LOC122333286


Basic Information

Item Value
gene id LOC122333286
gene name NA
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_025047901.1
NCBI id JAEQBD010000246.1
chromosome length 542128
location 184584 ~ 187502 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043230831.1
TAAAAGCACTTATTTCCTCAGCGCCCTTGCATTTGATGTAGTTTAAAGTCCGAAGAAACACACCGAGACATTTTAGGTTGAGAGAACAGGCAGAAAGATGGATGTTTGCAGATACTTGATCTTGTATCGCTTCCTGGCATTCACCGTTTTCAGAGCGGCGGATTGCTTTGAGGCGTCCATCGTTGGGGGCAAAGACGTCAGAAAACCTCAGCCGTGGATGGTGTCCATTCAGATGAACCGGATGCATGTGTGTGGAGGAATCCTGATTCAAGAGCAGTGGGTCTTAACTGCAGCACATTGCCTGCGAGAACCCGTTTCATCAGTGACGGTTCTGTTAGGATCTCTTTCTCTGAGTAAAGGCAGTCAGCGCGTCGGCATCCTCGGCTACGAATCCCCGAAAACATTCGACGCCACGACTAAACAAGATGACATCATGCTCATTAAGCTAAGCAAAAAAGTGAAAGCGAAAGCTAAAAAAATCCCTAAAAAGGAGCACGACGTTCCCCCTGGCACTAAGTGTGTCGTGACGGGCTGGGGAAGCGCTAATGCTGAAGTCTTGAAAGCTTCGGACAAACTGCAAATGTTAGAGGTGACGGTGATGGACCGGGATCTGTGTAACCGCTTCTACAACAGAGACCCCGAGATCACCAGAGACATGCTGTGTGCGGGAACCAAGCGAGAAAAGAGAGGCATCTGCTGGGTATGTCTTCACTGTGGCCTCCTCAGGAAATCATCCTTTGACCTGCATGAAGGAAAACCACcttgtgttgtttttcaggGAGATTCCGGCGGACCACTTGAATGCAAGAAAAACATAGTAGGACTGGTATCAGGGTCAAAAGAGTGCGGTGACCCCAAGAAACCAGCCGTGTACACTTTCCTCTCTGAGAGACATATCCGCTGGATcaaaaacatactgaaaaaGCAATTCAACAGCACGAGCTCTTAAGAAGCTTATATTTACAGCATAGAGACTTGGTTGTAGCTCAAATTGCTGtagctaaaaataaaccaaaaatagcCGCGAagcataaaagcattttttcacacaatgttttttaaacaagtaaaagaaTTAAGCAAACTGAAAATCGTGTAAATGTATCCAcgtgttaatgcattaataattcgGTGAAGAATAGTTTTGACCGGAAGATGGagtcatatttctttttatggTTTGTTTACCAACTGAAACAGTTTTTGGTCAAAACGTCTTTAGTTAATGACCTTGCATTGGTTAATTGGTCTTCTGTTCAACTGAACACATTGTACGGTAACATCGAAGCACATCATGTAAACTCACACTGGCTTTGTAGAATATTCTTTGCGTGCAAACAGAATCACGTCCTTCATCGAAGTGACTTGATTTGTGCAACAGAGACTATTTACATAAAGCATGCTAATAAATTCTACCTTTAACTTAAGAGtgtagaaaaacaacaaaaacatgatggaataattattgtaattttaatgtgaTGACTAAAGATGCCATGTTAacctgtaaaatgttttttttttttttttgctaaactccttaattatttgtttagaaGCTAATAAATCCAATGAGACATTTCATGTAATGctactgtaaaatattgtacatttacagTTTCTGTAAGCGAAATAGATCAAGTCATCTTAAAATGAGCATTAAATAAAAGTCTAATTCATTGTGCCGGAGCTTTTGTGATGGAcgtaaatatttcttttatgaGCATACGTAGATGTTAAACTTAtgttaaattgtttattatattattttagtagcatgcatattaatgaAGCATGAACGTGCTTGATGTTATTCAGTGATTCTAATACAGGCCTTTATTGGTCCCTAGTGATTTAATAAAGGATTTTTGGATCCTAACATTATAAAAGgtctttactctcacttttaatcaattgaatgcatttttgccgaataaaagcattaattttagGTAAGATTGTTTTTAGGGAACGTTTTTTCTTCTTGGAAACTGCATTTGGTtgactaataaaatattaaaactcaa
>XM_043230832.1
TAAAAGCACTTATTTCCTCAGCGCCCTTGCATTTGATGTAGTTTAAAGTCCGAAGAAACACACCGAGACATTTTAGGTTGAGAGAACAGGCAGAAAGATGGATGTTTGCAGATACTTGATCTTGTATCGCTTCCTGGCATTCACCGTTTTCAGAGCGGCGGATTGCTTTGAGGCGTCCATCGTTGGGGGCAAAGACGTCAGAAAACCTCAGCCGTGGATGGTGTCCATTCAGATGAACCGGATGCATGTGTGTGGAGGAATCCTGATTCAAGAGCAGTGGGTCTTAACTGCAGCACATTGCCTGCGAGAACCCGTTTCATCAGTGACGGTTCTGTTAGGATCTCTTTCTCTGAGTAAAGGCAGTCAGCGCGTCGGCATCCTCGGCTACGAATCCCCGAAAACATTCGACGCCACGACTAAACAAGATGACATCATGCTCATTAAGCTAAGCAAAAAAGTGAAAGCGAAAGCTAAAAAAATCCCTAAAAAGGAGCACGACGTTCCCCCTGGCACTAAGTGTGTCGTGACGGGCTGGGGAAGCGCTAATGCTGAAGTCTTGAAAGCTTCGGACAAACTGCAAATGTTAGAGGTGACGGTGATGGACCGGGATCTGTGTAACCGCTTCTACAACAGAGACCCCGAGATCACCAGAGACATGCTGTGTGCGGGAACCAAGCGAGAAAAGAGAGGCATCTGCTGGgGAGATTCCGGCGGACCACTTGAATGCAAGAAAAACATAGTAGGACTGGTATCAGGGTCAAAAGAGTGCGGTGACCCCAAGAAACCAGCCGTGTACACTTTCCTCTCTGAGAGACATATCCGCTGGATcaaaaacatactgaaaaaGCAATTCAACAGCACGAGCTCTTAAGAAGCTTATATTTACAGCATAGAGACTTGGTTGTAGCTCAAATTGCTGtagctaaaaataaaccaaaaatagcCGCGAagcataaaagcattttttcacacaatgttttttaaacaagtaaaagaaTTAAGCAAACTGAAAATCGTGTAAATGTATCCAcgtgttaatgcattaataattcgGTGAAGAATAGTTTTGACCGGAAGATGGagtcatatttctttttatggTTTGTTTACCAACTGAAACAGTTTTTGGTCAAAACGTCTTTAGTTAATGACCTTGCATTGGTTAATTGGTCTTCTGTTCAACTGAACACATTGTACGGTAACATCGAAGCACATCATGTAAACTCACACTGGCTTTGTAGAATATTCTTTGCGTGCAAACAGAATCACGTCCTTCATCGAAGTGACTTGATTTGTGCAACAGAGACTATTTACATAAAGCATGCTAATAAATTCTACCTTTAACTTAAGAGtgtagaaaaacaacaaaaacatgatggaataattattgtaattttaatgtgaTGACTAAAGATGCCATGTTAacctgtaaaatgttttttttttttttttgctaaactccttaattatttgtttagaaGCTAATAAATCCAATGAGACATTTCATGTAATGctactgtaaaatattgtacatttacagTTTCTGTAAGCGAAATAGATCAAGTCATCTTAAAATGAGCATTAAATAAAAGTCTAATTCATTGTGCCGGAGCTTTTGTGATGGAcgtaaatatttcttttatgaGCATACGTAGATGTTAAACTTAtgttaaattgtttattatattattttagtagcatgcatattaatgaAGCATGAACGTGCTTGATGTTATTCAGTGATTCTAATACAGGCCTTTATTGGTCCCTAGTGATTTAATAAAGGATTTTTGGATCCTAACATTATAAAAGgtctttactctcacttttaatcaattgaatgcatttttgccgaataaaagcattaattttagGTAAGATTGTTTTTAGGGAACGTTTTTTCTTCTTGGAAACTGCATTTGGTtgactaataaaatattaaaactcaa

