RNA id: TCONS_00067355



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00067355
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_034594
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 16841999 ~ 16842116 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CGCCACAGCCACATCACCATGCAGCCCAAGAGctgttactcactgaagctatgcatagctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacattggtaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117800

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00069167 lncRNA downstream 492910 16347500 ~ 16349089 (-) False XLOC_034591
TCONS_00068672 lncRNA downstream 618895 16222045 ~ 16223104 (-) True XLOC_034589
TCONS_00068671 lncRNA downstream 667670 16172570 ~ 16174329 (-) True XLOC_034584
TCONS_00067336 lncRNA downstream 692732 16075216 ~ 16149267 (-) False XLOC_034582
TCONS_00069168 lncRNA upstream 380421 17222537 ~ 17255612 (-) False XLOC_034596
TCONS_00069169 lncRNA upstream 409086 17251202 ~ 17255611 (-) False XLOC_034596
TCONS_00067366 lncRNA upstream 515968 17358084 ~ 17380310 (-) True XLOC_034601
TCONS_00068673 lncRNA upstream 733675 17575791 ~ 17576097 (-) True XLOC_034605
TCONS_00067389 lncRNA upstream 853110 17695226 ~ 17708630 (-) True XLOC_034612
TCONS_00067351 mRNA downstream 243787 16576246 ~ 16598212 (-) False XLOC_034593
TCONS_00067354 mRNA downstream 244869 16593110 ~ 16597130 (-) True XLOC_034593
TCONS_00067353 mRNA downstream 245061 16593031 ~ 16596938 (-) False XLOC_034593
TCONS_00067352 mRNA downstream 259812 16576971 ~ 16582187 (-) False XLOC_034593
TCONS_00067349 mRNA downstream 279797 16548890 ~ 16562202 (-) False XLOC_034592
TCONS_00067356 mRNA upstream 182486 17024602 ~ 17028015 (-) True XLOC_034595
TCONS_00067357 mRNA upstream 411033 17253149 ~ 17258812 (-) False XLOC_034596
TCONS_00067358 mRNA upstream 414572 17256688 ~ 17258635 (-) False XLOC_034596
TCONS_00067359 mRNA upstream 415206 17257322 ~ 17258766 (-) True XLOC_034596
TCONS_00067361 mRNA upstream 424788 17266904 ~ 17268111 (-) False XLOC_034598
TCONS_00067347 other downstream 492567 16348739 ~ 16349432 (-) True XLOC_034591
TCONS_00067339 other downstream 660407 16176847 ~ 16181592 (-) True XLOC_034585
TCONS_00067338 other downstream 727571 16114300 ~ 16114428 (-) True XLOC_034583
TCONS_00067317 other downstream 2391379 14450524 ~ 14450620 (-) True XLOC_034571
TCONS_00067316 other downstream 2446642 14394515 ~ 14395357 (-) True XLOC_034570
TCONS_00067360 other upstream 419500 17261616 ~ 17264309 (-) True XLOC_034597
TCONS_00067372 other upstream 573272 17415388 ~ 17416092 (-) False XLOC_034602
TCONS_00067385 other upstream 799072 17641188 ~ 17645750 (-) True XLOC_034610
TCONS_00067399 other upstream 1020309 17862425 ~ 17862540 (-) True XLOC_034615
TCONS_00067401 other upstream 1404921 18247037 ~ 18247691 (-) True XLOC_034617