RNA id: TCONS_00030855


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030855
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_015416
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 23257777 ~ 23257897 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

caatgTAGTTAGGATAGCACTATTTGATGTATTTCTGGGgagcccactgaagctaagcagggctgtgcccggtcagtatctggatgagagaccacatgggaaagctaggttgctgctttaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000170909

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033524 lncRNA upstream 72973 23156012 ~ 23184804 (+) False XLOC_015414
TCONS_00033525 lncRNA upstream 72973 23156014 ~ 23184804 (+) False XLOC_015414
TCONS_00030853 lncRNA upstream 72973 23156047 ~ 23184804 (+) True XLOC_015414
TCONS_00033523 lncRNA upstream 230799 23025321 ~ 23026978 (+) True XLOC_015410
TCONS_00033522 lncRNA upstream 243161 23006792 ~ 23014616 (+) False XLOC_015409
TCONS_00033526 lncRNA downstream 148556 23406453 ~ 23410848 (+) False XLOC_015418
TCONS_00033528 lncRNA downstream 148556 23406453 ~ 23442528 (+) False XLOC_015418
TCONS_00033527 lncRNA downstream 148556 23406453 ~ 23442528 (+) False XLOC_015418
TCONS_00033529 lncRNA downstream 156986 23414883 ~ 23416355 (+) False XLOC_015419
TCONS_00033530 lncRNA downstream 156986 23414883 ~ 23421047 (+) True XLOC_015419
TCONS_00030852 mRNA upstream 125643 23130389 ~ 23132134 (+) True XLOC_015413
TCONS_00030851 mRNA upstream 154628 23081402 ~ 23103149 (+) True XLOC_015412
TCONS_00030850 mRNA upstream 158133 23081248 ~ 23099644 (+) False XLOC_015412
TCONS_00030849 mRNA upstream 158134 23081247 ~ 23099643 (+) False XLOC_015412
TCONS_00030846 mRNA upstream 179029 23039041 ~ 23078748 (+) False XLOC_015411
TCONS_00030857 mRNA downstream 93557 23351454 ~ 23361933 (+) False XLOC_015417
TCONS_00030858 mRNA downstream 93636 23351533 ~ 23355705 (+) False XLOC_015417
TCONS_00030859 mRNA downstream 94405 23352302 ~ 23361009 (+) True XLOC_015417
TCONS_00030860 mRNA downstream 224901 23482798 ~ 23484348 (+) True XLOC_015421
TCONS_00030861 mRNA downstream 355143 23613040 ~ 23620219 (+) False XLOC_015424
TCONS_00030841 other upstream 266256 22986282 ~ 22991521 (+) True XLOC_015408
TCONS_00030832 other upstream 591077 22660071 ~ 22666700 (+) True XLOC_015401
TCONS_00030805 other upstream 1882183 21375467 ~ 21375594 (+) True XLOC_015384
TCONS_00030797 other upstream 2014759 21186377 ~ 21243018 (+) False XLOC_015381
TCONS_00030793 other upstream 2080112 21175950 ~ 21177665 (+) False XLOC_015380
TCONS_00030856 other downstream 16435 23274332 ~ 23274781 (+) True XLOC_015415
TCONS_00030864 other downstream 421976 23679873 ~ 23679989 (+) True XLOC_015426
TCONS_00030870 other downstream 755353 24013250 ~ 24014943 (+) True XLOC_015433
TCONS_00030885 other downstream 1090692 24348589 ~ 24351040 (+) True XLOC_015440
TCONS_00030891 other downstream 1226392 24484289 ~ 24497841 (+) True XLOC_015443