RNA id: TCONS_00035100


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00035100
length 132
RNA type mRNA
GC content 0.34
exon number 7
gene id XLOC_017745
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 53160860 ~ 53189875 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

caaaatctgactAAAAAACAGAGGAAAAATATGTTCATAGTCTACAGTatacgactcactgattcaaatggtcTTTTCCTACTGAGGCATCGGGTATCGAAAGAATATCATTTAaATCATCCACGAAAGTAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180604

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036436 lncRNA upstream 8437 53135436 ~ 53152423 (+) True XLOC_017744
TCONS_00036758 lncRNA upstream 211029 52944123 ~ 52949831 (+) True XLOC_017743
TCONS_00036435 lncRNA upstream 489668 52670859 ~ 52671192 (+) True XLOC_017740
TCONS_00036757 lncRNA upstream 522534 52598474 ~ 52638326 (+) True XLOC_017739
TCONS_00036756 lncRNA upstream 563494 52589298 ~ 52597366 (+) False XLOC_017738
TCONS_00036759 lncRNA downstream 213178 53403053 ~ 53404514 (+) False XLOC_017749
TCONS_00036760 lncRNA downstream 213264 53403139 ~ 53404537 (+) True XLOC_017749
TCONS_00036761 lncRNA downstream 250528 53440403 ~ 53456400 (+) False XLOC_017750
TCONS_00035110 lncRNA downstream 296144 53486019 ~ 53497162 (+) True XLOC_017751
TCONS_00035115 lncRNA downstream 438659 53628534 ~ 53635434 (+) False XLOC_017754
TCONS_00035098 mRNA upstream 345270 52774730 ~ 52815590 (+) True XLOC_017741
TCONS_00035096 mRNA upstream 435164 52584532 ~ 52725696 (+) False XLOC_017738
TCONS_00035097 mRNA upstream 563955 52595220 ~ 52596905 (+) True XLOC_017738
TCONS_00035093 mRNA upstream 578215 52546204 ~ 52582645 (+) False XLOC_017737
TCONS_00035095 mRNA upstream 585816 52554420 ~ 52575044 (+) True XLOC_017737
TCONS_00035103 mRNA downstream 88871 53278746 ~ 53279747 (+) True XLOC_017747
TCONS_00035104 mRNA downstream 178736 53368611 ~ 53401999 (+) True XLOC_017748
TCONS_00035105 mRNA downstream 249790 53439665 ~ 53470252 (+) False XLOC_017750
TCONS_00035106 mRNA downstream 252060 53441935 ~ 53470050 (+) True XLOC_017750
TCONS_00035107 mRNA downstream 285088 53474963 ~ 53509973 (+) False XLOC_017751
TCONS_00035099 other upstream 240874 52919856 ~ 52919986 (+) True XLOC_017742
TCONS_00035075 other upstream 1644542 51516202 ~ 51516318 (+) True XLOC_017723
TCONS_00035066 other upstream 1948812 51211932 ~ 51212048 (+) True XLOC_017717
TCONS_00035033 other upstream 4127742 49033004 ~ 49033118 (+) True XLOC_017695
TCONS_00035023 other upstream 4547424 48613321 ~ 48613436 (+) True XLOC_017687