Function

GO:

id name namespace
GO:0006508 proteolysis biological_process
GO:0004252 serine-type endopeptidase activity molecular_function
GO:0003824 catalytic activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043230831.1 True 2027 mRNA 0.39 4 184584 187502
XM_043230832.1 False 1949 mRNA 0.38 5 184584 187502

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
orc4 orc4,LOC107705817 coding upstream 50549 128383 ~ 134035 (+)
ntan1 ntan1,LOC107666719 coding upstream 57032 122933 ~ 127552 (+)
txnrd3 txnrd1,txnrd3,LOC107705821,LOC107666707,LOC107705897,LOC100702976 coding upstream 64160 107692 ~ 120424 (+)
LOC122333289 LOC107666675,LOC107582334 coding upstream 93262 84959 ~ 91322 (+)
G178948 NA non-coding upstream 10938 173340 ~ 173646 (+)
G178947 NA non-coding upstream 13022 169802 ~ 171562 (+)
G178946 NA non-coding upstream 16224 168143 ~ 168360 (+)
G178938 LOC107582301,LOC107705816,LOC107666699,LOC107572302,LOC107705898,LOC107691069 non-coding upstream 40643 143202 ~ 143941 (+)
G178908 LOC107666675,LOC107582334 non-coding upstream 93267 42797 ~ 91317 (+)
G178956 NA non-coding downstream 6780 194282 ~ 194540 (+)
G178957 NA non-coding downstream 24940 212442 ~ 212848 (+)
G178978 NA non-coding downstream 169126 356628 ~ 420130 (+)
LOC122333285 NA non-coding downstream 236097 423599 ~ 481509 (+)
G178989 zeb2,zeb2b,LOC107712039,LOC107684631,LOC107556205,LOC107558525 non-coding downstream 301017 488519 ~ 527537 (+)

Expression


Co-expression Network