RNA id: TCONS_00071804



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00071804
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_036779
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 51027839 ~ 51027953 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCGGCAGCTAGCTCACTGCAAATcacacatggtcgcccactgaagctaagcagggctgcgcctggtcagcaCCTGGATGGGAGTCCtcatggaaaagctaggttgctcccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186589

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072089 lncRNA downstream 73595 50953658 ~ 50954244 (-) True XLOC_036777
TCONS_00071800 lncRNA downstream 129482 50889589 ~ 50898357 (-) True XLOC_036776
TCONS_00072541 lncRNA downstream 515952 50508761 ~ 50511887 (-) True XLOC_036772
TCONS_00071793 lncRNA downstream 768485 50258022 ~ 50259354 (-) True XLOC_036768
TCONS_00072540 lncRNA downstream 887856 50137475 ~ 50139983 (-) True XLOC_036766
TCONS_00072090 lncRNA upstream 184460 51212413 ~ 51212668 (-) True XLOC_036781
TCONS_00071809 lncRNA upstream 281058 51309011 ~ 51314431 (-) False XLOC_036782
TCONS_00071810 lncRNA upstream 286132 51314085 ~ 51319499 (-) True XLOC_036782
TCONS_00071813 lncRNA upstream 317397 51345350 ~ 51349111 (-) True XLOC_036783
TCONS_00071822 lncRNA upstream 443949 51471902 ~ 51507077 (-) True XLOC_036786
TCONS_00071801 mRNA downstream 46664 50968990 ~ 50981175 (-) False XLOC_036778
TCONS_00071803 mRNA downstream 48776 50969448 ~ 50979063 (-) True XLOC_036778
TCONS_00071802 mRNA downstream 48792 50969448 ~ 50979047 (-) False XLOC_036778
TCONS_00071799 mRNA downstream 139033 50840565 ~ 50888806 (-) True XLOC_036775
TCONS_00071798 mRNA downstream 502479 50520139 ~ 50525360 (-) True XLOC_036774
TCONS_00071805 mRNA upstream 137439 51165392 ~ 51293265 (-) False XLOC_036780
TCONS_00071806 mRNA upstream 138027 51165980 ~ 51293301 (-) True XLOC_036780
TCONS_00071807 mRNA upstream 276146 51304099 ~ 51340931 (-) False XLOC_036782
TCONS_00071808 mRNA upstream 280376 51308329 ~ 51340773 (-) False XLOC_036782
TCONS_00071811 mRNA upstream 313659 51341612 ~ 51349431 (-) False XLOC_036783
TCONS_00071797 other downstream 509936 50517782 ~ 50517903 (-) True XLOC_036773
TCONS_00071775 other downstream 1271940 49746232 ~ 49755899 (-) False XLOC_036760
TCONS_00071744 other downstream 1855339 49169768 ~ 49172500 (-) False XLOC_036747
TCONS_00071743 other downstream 1875364 49149904 ~ 49152475 (-) True XLOC_036746
TCONS_00071741 other downstream 2237252 48778961 ~ 48790587 (-) True XLOC_036742
TCONS_00071818 other upstream 406543 51434496 ~ 51507179 (-) False XLOC_036786
TCONS_00071865 other upstream 2328826 53356779 ~ 53356896 (-) True XLOC_036812