G87224


Basic Information

Item Value
gene id G87224
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000015
NCBI id null
chromosome length 8631711
location 1121218 ~ 1129967 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU99325
TGTGCTCTCGACATTTGTCAGTAAAATAACTCCATATTCTGTACATTTGTTTGTTGCAAATTTACAGTTAATGCAATTGAGATGTTTACATTTGCTTGTTGGGGTAAAATTGCTTGTCAACTGAAAACAAAGTTTCTCATTTGTATTAGCAAAATTGCACAAGTTTAACAGTTCATAAAATAAAAAATAAAAAATTACATCAATTGTACATTGATTTCCCTTAATAAAAAGTAAATTGAGTAAAACGGTGTAAAAGGTGCGAGTGTGGATTAGTAATCTGGCCCCCTGGTATTAAGGGGAAAAAATATTGGCCCTCGTCACTATCGAAGTTACCCATCCCTGCAATATTTCAACTGTTATGGAAACAACTGATCACTTATTTTTTTCCTGCTTAACAGAGTTGAACTATTGAAATATTATTGCACTTCCACATTTATTTTTGCACTTTGTGCCAAATACACCTGATCACTGCATTTATTCAGAGTTACAAAGTTGATCTACTGTAGAGAGACTGACATGTCATGACTGTTATCATTATCTTAATCAGTATGTATGTATATGCTTATACTGGCCACGTCAATCTCAATAGCTTGACTCTGTTATGCAAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTGCCCATAACAGAGCTGAACTACTGAGCTTGATGATGAACTATTGAGTGCTCACATAATGAAATACTGATAAACATTTACTATGGTTTAAACCATCAAGATGGTGATGGTAAAAGACGGGGAGGTGTATGTGTTCTCCAAAATCAAAAAGTACACACATTTGCCCTTATTTTCCAAATCACTTGCATGTGCATGTCTCTTTATGTCATAAATAGAGGGTATATGCCTAATAATGACTTTTAATTTTGCCTGTTTTCTTTCCTTTTAGATTTCCAATTATGTTAATGTGCCATTTAGGTAATAACCAGTCAGCAACACAAAGATGTGTTAAATGGCTACACCATTTGAGATTAATCACAATGTTGTTGTGTACTGTGCACAGTAACCTTAAACACCTTACATCAGCGAAATCATTTGACACCGCCCATTTGACATCACCTATCACTCATATTTTAACAATACCACCACACTACACTTATCAGCTAAGGGTCTGCATTGTTTTAAATTGACATATGTCAGTGAGTGGAAAGGTCAGGTCCATAATCATAGAACCTTTCCAACTGTGCACAGTTGCAAGTGCTCAGCAAGTGTCCCCATTACTGAATAACAACTGCAGAAAATGGATTCAATTAAGAAACTGGGGACAATTCACAAAGAATTTGTCTTTGGTCATTACAAGAACATTACACTCTCACAGGCATGTTAAAGAAATAAACCTATTTCTGTCTTTAGTTGACCGTTTATATCCAAAATTACATTAAGAAACAACTAGATCTTGACATGTATTTGTTTTTATATTTAATTAATATATATTTTTCAATCTATAAATATGAAGCTTTGACAACTGCTGTCATCTAATAGACCATTTTTTGTTAAAGCACGTACATGAATTGTTTTAAAAAAAATTGGTTTATTTTTTTTCCAAATGGATAAACTTTTGGTATATTTTGAATGTATGCACTTAATGTAGAAGCTAACATGTTTTCATGATCATGAGTGATAAACCATAGAACAGATAGGGTTTGTGATACTAGTCTCTCACTAAAAAGTGTAATGCTTAATTTTGTCATCATCTTTCCAGCTGCCTATACAATCATTTCTTCTGCAGAACACAAAATATATTTTGGAGACAACGTTGGAGCCATTTGACTTACACTGTATGGATTAAAAAAAAAAAAAACAGACATTTTTCAAAATATATTTATGTTCAACAGAAGCAAAAAGCTTGTCTTTGAATGTCTTATATGCAAAGATGTTTGCCACCCCCAGTTGTATACAAAGTCCAGGTTGTTAAACTATGCTCCAATGCCTTCATAGCAACATAAATTAGAGCAACAGGTCTGTGATCATTAAGACAGCTTGGATTAGAGGACTTTGGTGCAGAGGTTACCATGGCTAATTTGAAGCATTGTGAGTTGTTAAAAATAGCGTGTACTCCTGAGCAGCAGAGGTGTGGAGTTCATATGGTGTACGAACAGAAGTTCGAACTTCCTGTTGTGGCTGAGGAGGCTGTTTTGATTAATTTATTGAAGCACAAATAAATGCTTTTATTTTGTGCGAATATTGTAGGTTTTTGTTGTTTATACATTTTGGAAAGTGTGTGTTTAATACACTGGTTTTGAGGCAAACATCAATATTACTATTGCTCATATAGTCAGGGCTTGTGATTTGAACAAACCCCTAAAAGTATTAAACTTGGGTGTGAAACCCATACTATTTTTTGCTACAGACACAAACAATACTTAGGATCATGCAGTTGGATGCAAGTGTTCAAAGAAATTCAAAGAAACCATTACAACTACAGTAGTGACCAAAAGTGATGTCTGGCCGAAGAAAATTGACATCTTTATTCAAATATTATTACATTTTAAATTAATGAAACATGCCAAATGAAACATGCCAAATTGTGTGGACATAATTTTTGACCAGGCTGTCATACAAAGAAGTTTAGAGTTTTTCCTGTGAGCTTTTTGTTTACTGTGCCTTTTTACTATGCATTGCTAGTTTGCCTTTTTTGCCAAATCATTTTGTCAGATAAATACAGTGTTTTGTTCTTCCTTCATATTTTGATTGTTTAATCAAACTTGTAGGGTCATTAAAAAACAAATATCCCCTCCGGACATCACTTTTGGCCACTACTTTACTTAAGGTGCGGTCACATAAAAAAATTTGCAGCAAAAAATTGTCTGTTGTCAAAAGCGATATATAAAGCACAGTTCACAAAGAATTCACTTTTAAACCAAGCAGCTTTCTGATGGTCAACATGGCAAATACAGGTGACCAACATGAACCATGTGTAAAAAGTGTCTTTTGCCTTTTATTTAAAGGGGTCATGAACTGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAATAATGTTAAATGTTAAAAAAAAATGTCCACTCAATGTTTTTACATCAAAAAACATCCTAATATAGAATAAGCTATTTTCTATCCTGTTTTTGACCCTCTCTTTCATTTTGCTGGGTGTCACATTCAAGTAAACACCCACTGCTATGATTGGGTAACAGTTTTGCATATTAAAATAATTTTCAACGTCCTTGCCATTACACATGTGGAATTGTTTTAAGAATGTTCGATGTTGAAAATCTTTTACATAGTTGAAACATTTGCCAACAATGTGAAACATTTATGCATATTACATATGCTTTATAATTTTTGGTTGTGGCAAATAAAATTTAAGTTACCACAGTTATAGTTGACAGGATAATGTGCGGTGTTTCATGTAAATGGAATTATAAATGAATGTACATAAGTTTGTCACACTGTTGTTGGCAGTGTTGCCAACTGCTTTCAATTGAAAGTAGCAAAAACTGGTAGCTAAATATCACTAGATGACATCATAATGGCAAATTAATTGATCTATATAAATATGAATATAGATCAGTGGGCAAAATTAGAATCTAGATAAGGCTTGTCCAGAAAGTTGCTAGATTTCTCCCTAAACTTTTAAAAAGTCTCAAAAGGGGTGGGGAAGTCACTAAATCTAGTGACAAAATCACTAAATTGGCAACACTGGTCATCAGCCAGGGGTGGCCAATGTCGGTCCTGGAGAGCCACAGTCCTGCAGAGTTTTGCTCCAACCCTAATAAAATCTCACCTGCCTGTAGCTGTCTAGTAACCCTTAAGACATTGATTAGCTTGTTCGGGTGTGTTTGATTAGGGTTGGAGAAAACTCTACAGGACTGTGGCTCTCCAGGACAGACGTTAGCCACCCCTGGTTTAGGCTATTGAAAACTATATTGTCATTTGCAGTGTCATGTTTAAAATAAAATAAAACATGTCTTACTGATGACAAAACAGAAGATGTCGCTCAATGAAGCTTTTATTCAGGATTACAGCATAAGTCTTCGATCAAAACTATAACAAAAGCGGTGTTTTCTACGTGCTTTCTTCCATATGCAACAATCCAACACATTAACCACATATGCTGAAGAAAAGGAAAGAACATCAAATCACAACTCTTCAGTTTGACTGCAGCACTACAGTATAAATACTCAATCAAATGATCTGTAACAGACAAAGCAATAATGACACATGGTAAAAACACTGTTACTCACACTTGTGTGTTGTGACATTACTGTCAGATTGAATGTAGTCGTCACTGCAGCATCTTTTATTTTCAGTCTCTCTGAAAAGCCTGCGTTGAACTGTGTCTTGTTTAAAAATAAATCTGCAGTAAAGTGAAGCGAAACAATCGAACAGTCTCTTACTGACGTGATCTGACTGGAACTCAGTTAAAAATAAAGTTCATCCACACTTTCTTAATGGATCACAAGGAAGGCAATACAAAGTTTTTTCACAATTTGACACTTCAGTTCAAAACGTCTTGTAATCATCAGGCATCTCTAGTTTTGTTGCTGGAGTATTCCTGTCTTTGTGTCTGTCTCATATTTACTACATGACATGCATGAATCGGTTTGCGGGGCTGAAGAGAAAATAGAAGTAGGTGTTGATCTTCTTCTGCAGAGGCAGTCTTTCGTTGCACTATGACGTAACAATGTGACAAATCCGAAACTAGTCGTTTTCTAAGCTTGGTTTCTAGTAATGGGAAGTTCAGATCATTTTACTGACTCAGATTTTTGAATCTCGATCATCAAAATGAACAAATCTTTTTTCCAAGTCATTTCGTTCATTTCAGCAGAATATAATTAATTGTTACATGTTAATAGCCAAATTCCCCAATACATCTACGCGACTTTGATCATATTTTGAATAAGAAAAAATATATATAATGCAACCAAGGCCAAATTATGAGAAACAGAAGCAATTAATTGAAATGGTGACCGTGAAACAAGTTGCCGTACGGGTCCATTGGACAGCGGAGATGGGGGAATGTCTTGTGGAAGTGTGGCAATAACACAACTGCCTGTATAGCATTTCTTCCAAAACATATCACAACCATACGGACAAAGAGAAGAGCTGGGAAGAAATCCCTCTCAGTTGTGAACCTACCAGTTGGGGGTAGAAAGCTGCTAGTGCTATAAGCTAACATGCTGATGGTGTTGCCAAGCAACAGTAAACCTTTTAGCTGTTGAGGCTAACATTAGCTAGCATACTACAGTTAAATCTCACTTCAAGTTCTCGCTGAAGAACAGACAATATACATTTTGTTTATATCCGCTTCCACATGAGCTACGTCACGCAGTGTTGCATGCTGGGGTGGCACATCCATTTTAGGAGGATCGCTCTTTGTTCCTGATACTGAAATTAATACAGATACCCCTGTTGAAAAAACAGCATATGCTGGTTAGGTATGTTTTGAAGCATGGCAGCTGGTTTGAGGTGATTTATGCTGGTCCTTAGTTGGTCATGAGCTGGTTATAAGCTGGTCCTGAGCTGGAGCTAGTTGCTTAGGACCAGCACTTGACCAGCTTAAACAAGCTCATGACCAGCTAAGGACCAACTAAGGACCAGCTTAAACCAGCTGCCATTTTTTTTCAACAGGGATCTGCACCCTTTGTTTTGTTTTTGGTTTTAAATTAAATATTCACATTCTCCATGGCATTGTTTGCAAGGAAGAGAAGCTATTTTATTGCATTGCATGATAATTTGTGCAGAATTCCACTCACAATGTTACCATAAAAAAAAAAACAGTGTCACATGCTGGGTGCTCGTTGCTACTTCAGTCGGCACATGGTAGTAATGTCCAAATAAAAATGTGTTCAACAAGCCGAAAGAAGTCAATCCATTTCTTCGTTGGAAACGTTTAATTGTAACTGAAGTTTGATAGTCATCGTAAATATTCACTTTCCCAATTCCCATCATGGCCACGGAGGGGAATCGGAGATTGTTGGTCACATTCAGTGGGCAGACACCGACACACTGGTTTTTATATATTTATTTCAACACACAACAACCAAAATCAAATCCCTAGAAGCTTGTGAACAGTTTTGCGGTGGCTGTGTGCAAGTTTTGCTAATTCACAAGCAGACGAACTGGGAGAGTCATACTCGCAAAGGTAATTTTAAACCAAACAAAATACTAAACTTTCAAAAATACTCAGCAATGTGATTATTTTATTGAGTGAGTGGGTTTAATTAGTGATATTATTAATAGATTTGCTATTTGACATCATCTCATCACCCCCTCAACCTGGTTCCCTCAGTGATTTTACACGTAGAAAAGGTGAAAAAAAATACATTGTTCAATTTTCTCCCTGAACGATGATGTGAGTTACTATGGTAATTCTGATGCAGCATGAATGACCTACAATGACGACATTTTTCACAATCATGACAGAAATTCAAAACACTGCTTTAAACTCATTAGCAGTAATGCAGCGCGATCCTCCTAATATGGCATCTAAACAAAACAGTTACCGGAACTCAACACGGCGTGATGTCCGCTTCACATTCTCTAGGTGTGTTCGACTTGAAGCGGCGCTTTGCAGATAGATTGGTGTATGACATCAAAGTACCACCAAAGTGATTAGAGAACACACAGCTCCATATGTTTTCTGAACGCTCTTGTGGTACTTTTATGTCATACACTGATTGGTCTGTGCAGGGCCACATCAAGTCGAACGCACCAATTATCTTGTAGTGTTTGTATGTTTGAGATTTGAGAGACAATCTGTAAAGAGTCTTATGTGCATGATGCAACCAGATTTCATAATCGATTAAGATTTAAAAACTCCTGTAATCTGAGCCTGGGTTTAAGACATTGTGGTGACACATTCACGTAGGGCTGTGCAATTAATTGTAACTGATTTTTTTATTTTGGCTTCCAACGATTATGAAAACAAGACAATCGATGTAAAACGATTATTGTGCCGCTGCTGTATTCCGCCCAGCACCCCATCCTTCACAGCGGTGTGCTTGTTCCTTCCTAAACCAAACCTAACATCCAAATCAGCCAGATAAGTTAGTTTTGTAAAATGCAGTCTACTGTTGCTAAACTGCAGAACATACTTGATATTAAACAATGTTATTAAAAGTGCATTATGCCACGAAAGAGATACTCAGTCAGCAAATTTCCTTTGGCATAGATTTGTCCCGAATAAACAGCTGAAGAGTGGCTCAGATTAGATTGTGTTTGCTGGCCCAAATATGGTCCACTTCATTTTTCGTCAGAACTAAACCAAAACAGTGTCATAACTAGTGAGCCAAATAATAAAAACAAATGTGGTCCATATGTGAACCTTATATGTAATTCTTGTTTGGTTGAGTTTTGTAAAGGGCTGACGGCCCTTACGTGGCATGTGACTGACAGACCAAAAAACATTATTTAACCACATTTATGCCACACCTATTTTTTTTTTTTTTTTAATTAAAATATCCATTAAACAGTAAATCAAATAGTCTTAAACAAAAAAAAAAAAATGTAGTATGTATGCACTGTATGTATGTATGTCTCACCAATCTTTCTCAGTCACCATCTGTAAGAAAAGGAAGATAAAAAAAAGAAATACGTTGGTATAACATATAGTTATCACACATAAGATATTTAAATCCATAAACTAAAACAAGCACATAGGCCTATTACAAATGATTGTAAATCAACACTACATATTTGCTACACAATCAACACTACTGTTCTGTTTCTACCACTCAAGACATACAGTAGAACGACCTTATCCAAAATGAGGACTACTATATTAACAAGCTATTTTTTGACATATAATAATTAAAAAAAACTTATAATACTTAAAAAAACACCAAAACAGCACTTACCTGAATATAATTACAGTTTGTTTGGGCAAAGACTGTTGTTGTAAAGCGAGAGTATAGAGGGAAATAACTGAAATAATGGAAATAACTGCATTTAAATAGTTGCCAGTCACATGTTTAGTAATCCACCAATAAGAATTCAAGGAAAGATGCAAAGCAACCAATAGCATTGTTGAATAGGCTGAGATGTGGACTGCCACAAACCTGTTCTGAAGAACAGAGTTCCAACACAAAGTTTAATGAATGTAAAACAGACAAACACACACTAATTGTAAAAGTGACCGGACAAAGAGTGAAGACACGGGTACAACTTAATGCAAACACAAATGAGGTATTTAATGACACACAGCTGATACAAACAAACTGATAATGATAGAAACCATGACAACCAAGAAATGGTGGGAAATAGTCCATGATAACTAAACAAACTGAATATAACTGTGACATTACTCCTCCCTCCGGCAAGGTGAGACCTCGCACCGTAATGAATGATGAGCAGAGGGAGGGATGGTGAAGGGATGTGAGAGCAGGCAGTGGCGATAAGATGGTGGTGAGTGGACAACGATCCCCTAGCAGCAATGGTGGAAATAATCCGGGCACAGACCAAGAGCCAAACAGTGCTGACAGCCCAAGGCGGAGTCGAGGGAGGGAGGAGCCAAGATGGTGTTGTGGCTGATGACAGCTGGGGGACGACCACAGGAGATGAGGCCGATGGTTCCATAGGCACAGACGGAGAGCCGATTTAAACAAGGGAAGAAGGAACCCACTGCAGCTGTAGAGGTAGAGGGATGGCGCACAGCTGATGGCCTTTAAGTCCATGGCAGAAGTAGAGTGATGACTGACCAAGGGGGGAGCCGGTGGGACGAGGGAATACGGTGGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU99325 True 8696 lncRNA 0.37 2 1121218 1129967

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000015_01080504_01101091 NA coding upstream 19835 1080504 ~ 1101383 (+)
CI01000015_01020856_01025441 HOGA1 coding upstream 95565 1020856 ~ 1025653 (+)
CI01000015_01015968_01016675 NA coding upstream 104372 1015623 ~ 1017700 (+)
CI01000015_01002365_01011214 HYKK coding upstream 109943 1002365 ~ 1011275 (+)
CI01000015_00970175_00973727 NA coding upstream 147478 970175 ~ 973740 (+)
CI01000015_01288157_01300925 NA coding downstream 158190 1288157 ~ 1301131 (+)
CI01000015_01307849_01327079 SRFA, SRF coding downstream 177004 1306824 ~ 1328376 (+)
CI01000015_01349369_01366864 ZNRF4, RNF13 coding downstream 219402 1349369 ~ 1367511 (+)
CI01000015_01405454_01407722 NA coding downstream 275014 1404981 ~ 1409173 (+)
CI01000015_01412031_01434518 RUBCN coding downstream 282064 1412031 ~ 1434518 (+)
G87269 NA non-coding upstream 69186 1051776 ~ 1052032 (+)
G87268 NA non-coding upstream 70182 1050801 ~ 1051036 (+)
G87267 NA non-coding upstream 70676 1050262 ~ 1050542 (+)
G87261 NA non-coding upstream 83904 1036698 ~ 1037314 (+)
G87258 NA non-coding upstream 89372 1031437 ~ 1031846 (+)
G87225 NA non-coding downstream 1023 1130990 ~ 1136259 (+)
G87233 NA non-coding downstream 11993 1141960 ~ 1143392 (+)
G87312 NA non-coding downstream 89048 1219015 ~ 1233531 (+)
G87323 NA non-coding downstream 110794 1240761 ~ 1241065 (+)
G87326 NA non-coding downstream 114667 1244634 ~ 1244931 (+)
G87432 NA other downstream 481116 1611083 ~ 1611387 (+)
G87972 NA other downstream 746037 1876004 ~ 1876594 (+)
G88172 NA other downstream 1254049 2384016 ~ 2526510 (+)
CI01000015_02512276_02523824 NA other downstream 1382131 2511546 ~ 2524572 (+)
CI01000015_03011472_03026518 NA other downstream 1893029 3011472 ~ 3026636 (+)

Expression


Co-expression Network