RNA id: TCONS_00065993


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00065993
length 83
RNA type miRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_033733
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 26071426 ~ 26071508 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCTGACAGAAGCAGCACATCAATATTGGCAGCTGCCCTCTCTCTGGGTTGCCAGTATGGTTTGTGCTGCTCCCGTCAGACA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116930

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065990 lncRNA upstream 2458 26064735 ~ 26068968 (+) False XLOC_033731
TCONS_00068849 lncRNA upstream 9857 26060719 ~ 26061569 (+) True XLOC_033730
TCONS_00065982 lncRNA upstream 96921 25920800 ~ 25974505 (+) False XLOC_033725
TCONS_00065978 lncRNA upstream 154355 25913255 ~ 25917071 (+) False XLOC_033724
TCONS_00065975 lncRNA upstream 211959 25858383 ~ 25859467 (+) False XLOC_033723
TCONS_00065995 lncRNA downstream 36968 26108476 ~ 26110054 (+) True XLOC_033734
TCONS_00068850 lncRNA downstream 127906 26199414 ~ 26213850 (+) True XLOC_033739
TCONS_00068851 lncRNA downstream 214147 26285655 ~ 26290469 (+) True XLOC_033741
TCONS_00068574 lncRNA downstream 224769 26296277 ~ 26296512 (+) True XLOC_033742
TCONS_00068852 lncRNA downstream 316921 26388429 ~ 26394383 (+) True XLOC_033744
TCONS_00065989 mRNA upstream 9816 26058772 ~ 26061610 (+) False XLOC_033730
TCONS_00065988 mRNA upstream 10518 26058772 ~ 26060908 (+) False XLOC_033730
TCONS_00065987 mRNA upstream 13906 26049818 ~ 26057520 (+) True XLOC_033729
TCONS_00065986 mRNA upstream 23480 26029672 ~ 26047946 (+) True XLOC_033728
TCONS_00065984 mRNA upstream 44888 26006819 ~ 26026538 (+) True XLOC_033726
TCONS_00065994 mRNA downstream 28516 26100024 ~ 26110819 (+) False XLOC_033734
TCONS_00065997 mRNA downstream 61157 26132665 ~ 26150270 (+) False XLOC_033736
TCONS_00065999 mRNA downstream 66732 26138240 ~ 26141319 (+) False XLOC_033736
TCONS_00065998 mRNA downstream 66732 26138240 ~ 26141319 (+) True XLOC_033736
TCONS_00066000 mRNA downstream 95912 26167420 ~ 26171550 (+) True XLOC_033737
TCONS_00065992 other upstream 419 26070874 ~ 26071007 (+) True XLOC_033732
TCONS_00065985 other upstream 42653 26028659 ~ 26028773 (+) True XLOC_033727
TCONS_00065983 other upstream 86587 25973649 ~ 25984839 (+) True XLOC_033725
TCONS_00065979 other upstream 154355 25913258 ~ 25917071 (+) False XLOC_033724
TCONS_00065972 other upstream 361893 25702443 ~ 25709533 (+) True XLOC_033720
TCONS_00065996 other downstream 49123 26120631 ~ 26120736 (+) True XLOC_033735
TCONS_00066028 other downstream 816902 26888410 ~ 26892142 (+) True XLOC_033754
TCONS_00066032 other downstream 969856 27041364 ~ 27044003 (+) False XLOC_033756
TCONS_00066034 other downstream 972207 27043715 ~ 27043842 (+) True XLOC_033757
TCONS_00066036 other downstream 987886 27059394 ~ 27136646 (+) False XLOC_033759