RNA id: TCONS_00047897



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00047897
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_024159
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 27152633 ~ 27152747 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccggcagctagctctctgcaactcttacatggtcgcccactaaagctaagcagggctgcacctggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000187663

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049244 lncRNA upstream 252826 26895253 ~ 26899807 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047889 lncRNA upstream 252826 26895394 ~ 26899807 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047883 lncRNA upstream 367820 26782521 ~ 26784813 (+) True XLOC_024152
TCONS_00047881 lncRNA upstream 368205 26782373 ~ 26784428 (+) False XLOC_024152
TCONS_00047901 lncRNA downstream 287111 27439858 ~ 27443616 (+) True XLOC_024160
TCONS_00047906 lncRNA downstream 635247 27787994 ~ 27802103 (+) True XLOC_024163
TCONS_00047915 lncRNA downstream 1100484 28253231 ~ 28269166 (+) False XLOC_024168
TCONS_00047933 lncRNA downstream 1660410 28813157 ~ 28815574 (+) False XLOC_024177
TCONS_00047934 lncRNA downstream 1660415 28813162 ~ 28815574 (+) False XLOC_024177
TCONS_00047892 mRNA upstream 239359 26895962 ~ 26913274 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047891 mRNA upstream 239359 26895962 ~ 26913274 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047893 mRNA upstream 240445 26901149 ~ 26912188 (+) True XLOC_024156
TCONS_00047886 mRNA upstream 284851 26844028 ~ 26867782 (+) False XLOC_024155
TCONS_00047887 mRNA upstream 297650 26844147 ~ 26854983 (+) False XLOC_024155
TCONS_00047899 mRNA downstream 252991 27405738 ~ 27492004 (+) False XLOC_024160
TCONS_00047898 mRNA downstream 252991 27405738 ~ 27492004 (+) False XLOC_024160
TCONS_00047900 mRNA downstream 257605 27410352 ~ 27491749 (+) False XLOC_024160
TCONS_00047902 mRNA downstream 340697 27493444 ~ 27500288 (+) True XLOC_024161
TCONS_00047904 mRNA downstream 591546 27744293 ~ 27812810 (+) False XLOC_024163
TCONS_00047896 other upstream 69189 27083330 ~ 27083444 (+) True XLOC_024158
TCONS_00047890 other upstream 246831 26895675 ~ 26905802 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047888 other upstream 284794 26867723 ~ 26867839 (+) True XLOC_024155
TCONS_00047862 other upstream 1945880 25206625 ~ 25206753 (+) True XLOC_024136
TCONS_00047853 other upstream 2544619 24598776 ~ 24608014 (+) True XLOC_024128
TCONS_00047903 other downstream 464191 27616938 ~ 27617054 (+) True XLOC_024162
TCONS_00047912 other downstream 808533 27961280 ~ 27961394 (+) True XLOC_024167
TCONS_00047914 other downstream 1087344 28240091 ~ 28266624 (+) False XLOC_024168
TCONS_00047921 other downstream 1148577 28301324 ~ 28301448 (+) True XLOC_024171
TCONS_00047922 other downstream 1351103 28503850 ~ 28503965 (+) True XLOC_024172

Expression Profile


//