RNA id: TCONS_00047903



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00047903
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_024162
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 27616938 ~ 27617054 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


aaccacagccatatcacccggcagcccaagactggttactcaccgaagctaagcagggcttagCCTGGTCAGAatctagatgggagaccacaagggaaagttaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177706

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00047901 lncRNA upstream 173322 27439858 ~ 27443616 (+) True XLOC_024160
TCONS_00049244 lncRNA upstream 717131 26895253 ~ 26899807 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047889 lncRNA upstream 717131 26895394 ~ 26899807 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047883 lncRNA upstream 832125 26782521 ~ 26784813 (+) True XLOC_024152
TCONS_00047881 lncRNA upstream 832510 26782373 ~ 26784428 (+) False XLOC_024152
TCONS_00047906 lncRNA downstream 170940 27787994 ~ 27802103 (+) True XLOC_024163
TCONS_00047915 lncRNA downstream 636177 28253231 ~ 28269166 (+) False XLOC_024168
TCONS_00047933 lncRNA downstream 1196103 28813157 ~ 28815574 (+) False XLOC_024177
TCONS_00047934 lncRNA downstream 1196108 28813162 ~ 28815574 (+) False XLOC_024177
TCONS_00047935 lncRNA downstream 1196475 28813529 ~ 28815574 (+) False XLOC_024177
TCONS_00047902 mRNA upstream 116650 27493444 ~ 27500288 (+) True XLOC_024161
TCONS_00047899 mRNA upstream 124934 27405738 ~ 27492004 (+) False XLOC_024160
TCONS_00047898 mRNA upstream 124934 27405738 ~ 27492004 (+) False XLOC_024160
TCONS_00047900 mRNA upstream 125189 27410352 ~ 27491749 (+) False XLOC_024160
TCONS_00047894 mRNA upstream 379615 26921480 ~ 27237323 (+) False XLOC_024157
TCONS_00047904 mRNA downstream 127239 27744293 ~ 27812810 (+) False XLOC_024163
TCONS_00047905 mRNA downstream 127281 27744335 ~ 27788200 (+) False XLOC_024163
TCONS_00047907 mRNA downstream 256617 27873671 ~ 27912373 (+) False XLOC_024164
TCONS_00047908 mRNA downstream 256782 27873836 ~ 27912164 (+) True XLOC_024164
TCONS_00047909 mRNA downstream 306792 27923846 ~ 27932723 (+) True XLOC_024165
TCONS_00047897 other upstream 464191 27152633 ~ 27152747 (+) True XLOC_024159
TCONS_00047896 other upstream 533494 27083330 ~ 27083444 (+) True XLOC_024158
TCONS_00047890 other upstream 711136 26895675 ~ 26905802 (+) False XLOC_024156
TCONS_00047888 other upstream 749099 26867723 ~ 26867839 (+) True XLOC_024155
TCONS_00047862 other upstream 2410185 25206625 ~ 25206753 (+) True XLOC_024136
TCONS_00047912 other downstream 344226 27961280 ~ 27961394 (+) True XLOC_024167
TCONS_00047914 other downstream 623037 28240091 ~ 28266624 (+) False XLOC_024168
TCONS_00047921 other downstream 684270 28301324 ~ 28301448 (+) True XLOC_024171
TCONS_00047922 other downstream 886796 28503850 ~ 28503965 (+) True XLOC_024172
TCONS_00047963 other downstream 2559417 30176471 ~ 30176559 (+) True XLOC_024196