RNA id: TCONS_00025784


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025784
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_012944
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 35806848 ~ 35806966 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ccaggcCGGCagatagctctctgcaactctaacatggtcgcccactgaagctaagcagggctgtgcctggtcagtacctggattggagaccacatgggaaagcttggttgctgcctgag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000167194

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027136 lncRNA upstream 375000 35431006 ~ 35431848 (+) True XLOC_012942
TCONS_00025778 lncRNA upstream 624155 35173862 ~ 35182693 (+) False XLOC_012939
TCONS_00025774 lncRNA upstream 674160 35128751 ~ 35132688 (+) False XLOC_012938
TCONS_00027135 lncRNA upstream 731074 35075415 ~ 35075774 (+) True XLOC_012937
TCONS_00027134 lncRNA upstream 732211 35072976 ~ 35074637 (+) True XLOC_012936
TCONS_00027137 lncRNA downstream 334250 36141216 ~ 36409181 (+) False XLOC_012949
TCONS_00026918 lncRNA downstream 592158 36399124 ~ 36409313 (+) True XLOC_012949
TCONS_00026919 lncRNA downstream 1077651 36884617 ~ 36884817 (+) True XLOC_012956
TCONS_00027138 lncRNA downstream 1136225 36943191 ~ 36944417 (+) True XLOC_012958
TCONS_00027139 lncRNA downstream 1241539 37048505 ~ 37053102 (+) False XLOC_012960
TCONS_00025783 mRNA upstream 4365 35742838 ~ 35802483 (+) True XLOC_012943
TCONS_00025782 mRNA upstream 4374 35742838 ~ 35802474 (+) False XLOC_012943
TCONS_00025781 mRNA upstream 393240 35407921 ~ 35413608 (+) True XLOC_012941
TCONS_00025780 mRNA upstream 555471 35229115 ~ 35251377 (+) True XLOC_012940
TCONS_00025776 mRNA upstream 609249 35173683 ~ 35197599 (+) False XLOC_012939
TCONS_00025786 mRNA downstream 35967 35842933 ~ 35898821 (+) False XLOC_012946
TCONS_00025787 mRNA downstream 36059 35843025 ~ 35898821 (+) False XLOC_012946
TCONS_00025788 mRNA downstream 54964 35861930 ~ 35899617 (+) True XLOC_012946
TCONS_00025789 mRNA downstream 230257 36037223 ~ 36046166 (+) True XLOC_012947
TCONS_00025790 mRNA downstream 259423 36066389 ~ 36081908 (+) True XLOC_012948
TCONS_00025779 other upstream 630714 35173872 ~ 35176134 (+) True XLOC_012939
TCONS_00025772 other upstream 732225 35072976 ~ 35074623 (+) False XLOC_012936
TCONS_00025746 other upstream 2179998 33622917 ~ 33626850 (+) False XLOC_012918
TCONS_00025732 other upstream 2362591 33443264 ~ 33444257 (+) True XLOC_012909
TCONS_00025687 other upstream 3717904 32084939 ~ 32088944 (+) True XLOC_012873
TCONS_00025785 other downstream 12483 35819449 ~ 35819563 (+) True XLOC_012945
TCONS_00025791 other downstream 334267 36141233 ~ 36142754 (+) False XLOC_012949
TCONS_00025796 other downstream 822854 36629820 ~ 36631294 (+) False XLOC_012951
TCONS_00025798 other downstream 826287 36633253 ~ 36638166 (+) True XLOC_012951
TCONS_00025815 other downstream 1453004 37259970 ~ 37260651 (+) True XLOC_012962

Expression Profile

//