RNA id: TCONS_00027924



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00027924
length 123
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_013994
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 19264759 ~ 19264881 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGTGGCAGTGACATCAAACTGATAGCTAGCTTTCTGCAGCTCTCAAGCAGGGTAAGCAGGGTTGTGCCTGGTTAGTACATGGATCATGAAAgtccacatgggaaaactaggttgctacTGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000159175

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029887 lncRNA upstream 286480 18964090 ~ 18978279 (+) False XLOC_013989
TCONS_00029711 lncRNA upstream 286480 18970130 ~ 18978279 (+) False XLOC_013989
TCONS_00029888 lncRNA upstream 286480 18970356 ~ 18978279 (+) False XLOC_013989
TCONS_00029889 lncRNA upstream 286480 18971183 ~ 18978279 (+) True XLOC_013989
TCONS_00029710 lncRNA upstream 297803 18963819 ~ 18966956 (+) False XLOC_013989
TCONS_00027961 lncRNA downstream 747872 20012753 ~ 20014127 (+) False XLOC_014008
TCONS_00027962 lncRNA downstream 767039 20031920 ~ 20032628 (+) True XLOC_014008
TCONS_00027969 lncRNA downstream 913065 20177946 ~ 20179239 (+) False XLOC_014011
TCONS_00027979 lncRNA downstream 1009656 20274537 ~ 20277416 (+) False XLOC_014013
TCONS_00029890 lncRNA downstream 1044009 20308890 ~ 20309259 (+) True XLOC_014014
TCONS_00027921 mRNA upstream 47496 19193851 ~ 19217263 (+) True XLOC_013992
TCONS_00027919 mRNA upstream 91525 19028633 ~ 19173234 (+) False XLOC_013991
TCONS_00027920 mRNA upstream 91748 19032141 ~ 19173011 (+) True XLOC_013991
TCONS_00027918 mRNA upstream 276692 18983900 ~ 18988067 (+) True XLOC_013990
TCONS_00027917 mRNA upstream 348822 18903542 ~ 18915937 (+) True XLOC_013988
TCONS_00027925 mRNA downstream 133842 19398723 ~ 19408941 (+) True XLOC_013995
TCONS_00027926 mRNA downstream 147811 19412692 ~ 19432928 (+) True XLOC_013996
TCONS_00027927 mRNA downstream 224707 19489588 ~ 19491864 (+) True XLOC_013997
TCONS_00027928 mRNA downstream 246513 19511394 ~ 19545111 (+) False XLOC_013998
TCONS_00027929 mRNA downstream 247634 19512515 ~ 19544711 (+) True XLOC_013998
TCONS_00027899 other upstream 1860864 17400263 ~ 17403895 (+) False XLOC_013974
TCONS_00027893 other upstream 1891073 17373632 ~ 17373686 (+) True XLOC_013972
TCONS_00027881 other upstream 3180658 16064463 ~ 16084101 (+) False XLOC_013964
TCONS_00027883 other upstream 3195656 16068970 ~ 16069103 (+) True XLOC_013965
TCONS_00027879 other upstream 3202798 16061826 ~ 16061961 (+) True XLOC_013963
TCONS_00027938 other downstream 482738 19747619 ~ 19747694 (+) True XLOC_014003
TCONS_00027941 other downstream 490069 19754950 ~ 19768673 (+) False XLOC_014002
TCONS_00027942 other downstream 491296 19756177 ~ 19760904 (+) False XLOC_014002
TCONS_00027953 other downstream 517532 19782413 ~ 19783624 (+) True XLOC_014004
TCONS_00027960 other downstream 724524 19989405 ~ 20010798 (+) False XLOC_014008