RNA id: TCONS_00065558


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00065558
length 126
RNA type rRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_033501
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 13340143 ~ 13340268 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tacaacagaatttcgcacacacaaactctagtgtgaccgcagctttactcactgaagctatgcAAGGCTGAGTTTGTTCAGTACCTGAATGGAAGACCGCATGGGAAAACTAGGCTGCTGTTGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119536

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068556 lncRNA upstream 1860 13337158 ~ 13338283 (+) True XLOC_033500
TCONS_00065557 lncRNA upstream 29154 13242636 ~ 13310989 (+) False XLOC_033500
TCONS_00068787 lncRNA upstream 1470559 11868634 ~ 11869584 (+) True XLOC_033492
TCONS_00068786 lncRNA upstream 1520565 11689738 ~ 11819578 (+) False XLOC_033491
TCONS_00068785 lncRNA upstream 1606047 11689685 ~ 11734096 (+) False XLOC_033491
TCONS_00065562 lncRNA downstream 115643 13455911 ~ 13471148 (+) False XLOC_033502
TCONS_00065564 lncRNA downstream 141067 13481335 ~ 13484788 (+) True XLOC_033502
TCONS_00065566 lncRNA downstream 157136 13497404 ~ 13498287 (+) True XLOC_033503
TCONS_00068788 lncRNA downstream 457376 13797644 ~ 13800139 (+) True XLOC_033509
TCONS_00068789 lncRNA downstream 522041 13862309 ~ 13865084 (+) True XLOC_033511
TCONS_00065554 mRNA upstream 1860 13039426 ~ 13338283 (+) False XLOC_033500
TCONS_00065556 mRNA upstream 22523 13040407 ~ 13317620 (+) False XLOC_033500
TCONS_00065555 mRNA upstream 97030 13040312 ~ 13243113 (+) False XLOC_033500
TCONS_00065553 mRNA upstream 340230 12976226 ~ 12999913 (+) True XLOC_033499
TCONS_00065552 mRNA upstream 340499 12976173 ~ 12999644 (+) False XLOC_033499
TCONS_00065559 mRNA downstream 42584 13382852 ~ 13487217 (+) False XLOC_033502
TCONS_00065561 mRNA downstream 78544 13418812 ~ 13487378 (+) False XLOC_033502
TCONS_00065560 mRNA downstream 78544 13418812 ~ 13487378 (+) False XLOC_033502
TCONS_00065563 mRNA downstream 124610 13464878 ~ 13481674 (+) False XLOC_033502
TCONS_00065565 mRNA downstream 151184 13491452 ~ 13514737 (+) False XLOC_033503
TCONS_00065547 other upstream 486926 12853103 ~ 12853217 (+) True XLOC_033496
TCONS_00065544 other upstream 1167897 12172129 ~ 12172246 (+) True XLOC_033493
TCONS_00065536 other upstream 2126619 11213408 ~ 11213524 (+) True XLOC_033487
TCONS_00065525 other upstream 2656536 10683487 ~ 10683607 (+) True XLOC_033482
TCONS_00065522 other upstream 2757518 10578349 ~ 10582625 (+) True XLOC_033479
TCONS_00065588 other downstream 876702 14216970 ~ 14266258 (+) False XLOC_033514
TCONS_00065590 other downstream 940825 14281093 ~ 14281225 (+) True XLOC_033515
TCONS_00065597 other downstream 1792709 15132977 ~ 15133091 (+) True XLOC_033520
TCONS_00065599 other downstream 1940281 15280549 ~ 15293242 (+) True XLOC_033521
TCONS_00065621 other downstream 2863727 16203995 ~ 16204113 (+) True XLOC_033534