RNA id: TCONS_00019777



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00019777
length 97
RNA type miRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_009911
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 24881122 ~ 24881218 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGTGCGTTGCGGTGTGAGGTAGTTGGTTGTATGGTTTTGCATAATAAACAGCCCGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCCTGCGGCTGCACG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118051

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021716 lncRNA upstream 38810 24834775 ~ 24842312 (+) False XLOC_009910
TCONS_00021714 lncRNA upstream 307321 24565734 ~ 24573801 (+) False XLOC_009905
TCONS_00021715 lncRNA upstream 307321 24572141 ~ 24573801 (+) True XLOC_009905
TCONS_00021933 lncRNA upstream 357046 24516092 ~ 24524076 (+) True XLOC_009904
TCONS_00021712 lncRNA upstream 673219 24198479 ~ 24207903 (+) False XLOC_009903
TCONS_00019778 lncRNA downstream 14799 24896017 ~ 24897111 (+) True XLOC_009910
TCONS_00021935 lncRNA downstream 194929 25076147 ~ 25079030 (+) True XLOC_009918
TCONS_00021936 lncRNA downstream 326400 25207618 ~ 25213978 (+) True XLOC_009929
TCONS_00021937 lncRNA downstream 338217 25219435 ~ 25242310 (+) False XLOC_009930
TCONS_00021938 lncRNA downstream 338227 25219445 ~ 25242310 (+) False XLOC_009930
TCONS_00019776 mRNA upstream 8102 24842662 ~ 24873020 (+) False XLOC_009910
TCONS_00019775 mRNA upstream 139722 24733741 ~ 24741400 (+) True XLOC_009909
TCONS_00019773 mRNA upstream 147801 24721556 ~ 24733321 (+) False XLOC_009908
TCONS_00019774 mRNA upstream 148263 24721914 ~ 24732859 (+) True XLOC_009908
TCONS_00019770 mRNA upstream 185231 24681177 ~ 24695891 (+) False XLOC_009907
TCONS_00019781 mRNA downstream 90499 24971717 ~ 24974700 (+) False XLOC_009914
TCONS_00019782 mRNA downstream 91608 24972826 ~ 24973944 (+) True XLOC_009914
TCONS_00019783 mRNA downstream 96985 24978203 ~ 24992830 (+) True XLOC_009915
TCONS_00019784 mRNA downstream 130776 25011994 ~ 25038855 (+) True XLOC_009916
TCONS_00019785 mRNA downstream 185662 25066880 ~ 25072830 (+) False XLOC_009917
TCONS_00019767 other upstream 364030 24516092 ~ 24517092 (+) False XLOC_009904
TCONS_00019751 other upstream 918193 23960871 ~ 23962929 (+) False XLOC_009898
TCONS_00019735 other upstream 1026511 23837920 ~ 23854611 (+) False XLOC_009892
TCONS_00019728 other upstream 1273770 23607231 ~ 23607352 (+) True XLOC_009889
TCONS_00019718 other upstream 1481962 23397801 ~ 23399160 (+) False XLOC_009882
TCONS_00019779 other downstream 16953 24898171 ~ 24898253 (+) True XLOC_009912
TCONS_00019780 other downstream 24338 24905556 ~ 24918957 (+) True XLOC_009913
TCONS_00019788 other downstream 214265 25095483 ~ 25096562 (+) False XLOC_009919
TCONS_00019801 other downstream 384581 25265799 ~ 25271837 (+) True XLOC_009933
TCONS_00019805 other downstream 460198 25341416 ~ 25341543 (+) True XLOC_009937

Expression Profile


//