RNA id: TCONS_00035824


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00035824
length 131
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_018178
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 31045075 ~ 31045205 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTTATCCAGCACACTCTCTTTAAACCCTTCCATTACACACTGCTCTGACAGATTGGCCACTGAAGCAAAGCAGGCTTgggtctggtcagtacctggacaGGAGACCTCCAGGGAAAATGAGGTGGAAaaag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000162272

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036874 lncRNA downstream 13581 31002188 ~ 31031494 (-) False XLOC_018177
TCONS_00036873 lncRNA downstream 71902 30965883 ~ 30973173 (-) False XLOC_018176
TCONS_00036872 lncRNA downstream 72717 30965883 ~ 30972358 (-) False XLOC_018176
TCONS_00036871 lncRNA downstream 73833 30965883 ~ 30971242 (-) False XLOC_018176
TCONS_00036484 lncRNA downstream 73948 30966945 ~ 30971127 (-) True XLOC_018176
TCONS_00036875 lncRNA upstream 265721 31310926 ~ 31346581 (-) True XLOC_018181
TCONS_00036876 lncRNA upstream 512663 31557868 ~ 31744506 (-) True XLOC_018183
TCONS_00036877 lncRNA upstream 890819 31936024 ~ 31967211 (-) False XLOC_018185
TCONS_00036485 lncRNA upstream 936247 31981452 ~ 31983851 (-) False XLOC_018185
TCONS_00036878 lncRNA upstream 950985 31996190 ~ 32004402 (-) True XLOC_018185
TCONS_00035823 mRNA downstream 26506 31007528 ~ 31018569 (-) True XLOC_018177
TCONS_00035820 mRNA downstream 106829 30931414 ~ 30938246 (-) False XLOC_018175
TCONS_00035821 mRNA downstream 106891 30934655 ~ 30938184 (-) True XLOC_018175
TCONS_00035819 mRNA downstream 113929 30926212 ~ 30931146 (-) True XLOC_018174
TCONS_00035818 mRNA downstream 113936 30922595 ~ 30931139 (-) False XLOC_018174
TCONS_00035825 mRNA upstream 27687 31072892 ~ 31075972 (-) True XLOC_018179
TCONS_00035826 mRNA upstream 187718 31232923 ~ 31252809 (-) False XLOC_018180
TCONS_00035827 mRNA upstream 187721 31232926 ~ 31238313 (-) False XLOC_018180
TCONS_00035828 mRNA upstream 192865 31238070 ~ 31308805 (-) True XLOC_018180
TCONS_00035829 mRNA upstream 264159 31309364 ~ 31427390 (-) False XLOC_018181
TCONS_00035814 other downstream 670169 30374686 ~ 30374906 (-) True XLOC_018169
TCONS_00035813 other downstream 670991 30373865 ~ 30374084 (-) True XLOC_018168
TCONS_00035812 other downstream 671648 30373207 ~ 30373427 (-) True XLOC_018167
TCONS_00035811 other downstream 672192 30372663 ~ 30372883 (-) True XLOC_018166
TCONS_00035788 other downstream 1549640 29495300 ~ 29495435 (-) True XLOC_018151
TCONS_00035840 other upstream 964805 32010010 ~ 32010999 (-) False XLOC_018186
TCONS_00035855 other upstream 1415070 32460275 ~ 32460391 (-) True XLOC_018195
TCONS_00035856 other upstream 1604638 32649843 ~ 32649959 (-) True XLOC_018196
TCONS_00035866 other upstream 2426016 33471221 ~ 33475485 (-) True XLOC_018202
TCONS_00035876 other upstream 2556208 33601413 ~ 33657569 (-) False XLOC_018209