RNA id: TCONS_00072544


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00072544
length 10572
lncRNA type antisense_over
GC content 0.33
exon number 4
gene id XLOC_036796
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 52297701 ~ 52310627 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072542 lncRNA downstream 309354 51986810 ~ 51988347 (-) True XLOC_036793
TCONS_00071822 lncRNA downstream 790624 51471902 ~ 51507077 (-) True XLOC_036786
TCONS_00071813 lncRNA downstream 948590 51345350 ~ 51349111 (-) True XLOC_036783
TCONS_00071810 lncRNA downstream 978202 51314085 ~ 51319499 (-) True XLOC_036782
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TCONS_00072554 lncRNA upstream 91144 52401657 ~ 52404388 (-) False XLOC_036797
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TCONS_00072556 lncRNA upstream 91144 52401657 ~ 52405146 (-) False XLOC_036797
TCONS_00072558 lncRNA upstream 93536 52404049 ~ 52404917 (-) True XLOC_036797
TCONS_00071839 mRNA downstream 67586 52107917 ~ 52230115 (-) False XLOC_036795
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TCONS_00071818 other downstream 790522 51434496 ~ 51507179 (-) False XLOC_036786
TCONS_00071804 other downstream 1269748 51027839 ~ 51027953 (-) True XLOC_036779
TCONS_00071797 other downstream 1779798 50517782 ~ 50517903 (-) True XLOC_036773
TCONS_00071775 other downstream 2541802 49746232 ~ 49755899 (-) False XLOC_036760
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TCONS_00071865 other upstream 1046266 53356779 ~ 53356896 (-) True XLOC_036812

Expression Profile

//