RNA id: TCONS_00007206



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00007206
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.61
exon number 1
gene id XLOC_003733
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 44335666 ~ 44335780 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCAGCAGCTCGCTCTCctcaactctcacatggtcgcccactgaaggtAAGCAGGGTTGAGCCGGGTCAGTGTCTGGATGGGAGAGCACAGGGGAACACTCGGctgctgttggca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184098

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008432 lncRNA upstream 344 44324761 ~ 44335322 (+) False XLOC_003732
TCONS_00008431 lncRNA upstream 344 44324761 ~ 44335322 (+) False XLOC_003732
TCONS_00008701 lncRNA upstream 17532 44317203 ~ 44318134 (+) False XLOC_003731
TCONS_00008702 lncRNA upstream 17532 44317208 ~ 44318134 (+) True XLOC_003731
TCONS_00008700 lncRNA upstream 21256 44311334 ~ 44314410 (+) True XLOC_003730
TCONS_00008703 lncRNA downstream 33347 44369127 ~ 44375182 (+) True XLOC_003735
TCONS_00008433 lncRNA downstream 49144 44384924 ~ 44386217 (+) False XLOC_003736
TCONS_00008704 lncRNA downstream 50018 44385798 ~ 44391541 (+) True XLOC_003736
TCONS_00008705 lncRNA downstream 58555 44394335 ~ 44399370 (+) False XLOC_003737
TCONS_00008434 lncRNA downstream 59637 44395417 ~ 44396163 (+) True XLOC_003737
TCONS_00007202 mRNA upstream 26634 44300548 ~ 44309032 (+) False XLOC_003729
TCONS_00007199 mRNA upstream 197395 44135351 ~ 44138271 (+) True XLOC_003726
TCONS_00007197 mRNA upstream 548513 43751263 ~ 43787153 (+) True XLOC_003721
TCONS_00007196 mRNA upstream 591964 43740949 ~ 43743702 (+) True XLOC_003720
TCONS_00007195 mRNA upstream 621916 43661735 ~ 43713750 (+) True XLOC_003719
TCONS_00007207 mRNA downstream 20724 44356504 ~ 44363031 (+) False XLOC_003734
TCONS_00007208 mRNA downstream 20927 44356707 ~ 44363032 (+) True XLOC_003734
TCONS_00007209 mRNA downstream 166630 44502410 ~ 44515880 (+) False XLOC_003739
TCONS_00007210 mRNA downstream 167994 44503774 ~ 44524932 (+) True XLOC_003739
TCONS_00007213 mRNA downstream 212429 44548209 ~ 44603789 (+) False XLOC_003741
TCONS_00007205 other upstream 344 44328774 ~ 44335322 (+) True XLOC_003732
TCONS_00007204 other upstream 755 44324761 ~ 44334911 (+) False XLOC_003732
TCONS_00007203 other upstream 9374 44324761 ~ 44326292 (+) False XLOC_003732
TCONS_00007198 other upstream 310788 44024762 ~ 44024878 (+) True XLOC_003725
TCONS_00007182 other upstream 1290717 43044826 ~ 43044949 (+) True XLOC_003709
TCONS_00007223 other downstream 515694 44851474 ~ 44851593 (+) True XLOC_003747
TCONS_00007247 other downstream 1052418 45388198 ~ 45393530 (+) False XLOC_003764
TCONS_00007249 other downstream 1052430 45388210 ~ 45392663 (+) False XLOC_003764
TCONS_00007251 other downstream 1056431 45392211 ~ 45394780 (+) False XLOC_003764

Expression Profile


//