RNA id: TCONS_00069656



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00069656
length 126
RNA type rRNA
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_035511
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 14415698 ~ 14415823 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTTTGTTATACACTTGCATTAAACTACAAATTGACCGAATTAAGATTGCCACTGAAGCTAatcagggctgtgcccggtcagtacctggatgggaaaccacatgggaaagctaggttgttgccaGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121368

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072164 lncRNA upstream 169345 14241585 ~ 14246353 (+) True XLOC_035509
TCONS_00069651 lncRNA upstream 395559 13971417 ~ 14020139 (+) True XLOC_035505
TCONS_00072163 lncRNA upstream 408891 14002077 ~ 14006807 (+) True XLOC_035506
TCONS_00069650 lncRNA upstream 423757 13971417 ~ 13991941 (+) False XLOC_035505
TCONS_00069649 lncRNA upstream 435055 13971417 ~ 13980643 (+) False XLOC_035505
TCONS_00072165 lncRNA downstream 142822 14558645 ~ 14561430 (+) True XLOC_035512
TCONS_00071920 lncRNA downstream 197163 14612986 ~ 14652650 (+) True XLOC_035513
TCONS_00072166 lncRNA downstream 653877 15069700 ~ 15080573 (+) False XLOC_035519
TCONS_00069673 lncRNA downstream 829285 15245108 ~ 15249624 (+) True XLOC_035520
TCONS_00069680 lncRNA downstream 1060802 15476625 ~ 15479807 (+) True XLOC_035525
TCONS_00069653 mRNA upstream 245122 14158021 ~ 14170576 (+) False XLOC_035508
TCONS_00069652 mRNA upstream 355454 14058646 ~ 14060244 (+) True XLOC_035507
TCONS_00069646 mRNA upstream 459826 13849999 ~ 13955872 (+) False XLOC_035504
TCONS_00069645 mRNA upstream 627387 13769514 ~ 13788311 (+) True XLOC_035501
TCONS_00069644 mRNA upstream 628389 13700605 ~ 13787309 (+) False XLOC_035501
TCONS_00069657 mRNA downstream 294719 14710542 ~ 14782287 (+) False XLOC_035514
TCONS_00069658 mRNA downstream 362469 14778292 ~ 14828450 (+) False XLOC_035514
TCONS_00069659 mRNA downstream 377007 14792830 ~ 14818777 (+) True XLOC_035514
TCONS_00069661 mRNA downstream 439648 14855471 ~ 14883692 (+) True XLOC_035516
TCONS_00069662 mRNA downstream 470629 14886452 ~ 14910223 (+) False XLOC_035517
TCONS_00069654 other upstream 245126 14169903 ~ 14170572 (+) True XLOC_035508
TCONS_00069647 other upstream 471557 13888818 ~ 13944141 (+) False XLOC_035504
TCONS_00069632 other upstream 1262120 13143165 ~ 13153578 (+) True XLOC_035494
TCONS_00069614 other upstream 2555554 11860028 ~ 11860144 (+) True XLOC_035486
TCONS_00069612 other upstream 2700416 11687257 ~ 11715282 (+) False XLOC_035484
TCONS_00069660 other downstream 390351 14806174 ~ 14806290 (+) True XLOC_035515
TCONS_00069670 other downstream 653877 15069700 ~ 15078299 (+) False XLOC_035519
TCONS_00069671 other downstream 662297 15078120 ~ 15080573 (+) True XLOC_035519
TCONS_00069676 other downstream 838782 15254605 ~ 15259417 (+) True XLOC_035522
TCONS_00069678 other downstream 854040 15269863 ~ 15275437 (+) True XLOC_035523

Expression Profile


//