uba3 (uba3,LOC108435248)


Basic Information

Item Value
gene id uba3
gene name uba3,LOC108435248
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035911.1
NCBI id CM008314.1
chromosome length 35718434
location 23813195 ~ 23832512 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
uba3 Predicted to enable NEDD8 activating enzyme activity. Predicted to be involved in protein neddylation. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Orthologous to human UBA3 (ubiquitin like modifier activating enzyme 3).

NR:

description
PREDICTED: NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K10686 UBA3, UBE1C; NEDD8-activating enzyme E1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022677373.1 False 2712 mRNA 0.41 17 23813195 23832512

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103023698 LOC108435245,LOC108425699,LOC105906847,LOC108435246,LOC103365807,LOC105923626 coding upstream 90184 23717064 ~ 23723011 (+)
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LOC103027302 rnd1a,LOC103027302,LOC108435239,LOC105906806,LOC107657046,LOC107737660,LOC107563659 coding upstream 210384 23586018 ~ 23602811 (+)
LOC103021840 LOC108436304,LOC107741317,LOC106519302,LOC101477062,LOC107560879 coding downstream 1842 23834354 ~ 23857902 (+)
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LOC103040021 trpc4ap,emp3b,LOC107741324,LOC107656986,LOC107562468,LOC108436335,LOC107741326,LOC107562456,LOC107657024,LOC107671979,LOC107737636,LOC107560919 other downstream 657393 24489905 ~ 24503010 (+)
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G134426 NA other downstream 789396 24621908 ~ 24632130 (+)

Expression


Co-expression Network