RNA id: TCONS_00065996


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00065996
length 106
RNA type miRNA
GC content 0.32
exon number 1
gene id XLOC_033735
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 26120631 ~ 26120736 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aaaagaaggtattttaaagaatgttgtgaacctgtaaccattgacctccatagtatttgtttttcctactatagatgtcaaggattacaagtttccaacattcttc

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175877

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065995 lncRNA upstream 10577 26108476 ~ 26110054 (+) True XLOC_033734
TCONS_00065991 lncRNA upstream 40617 26065218 ~ 26080014 (+) True XLOC_033731
TCONS_00065990 lncRNA upstream 51663 26064735 ~ 26068968 (+) False XLOC_033731
TCONS_00068849 lncRNA upstream 59062 26060719 ~ 26061569 (+) True XLOC_033730
TCONS_00065982 lncRNA upstream 146126 25920800 ~ 25974505 (+) False XLOC_033725
TCONS_00068850 lncRNA downstream 78678 26199414 ~ 26213850 (+) True XLOC_033739
TCONS_00068851 lncRNA downstream 164919 26285655 ~ 26290469 (+) True XLOC_033741
TCONS_00068574 lncRNA downstream 175541 26296277 ~ 26296512 (+) True XLOC_033742
TCONS_00068852 lncRNA downstream 267693 26388429 ~ 26394383 (+) True XLOC_033744
TCONS_00066007 lncRNA downstream 346125 26466861 ~ 26469201 (+) True XLOC_033745
TCONS_00065994 mRNA upstream 9812 26100024 ~ 26110819 (+) False XLOC_033734
TCONS_00065989 mRNA upstream 59021 26058772 ~ 26061610 (+) False XLOC_033730
TCONS_00065988 mRNA upstream 59723 26058772 ~ 26060908 (+) False XLOC_033730
TCONS_00065987 mRNA upstream 63111 26049818 ~ 26057520 (+) True XLOC_033729
TCONS_00065986 mRNA upstream 72685 26029672 ~ 26047946 (+) True XLOC_033728
TCONS_00065997 mRNA downstream 11929 26132665 ~ 26150270 (+) False XLOC_033736
TCONS_00065999 mRNA downstream 17504 26138240 ~ 26141319 (+) False XLOC_033736
TCONS_00065998 mRNA downstream 17504 26138240 ~ 26141319 (+) True XLOC_033736
TCONS_00066000 mRNA downstream 46684 26167420 ~ 26171550 (+) True XLOC_033737
TCONS_00066001 mRNA downstream 51660 26172396 ~ 26173985 (+) False XLOC_033738
TCONS_00065993 other upstream 49123 26071426 ~ 26071508 (+) True XLOC_033733
TCONS_00065992 other upstream 49624 26070874 ~ 26071007 (+) True XLOC_033732
TCONS_00065985 other upstream 91858 26028659 ~ 26028773 (+) True XLOC_033727
TCONS_00065983 other upstream 135792 25973649 ~ 25984839 (+) True XLOC_033725
TCONS_00065979 other upstream 203560 25913258 ~ 25917071 (+) False XLOC_033724
TCONS_00066028 other downstream 767674 26888410 ~ 26892142 (+) True XLOC_033754
TCONS_00066032 other downstream 920628 27041364 ~ 27044003 (+) False XLOC_033756
TCONS_00066034 other downstream 922979 27043715 ~ 27043842 (+) True XLOC_033757
TCONS_00066036 other downstream 938658 27059394 ~ 27136646 (+) False XLOC_033759
TCONS_00066050 other downstream 1334604 27455340 ~ 27660728 (+) False XLOC_033761