RNA id: TCONS_00035812


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00035812
length 221
RNA type snoRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_018167
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 30373207 ~ 30373427 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CCAACGTGGACATCCTGTGAGATGCCTCTCATGTGGCTCTGTCCGTGTGGCGTATGGGAGCGTAGCACTTCGGTGTTGTGACGTACAGTCCCGTTCCATGACGTTGGATAACAAGCTTGTCCCCGGTCTCTGGCTGGTGTGGACTGCGTCCTGTATATTCCTACATCTTCCCAGAGCCCTTTGGGCCATTACTGGGGAGGTAAACCATGCAGTGCACAACC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117810

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00035808 lncRNA downstream 2280 30367154 ~ 30370927 (-) True XLOC_018164
TCONS_00036864 lncRNA downstream 115208 30205348 ~ 30257999 (-) False XLOC_018163
TCONS_00036865 lncRNA downstream 115208 30212776 ~ 30257999 (-) False XLOC_018163
TCONS_00036483 lncRNA downstream 115233 30253684 ~ 30257974 (-) True XLOC_018163
TCONS_00036863 lncRNA downstream 134603 30205348 ~ 30238604 (-) False XLOC_018163
TCONS_00036866 lncRNA upstream 92075 30465502 ~ 30466038 (-) True XLOC_018170
TCONS_00036867 lncRNA upstream 427441 30800868 ~ 30806474 (-) True XLOC_018171
TCONS_00036868 lncRNA upstream 529130 30902557 ~ 30911614 (-) True XLOC_018173
TCONS_00036869 lncRNA upstream 592456 30965883 ~ 30970932 (-) False XLOC_018176
TCONS_00036870 lncRNA upstream 592456 30965883 ~ 30970967 (-) False XLOC_018176
TCONS_00035806 mRNA downstream 2323 30355436 ~ 30370884 (-) False XLOC_018164
TCONS_00035807 mRNA downstream 3609 30361153 ~ 30369598 (-) False XLOC_018164
TCONS_00035805 mRNA downstream 337881 30032628 ~ 30035326 (-) False XLOC_018161
TCONS_00035803 mRNA downstream 508677 29836276 ~ 29864530 (-) False XLOC_018159
TCONS_00035804 mRNA downstream 508817 29836278 ~ 29864390 (-) True XLOC_018159
TCONS_00035815 mRNA upstream 520666 30894093 ~ 30901034 (-) False XLOC_018172
TCONS_00035816 mRNA upstream 521397 30894824 ~ 30900947 (-) True XLOC_018172
TCONS_00035817 mRNA upstream 528711 30902138 ~ 30920356 (-) False XLOC_018173
TCONS_00035818 mRNA upstream 549168 30922595 ~ 30931139 (-) False XLOC_018174
TCONS_00035819 mRNA upstream 552785 30926212 ~ 30931146 (-) True XLOC_018174
TCONS_00035811 other downstream 324 30372663 ~ 30372883 (-) True XLOC_018166
TCONS_00035788 other downstream 877772 29495300 ~ 29495435 (-) True XLOC_018151
TCONS_00035770 other downstream 1323162 29047183 ~ 29050045 (-) True XLOC_018144
TCONS_00035760 other downstream 1497333 28871885 ~ 28875874 (-) False XLOC_018141
TCONS_00035753 other downstream 1530636 28832762 ~ 28842571 (-) False XLOC_018139
TCONS_00035813 other upstream 438 30373865 ~ 30374084 (-) True XLOC_018168
TCONS_00035814 other upstream 1259 30374686 ~ 30374906 (-) True XLOC_018169
TCONS_00035824 other upstream 671648 31045075 ~ 31045205 (-) True XLOC_018178
TCONS_00035840 other upstream 1636583 32010010 ~ 32010999 (-) False XLOC_018186
TCONS_00035855 other upstream 2086848 32460275 ~ 32460391 (-) True XLOC_018195

Expression Profile

//