ik,LOC107692978,LOC107661680 coding upstream 69375 19842173 ~ 19887630 (+)
AMCG00011373 NA coding downstream 742395 20738382 ~ 20739024 (+)
AMCG00011374 NA coding downstream 958807 20954794 ~ 20958447 (+)
AMCG00011380 NA coding downstream 1131123 21127110 ~ 21131535 (+)
AMCG00011381 NA coding downstream 1231223 21227210 ~ 21236755 (+)
AMCG00011387 NA coding downstream 1323437 21319424 ~ 21385863 (+)
G106071 NA non-coding upstream 153530 19803171 ~ 19803475 (+)
G106022 NA non-coding upstream 368032 19588193 ~ 19588973 (+)
G105858 LOC105030512,LOC106609167,LOC106569888 non-coding upstream 1339940 18616850 ~ 18617065 (+)
G105811 NA non-coding upstream 1709237 18175355 ~ 18247768 (+)
G105794 NA non-coding upstream 1923980 18032755 ~ 18033025 (+)
G106277 NA non-coding downstream 619451 20615438 ~ 20615641 (+)
G106298 NA non-coding downstream 911463 20907450 ~ 20907653 (+)
G106310 NA non-coding downstream 956235 20952222 ~ 20952712 (+)
G106327 NA non-coding downstream 1024223 21020210 ~ 21022119 (+)
G106347 NA non-coding downstream 1032806 21028793 ~ 21033188 (+)
G105916 NA other upstream 734584 19222055 ~ 19222421 (+)
AMCG00011328 NA other upstream 839636 19107273 ~ 19117369 (+)
G105778 LOC105024433,LOC107752029,LOC107743918,LOC106604409 other upstream 2168955 17784163 ~ 17788050 (+)
AMCG00011293 plac8l1 other upstream 2974764 16978492 ~ 16982241 (+)
AMCG00011268 NA other upstream 3846624 16105586 ~ 16110381 (+)
G106139 LOC108275110 other downstream 99242 20095229 ~ 20162966 (+)
AMCG00011365 LOC108438827,LOC108243066,LOC107376386 other downstream 300024 20296011 ~ 20339325 (+)
G106242 NA other downstream 365221 20361208 ~ 20367223 (+)
G106613 NA other downstream 3345321 23341308 ~ 23341765 (+)
G106618 NA other downstream 3360075 23356062 ~ 23356559 (+)

Expression


Co-expression Network