RNA id: TCONS_00021209


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00021209
length 127
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_010842
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 32574110 ~ 32574236 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GTCAGCAGCTTAGCTGGCAGCTAGCACTCAGcatctctcacatggtcgcccactgaagctaagcagggttgcacccggttagtacctggatgagagaccccatgggaaagctaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120728

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00022185 lncRNA downstream 14327 32558055 ~ 32559783 (-) True XLOC_010840
TCONS_00021813 lncRNA downstream 184636 32387576 ~ 32389474 (-) False XLOC_010839
TCONS_00021812 lncRNA downstream 184636 32387576 ~ 32389474 (-) False XLOC_010839
TCONS_00022184 lncRNA downstream 184816 32388257 ~ 32389294 (-) True XLOC_010839
TCONS_00022183 lncRNA downstream 195434 32348773 ~ 32378676 (-) True XLOC_010838
TCONS_00021814 lncRNA upstream 13202 32587438 ~ 32597276 (-) False XLOC_010843
TCONS_00022186 lncRNA upstream 13497 32587733 ~ 32627440 (-) True XLOC_010843
TCONS_00021213 lncRNA upstream 81867 32656103 ~ 32662731 (-) False XLOC_010845
TCONS_00021219 lncRNA upstream 91347 32665583 ~ 32668496 (-) False XLOC_010845
TCONS_00021220 lncRNA upstream 93614 32667850 ~ 32669573 (-) False XLOC_010845
TCONS_00021205 mRNA downstream 269330 32281432 ~ 32304780 (-) False XLOC_010837
TCONS_00021207 mRNA downstream 269346 32303643 ~ 32304764 (-) True XLOC_010837
TCONS_00021204 mRNA downstream 270275 32281200 ~ 32303835 (-) False XLOC_010837
TCONS_00021203 mRNA downstream 340647 32226664 ~ 32233463 (-) True XLOC_010836
TCONS_00021202 mRNA downstream 352798 32216552 ~ 32221312 (-) True XLOC_010835
TCONS_00021211 mRNA upstream 55838 32630074 ~ 32649929 (-) True XLOC_010844
TCONS_00021212 mRNA upstream 78114 32652350 ~ 32662947 (-) False XLOC_010845
TCONS_00021214 mRNA upstream 88233 32662469 ~ 32673028 (-) False XLOC_010845
TCONS_00021215 mRNA upstream 90114 32664350 ~ 32672883 (-) False XLOC_010845
TCONS_00021216 mRNA upstream 90122 32664358 ~ 32671782 (-) False XLOC_010845
TCONS_00021200 other downstream 369681 32199452 ~ 32204429 (-) True XLOC_010833
TCONS_00021197 other downstream 410315 32152199 ~ 32163795 (-) True XLOC_010831
TCONS_00021196 other downstream 454507 32116671 ~ 32119603 (-) True XLOC_010830
TCONS_00021178 other downstream 659410 31905856 ~ 31914700 (-) True XLOC_010822
TCONS_00021163 other downstream 922927 31646390 ~ 31651183 (-) True XLOC_010811
TCONS_00021210 other upstream 55838 32630074 ~ 32649804 (-) False XLOC_010844
TCONS_00021237 other upstream 529647 33103883 ~ 33104907 (-) False XLOC_010851
TCONS_00021239 other upstream 941530 33515766 ~ 33541958 (-) True XLOC_010852
TCONS_00021244 other upstream 1175831 33750067 ~ 33758285 (-) True XLOC_010856
TCONS_00021255 other upstream 1726043 34300279 ~ 34306670 (-) False XLOC_010862