RNA id: TCONS_00070587


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00070587
length 79
RNA type miRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_036064
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 53023539 ~ 53023617 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTGGTGAACATTCAACGCTGTCGGTGAGTTTTGCGCTTCTGTAACAAACCATCGACCGTTGACTGTACCCTGAGGGTGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118297

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072312 lncRNA upstream 4059 53018176 ~ 53019480 (+) True XLOC_036063
TCONS_00072311 lncRNA upstream 5982 53017077 ~ 53017557 (+) True XLOC_036062
TCONS_00072308 lncRNA upstream 135856 52879951 ~ 52887683 (+) False XLOC_036060
TCONS_00072309 lncRNA upstream 135856 52880079 ~ 52887683 (+) True XLOC_036060
TCONS_00072307 lncRNA upstream 141847 52879425 ~ 52881692 (+) False XLOC_036060
TCONS_00071974 lncRNA downstream 71387 53095004 ~ 53095533 (+) True XLOC_036068
TCONS_00070593 lncRNA downstream 96662 53120279 ~ 53124426 (+) True XLOC_036069
TCONS_00072313 lncRNA downstream 119594 53143211 ~ 53151885 (+) False XLOC_036070
TCONS_00070595 lncRNA downstream 180400 53204017 ~ 53206703 (+) False XLOC_036071
TCONS_00070597 lncRNA downstream 190637 53214254 ~ 53221239 (+) False XLOC_036071
TCONS_00070586 mRNA upstream 197358 52788997 ~ 52826181 (+) True XLOC_036059
TCONS_00070585 mRNA upstream 307223 52701811 ~ 52716316 (+) True XLOC_036057
TCONS_00070584 mRNA upstream 375749 52642869 ~ 52647790 (+) False XLOC_036055
TCONS_00070583 mRNA upstream 375749 52642869 ~ 52647790 (+) True XLOC_036055
TCONS_00070582 mRNA upstream 375836 52637507 ~ 52647703 (+) False XLOC_036055
TCONS_00070589 mRNA downstream 28084 53051701 ~ 53062017 (+) True XLOC_036066
TCONS_00070590 mRNA downstream 41303 53064920 ~ 53069540 (+) True XLOC_036067
TCONS_00070591 mRNA downstream 56898 53080515 ~ 53096754 (+) False XLOC_036068
TCONS_00070592 mRNA downstream 96661 53120278 ~ 53142068 (+) False XLOC_036069
TCONS_00070594 mRNA downstream 119594 53143211 ~ 53152093 (+) True XLOC_036070
TCONS_00070576 other upstream 480147 52530937 ~ 52543392 (+) False XLOC_036052
TCONS_00070562 other upstream 860575 52161861 ~ 52162964 (+) True XLOC_036043
TCONS_00070552 other upstream 2055540 50966806 ~ 50967999 (+) True XLOC_036035
TCONS_00070536 other upstream 3204668 49801662 ~ 49818871 (+) True XLOC_036021
TCONS_00070526 other upstream 3643236 49378890 ~ 49380303 (+) True XLOC_036016
TCONS_00070588 other downstream 62 53023679 ~ 53023764 (+) True XLOC_036065
TCONS_00070598 other downstream 222025 53245642 ~ 53255762 (+) True XLOC_036071
TCONS_00070607 other downstream 472584 53496201 ~ 53498302 (+) True XLOC_036078