RNA id: TCONS_00065985


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00065985
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_033727
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 26028659 ~ 26028773 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCGGCAGTTAGTTCTCTGCAACTCACACATTATCGcccgctgaagctaagcagggcttcaCCTGATCAGTATCTGGATGGGGgaccacatgagaaagctaggttgctgccagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181555

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065982 lncRNA upstream 54154 25920800 ~ 25974505 (+) False XLOC_033725
TCONS_00065978 lncRNA upstream 111588 25913255 ~ 25917071 (+) False XLOC_033724
TCONS_00065975 lncRNA upstream 169192 25858383 ~ 25859467 (+) False XLOC_033723
TCONS_00068848 lncRNA upstream 287729 25737529 ~ 25740930 (+) True XLOC_033721
TCONS_00068847 lncRNA upstream 467467 25557629 ~ 25561192 (+) True XLOC_033719
TCONS_00068849 lncRNA downstream 31946 26060719 ~ 26061569 (+) True XLOC_033730
TCONS_00065990 lncRNA downstream 35962 26064735 ~ 26068968 (+) False XLOC_033731
TCONS_00065991 lncRNA downstream 36445 26065218 ~ 26080014 (+) True XLOC_033731
TCONS_00065995 lncRNA downstream 79703 26108476 ~ 26110054 (+) True XLOC_033734
TCONS_00068850 lncRNA downstream 170641 26199414 ~ 26213850 (+) True XLOC_033739
TCONS_00065984 mRNA upstream 2121 26006819 ~ 26026538 (+) True XLOC_033726
TCONS_00065981 mRNA upstream 22968 25920792 ~ 26005691 (+) False XLOC_033725
TCONS_00065977 mRNA upstream 110378 25913225 ~ 25918281 (+) False XLOC_033724
TCONS_00065980 mRNA upstream 111269 25915089 ~ 25917390 (+) True XLOC_033724
TCONS_00065974 mRNA upstream 150099 25858380 ~ 25878560 (+) False XLOC_033723
TCONS_00065986 mRNA downstream 899 26029672 ~ 26047946 (+) True XLOC_033728
TCONS_00065987 mRNA downstream 21045 26049818 ~ 26057520 (+) True XLOC_033729
TCONS_00065988 mRNA downstream 29999 26058772 ~ 26060908 (+) False XLOC_033730
TCONS_00065989 mRNA downstream 29999 26058772 ~ 26061610 (+) False XLOC_033730
TCONS_00065994 mRNA downstream 71251 26100024 ~ 26110819 (+) False XLOC_033734
TCONS_00065983 other upstream 43820 25973649 ~ 25984839 (+) True XLOC_033725
TCONS_00065979 other upstream 111588 25913258 ~ 25917071 (+) False XLOC_033724
TCONS_00065972 other upstream 319126 25702443 ~ 25709533 (+) True XLOC_033720
TCONS_00065960 other upstream 982238 25046348 ~ 25046421 (+) True XLOC_033712
TCONS_00065959 other upstream 982451 25046139 ~ 25046208 (+) False XLOC_033712
TCONS_00065992 other downstream 42101 26070874 ~ 26071007 (+) True XLOC_033732
TCONS_00065993 other downstream 42653 26071426 ~ 26071508 (+) True XLOC_033733
TCONS_00065996 other downstream 91858 26120631 ~ 26120736 (+) True XLOC_033735
TCONS_00066028 other downstream 859637 26888410 ~ 26892142 (+) True XLOC_033754
TCONS_00066032 other downstream 1012591 27041364 ~ 27044003 (+) False XLOC_033756